14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4155 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_4155  hypothetical protein  100 
 
 
168 aa  318  1.9999999999999998e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000191684  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1315  hypothetical protein  34.98 
 
 
213 aa  67  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2226  hypothetical protein  46.81 
 
 
222 aa  65.1  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1227  hypothetical protein  40.18 
 
 
261 aa  54.7  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.441921  normal  0.0824427 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1402  hypothetical protein  37.62 
 
 
268 aa  47  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000273335 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27660  hypothetical protein  40.43 
 
 
243 aa  46.2  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1444  hypothetical protein  35.35 
 
 
278 aa  45.1  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.731728 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1129  hypothetical protein  32.63 
 
 
235 aa  44.7  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.285237  normal  0.291752 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1620  hypothetical protein  37.84 
 
 
250 aa  44.3  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.239662  normal  0.0508551 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3984  hypothetical protein  37.5 
 
 
236 aa  44.3  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00116122  normal  0.0164615 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1485  hypothetical protein  40.21 
 
 
267 aa  43.9  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12741  hypothetical protein  38.71 
 
 
231 aa  42  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.39574 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1235  hypothetical protein  37.62 
 
 
236 aa  42  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.518209  normal  0.0783886 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3909  hypothetical protein  40 
 
 
237 aa  41.2  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>