More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1217 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_1217  hydrogenase, NADP-reducing subunit C  100 
 
 
588 aa  1221    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.180172 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2724  NAD-reducing hydrogenase, alpha subunit  50.09 
 
 
610 aa  593  1e-168  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000462044  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1462  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  48.88 
 
 
627 aa  575  1.0000000000000001e-163  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.185641 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0979  NADH dehydrogenase  47.93 
 
 
632 aa  574  1.0000000000000001e-162  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1670  hydrogen dehydrogenase  49.73 
 
 
598 aa  571  1e-161  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3858  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  48.61 
 
 
603 aa  566  1e-160  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0528  putative NADH dehydrogenase subunit  47.16 
 
 
610 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.704697  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2247  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  48.27 
 
 
627 aa  538  9.999999999999999e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.179824  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2751  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  42.29 
 
 
603 aa  479  1e-134  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4116  hydrogen dehydrogenase  39.79 
 
 
603 aa  444  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.502813  normal  0.19956 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1522  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  38.24 
 
 
602 aa  424  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000148322  hitchhiker  0.000569435 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0993  NADH dehydrogenase (quinone)  37.23 
 
 
610 aa  321  3e-86  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0913  NADH dehydrogenase (quinone)  39.6 
 
 
607 aa  318  2e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0935  NADH dehydrogenase (quinone)  39.6 
 
 
607 aa  318  2e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0720  NADH dehydrogenase (quinone)  41.84 
 
 
545 aa  318  2e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00999729  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3600  NADH dehydrogenase (quinone)  35.11 
 
 
614 aa  316  6e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0696  NADH dehydrogenase (quinone)  41.58 
 
 
545 aa  316  7e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000417436  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1828  NADH dehydrogenase (quinone)  41.64 
 
 
407 aa  313  4.999999999999999e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0173  NADH dehydrogenase (quinone)  36.61 
 
 
597 aa  311  2e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0624  NADH dehydrogenase (quinone)  35.11 
 
 
614 aa  307  3e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000168904  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1018  NADH dehydrogenase (quinone)  40.58 
 
 
407 aa  304  3.0000000000000004e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1170  NADH dehydrogenase (quinone)  34.53 
 
 
602 aa  303  7.000000000000001e-81  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1024  NADH dehydrogenase (quinone)  38.73 
 
 
407 aa  303  8.000000000000001e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0919  NADH dehydrogenase (quinone)  37.09 
 
 
596 aa  302  1e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1686  NADH dehydrogenase (quinone)  40.21 
 
 
545 aa  300  6e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1397  NADH dehydrogenase (quinone)  39.11 
 
 
597 aa  299  9e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0209404  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0991  NADH dehydrogenase (quinone)  39.64 
 
 
539 aa  297  3e-79  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2708  NADH dehydrogenase I, F subunit  38.66 
 
 
488 aa  296  9e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0149  NADH dehydrogenase (quinone)  37.15 
 
 
596 aa  295  1e-78  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0157  NADH dehydrogenase (quinone)  35.66 
 
 
626 aa  295  2e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1338  NADH dehydrogenase (quinone)  35.33 
 
 
572 aa  295  2e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1168  NADH dehydrogenase (quinone)  38.28 
 
 
538 aa  295  2e-78  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.073062  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4654  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  38.71 
 
 
535 aa  292  1e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1634  NADP-reducing hydrogenase chain C  38.14 
 
 
486 aa  290  7e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000096005  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1844  NADP-reducing hydrogenase chain C  38.14 
 
 
486 aa  290  7e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1604  NADP-reducing hydrogenase chain C  37.89 
 
 
486 aa  287  4e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0472  NADH dehydrogenase (quinone)  39.26 
 
 
594 aa  286  5.999999999999999e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.524488  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0807  NADH dehydrogenase (quinone)  40.21 
 
 
404 aa  285  1.0000000000000001e-75  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0099  NADH dehydrogenase (quinone)  33.8 
 
 
597 aa  285  1.0000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.953797  hitchhiker  0.000000556523 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0279  NADH dehydrogenase (quinone)  38.07 
 
 
534 aa  286  1.0000000000000001e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1278  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  39.43 
 
 
444 aa  285  1.0000000000000001e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.327335  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0784  NADH dehydrogenase (quinone)  38.96 
 
 
408 aa  285  2.0000000000000002e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2282  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  38.98 
 
 
436 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.502286  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0216  NADH dehydrogenase (quinone)  38.73 
 
 
425 aa  285  2.0000000000000002e-75  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2057  NADH dehydrogenase I chain F  39.57 
 
 
431 aa  284  3.0000000000000004e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.728933  normal  0.0269366 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0932  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  39.78 
 
 
431 aa  284  3.0000000000000004e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.5981  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1248  NADH dehydrogenase (quinone)  38.98 
 
 
604 aa  284  3.0000000000000004e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.600832  normal  0.0289049 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5572  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  38.71 
 
 
436 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.294569  normal  0.298665 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2161  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  38.71 
 
 
440 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.615795  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2268  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  38.71 
 
 
436 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.121706  normal  0.072136 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0559  NADH dehydrogenase (quinone)  39.37 
 
 
624 aa  283  6.000000000000001e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.382532  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1872  NADH-quinone oxidoreductase F subunit  38.8 
 
 
438 aa  283  6.000000000000001e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.901047  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1241  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  38.01 
 
 
456 aa  283  6.000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1632  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  38.44 
 
 
436 aa  283  8.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2244  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  38.44 
 
 
436 aa  283  8.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1440  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  38.44 
 
 
436 aa  282  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0584655  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2209  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  39.41 
 
 
431 aa  282  1e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.377911 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1066  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  38.17 
 
 
436 aa  282  1e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0842517  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1086  NADH dehydrogenase (quinone)  37.82 
 
 
526 aa  282  1e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1304  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  38.44 
 
 
436 aa  282  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3480  NADH dehydrogenase (quinone)  38.68 
 
 
520 aa  282  1e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.3807  normal  0.394192 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1886  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  39.41 
 
 
431 aa  282  2e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.415851  normal  0.35892 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3804  NADH dehydrogenase (quinone)  35.34 
 
 
595 aa  281  2e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2160  NADH dehydrogenase (quinone)  38.48 
 
 
562 aa  281  3e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0757022  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1887  NADH dehydrogenase (quinone)  35.31 
 
 
592 aa  281  3e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2559  NADH dehydrogenase (quinone)  39.47 
 
 
500 aa  281  3e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.126954  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4098  NADH dehydrogenase I chain F  38.16 
 
 
518 aa  280  4e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0822  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  38.8 
 
 
426 aa  280  4e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.76792  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3830  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  33.98 
 
 
677 aa  280  5e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0732  NADH dehydrogenase I, F subunit  38.17 
 
 
436 aa  280  6e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.411097  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1824  NADH dehydrogenase I, F subunit  38.17 
 
 
436 aa  280  6e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0418  NADH dehydrogenase I, F subunit  38.17 
 
 
436 aa  280  6e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0341  NADH dehydrogenase (quinone)  34.71 
 
 
597 aa  280  6e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.024737  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1135  NADH dehydrogenase I, F subunit  38.17 
 
 
436 aa  280  6e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.305748  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1274  NADH dehydrogenase (quinone)  38.32 
 
 
562 aa  280  7e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.651709 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3350  NADH dehydrogenase I, F subunit  39.43 
 
 
591 aa  279  8e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.50901  normal  0.051471 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2808  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  39.15 
 
 
452 aa  279  8e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.318521 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2004  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  38.54 
 
 
442 aa  279  9e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462519  normal  0.256027 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1857  NADH dehydrogenase (quinone)  34.89 
 
 
600 aa  279  1e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4083  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  37.75 
 
 
446 aa  279  1e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.323862  normal  0.192714 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2099  NADH dehydrogenase (quinone)  38.56 
 
 
634 aa  278  1e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0860011  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0225  NADH dehydrogenase (quinone)  39.22 
 
 
417 aa  279  1e-73  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1295  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  38.17 
 
 
436 aa  278  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0332  NADH dehydrogenase (quinone)  37.96 
 
 
629 aa  278  2e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3251  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  37.56 
 
 
467 aa  278  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.915632  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0914  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  38.48 
 
 
446 aa  278  2e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1348  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  38.54 
 
 
442 aa  278  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.020872  hitchhiker  0.00762126 
 
 
-
 
NC_002936  DET0146  [Fe] hydrogenase, HymB subunit, putative  38.9 
 
 
417 aa  278  3e-73  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.28536  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0914  NADH:ubiquinone oxidoreductase, NADH-binding (51 kD) subunit  38.79 
 
 
571 aa  277  3e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2056  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  39.41 
 
 
441 aa  277  3e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3209  putative NADH dehydrogenase I (chain F), NuoF  38.81 
 
 
442 aa  278  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.489699  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_154  [Fe] hydrogenase, HymB subunit  38.96 
 
 
417 aa  278  3e-73  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1517  NADH dehydrogenase (quinone)  40.11 
 
 
427 aa  277  4e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2704  NADH dehydrogenase (quinone)  34.06 
 
 
603 aa  277  4e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.910602  normal  0.0334637 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2713  NADH dehydrogenase (quinone)  37.67 
 
 
552 aa  277  4e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4077  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  38.79 
 
 
454 aa  277  5e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856999  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0657  NADH dehydrogenase (quinone)  37.93 
 
 
590 aa  276  5e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.210561  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06320  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 51 kDa subunit  34.63 
 
 
594 aa  276  6e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000903471  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0491  NADH dehydrogenase (quinone)  34.72 
 
 
623 aa  276  6e-73  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0845  NADH dehydrogenase (quinone)  36.27 
 
 
572 aa  276  6e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>