More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3858 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2724  NAD-reducing hydrogenase, alpha subunit  54.52 
 
 		 610 aa  655    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000462044  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0979  NADH dehydrogenase  60.48 
 
 		 632 aa  755    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1670  hydrogen dehydrogenase  58.88 
 
 		 598 aa  707    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1462  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  76.27 
 
 		 627 aa  925    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.185641 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3858  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  100 
 
 		 603 aa  1218    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0528  putative NADH dehydrogenase subunit  73.14 
 
 		 610 aa  862    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.704697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2247  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  61.43 
 
 		 627 aa  682    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.179824  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1217  hydrogenase, NADP-reducing subunit C  48.61 
 
 		 588 aa  566  1e-160  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.180172 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2751  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  44.76 
 
 		 603 aa  477  1e-133  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4116  hydrogen dehydrogenase  45.22 
 
 		 603 aa  473  1e-132  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.502813  normal  0.19956 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1522  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  42.25 
 
 		 602 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000148322  hitchhiker  0.000569435 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1397  NADH dehydrogenase (quinone)  37.28 
 
 		 597 aa  332  1e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0209404  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0935  NADH dehydrogenase (quinone)  37.83 
 
 		 607 aa  328  3e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0913  NADH dehydrogenase (quinone)  37.83 
 
 		 607 aa  328  3e-88  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1170  NADH dehydrogenase (quinone)  36.44 
 
 		 602 aa  326  7e-88  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0472  NADH dehydrogenase (quinone)  44.47 
 
 		 594 aa  320  6e-86  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.524488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4654  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  45.21 
 
 		 535 aa  320  7e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1338  NADH dehydrogenase (quinone)  43.16 
 
 		 572 aa  317  6e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0993  NADH dehydrogenase (quinone)  36.45 
 
 		 610 aa  316  8e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0720  NADH dehydrogenase (quinone)  42.26 
 
 		 545 aa  314  2.9999999999999996e-84  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00999729  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0173  NADH dehydrogenase (quinone)  36.34 
 
 		 597 aa  313  4.999999999999999e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0624  NADH dehydrogenase (quinone)  35.45 
 
 		 614 aa  313  5.999999999999999e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000168904  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0696  NADH dehydrogenase (quinone)  41.34 
 
 		 545 aa  313  6.999999999999999e-84  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000417436  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0919  NADH dehydrogenase (quinone)  38.04 
 
 		 596 aa  312  9e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1686  NADH dehydrogenase (quinone)  42.32 
 
 		 545 aa  312  1e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1274  NADH dehydrogenase (quinone)  41.76 
 
 		 562 aa  312  1e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.651709 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0657  NADH dehydrogenase (quinone)  36.87 
 
 		 590 aa  311  2.9999999999999997e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.210561  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0845  NADH dehydrogenase (quinone)  38.95 
 
 		 572 aa  311  2.9999999999999997e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0157  NADH dehydrogenase (quinone)  39.3 
 
 		 626 aa  310  6.999999999999999e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0098  NADH dehydrogenase (quinone)  36.02 
 
 		 535 aa  309  8e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2713  NADH dehydrogenase (quinone)  37.92 
 
 		 552 aa  309  8e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1018  NADH dehydrogenase (quinone)  40.52 
 
 		 407 aa  309  9e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0095  NADH dehydrogenase (quinone)  35.83 
 
 		 535 aa  307  4.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.693174 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0991  NADH dehydrogenase (quinone)  39.9 
 
 		 539 aa  306  8.000000000000001e-82  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0559  NADH dehydrogenase (quinone)  36.31 
 
 		 624 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.382532  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1024  NADH dehydrogenase (quinone)  38.6 
 
 		 407 aa  305  1.0000000000000001e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5175  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  42.66 
 
 		 452 aa  305  1.0000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.82972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2708  NADH dehydrogenase I, F subunit  43.36 
 
 		 488 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3600  NADH dehydrogenase (quinone)  34.18 
 
 		 614 aa  304  3.0000000000000004e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3251  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  41.01 
 
 		 467 aa  304  3.0000000000000004e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.915632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1872  NADH-quinone oxidoreductase F subunit  39.79 
 
 		 438 aa  301  2e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.901047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0914  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  41.53 
 
 		 446 aa  301  2e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0962  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  41.83 
 
 		 453 aa  301  2e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0089517 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2479  NADH dehydrogenase (quinone)  45.8 
 
 		 535 aa  301  3e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.858375  normal  0.575903 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1278  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  39.53 
 
 		 444 aa  300  4e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.327335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0279  NADH dehydrogenase (quinone)  43.06 
 
 		 534 aa  300  4e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0149  NADH dehydrogenase (quinone)  44.44 
 
 		 596 aa  300  4e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0877  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  41.61 
 
 		 453 aa  300  5e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2808  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  45.58 
 
 		 452 aa  300  5e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.318521 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1828  NADH dehydrogenase (quinone)  39.38 
 
 		 407 aa  298  2e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2160  NADH dehydrogenase (quinone)  35.39 
 
 		 562 aa  297  3e-79  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0757022  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4112  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  34.41 
 
 		 656 aa  298  3e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1248  NADH dehydrogenase (quinone)  40.64 
 
 		 604 aa  297  4e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.600832  normal  0.0289049 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2704  NADH dehydrogenase (quinone)  35.9 
 
 		 603 aa  297  5e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.910602  normal  0.0334637 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3505  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  44.42 
 
 		 446 aa  296  5e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1268  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  41.96 
 
 		 452 aa  296  5e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.262247  normal  0.27645 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0954  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  42.4 
 
 		 442 aa  295  1e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.613915 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6089  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  42.48 
 
 		 447 aa  295  1e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0248618 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0332  NADH dehydrogenase (quinone)  41.01 
 
 		 629 aa  295  1e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4077  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  39.81 
 
 		 454 aa  295  1e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0099  NADH dehydrogenase (quinone)  34.56 
 
 		 597 aa  295  1e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.953797  hitchhiker  0.000000556523 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4005  NADH dehydrogenase (quinone)  42.9 
 
 		 593 aa  295  1e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42089e-25 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0343  NADH dehydrogenase I, F subunit  42.4 
 
 		 591 aa  294  2e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2804  NADH dehydrogenase (quinone)  34.36 
 
 		 636 aa  295  2e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.260588 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3921  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  43.43 
 
 		 593 aa  295  2e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3350  NADH dehydrogenase I, F subunit  42.25 
 
 		 591 aa  294  4e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.50901  normal  0.051471 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1887  NADH dehydrogenase (quinone)  38.93 
 
 		 592 aa  294  4e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0491  NADH dehydrogenase (quinone)  36.25 
 
 		 623 aa  294  4e-78  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2625  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  40.96 
 
 		 427 aa  293  5e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2252  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  40.96 
 
 		 427 aa  293  5e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000522116 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1311  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  39.67 
 
 		 439 aa  293  5e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0991  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  43.19 
 
 		 425 aa  293  6e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.315379  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06320  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 51 kDa subunit  35.31 
 
 		 594 aa  293  6e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000903471  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3618  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  40.72 
 
 		 421 aa  293  8e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.997911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4166  NADH dehydrogenase (quinone)  41.71 
 
 		 530 aa  293  9e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0784  NADH dehydrogenase (quinone)  40.42 
 
 		 408 aa  292  9e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0926  NADH dehydrogenase I subunit F  43.22 
 
 		 431 aa  292  1e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0543  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  42.44 
 
 		 443 aa  292  1e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.315884  normal  0.338133 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1168  NADH dehydrogenase (quinone)  36.88 
 
 		 538 aa  292  1e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.073062  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0822  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  43.22 
 
 		 426 aa  291  2e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.76792  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4239  NADH dehydrogenase (quinone)  42.25 
 
 		 593 aa  292  2e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1450  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  34.36 
 
 		 636 aa  291  3e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.101445  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0272  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  42.89 
 
 		 434 aa  291  3e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4052  NADH dehydrogenase (quinone)  42.74 
 
 		 543 aa  290  4e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.166316 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0724  NADH dehydrogenase (quinone)  40.26 
 
 		 485 aa  290  5.0000000000000004e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0713  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  42.55 
 
 		 426 aa  290  6e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4199  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  40.31 
 
 		 441 aa  290  6e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1377  NADH dehydrogenase I chain F  40.72 
 
 		 448 aa  290  6e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0721979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4354  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  40.31 
 
 		 441 aa  290  7e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.168378  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1498  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  38.7 
 
 		 458 aa  290  7e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.275368  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4331  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  40.31 
 
 		 441 aa  290  7e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2057  NADH dehydrogenase I chain F  42.44 
 
 		 431 aa  289  8e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.728933  normal  0.0269366 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0109  NADH dehydrogenase (quinone)  41.09 
 
 		 656 aa  289  8e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0703  NADH dehydrogenase (quinone)  41.49 
 
 		 588 aa  289  9e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2831  NADH dehydrogenase I chain F  41.29 
 
 		 425 aa  289  9e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2700  NADH dehydrogenase I chain F  41.29 
 
 		 425 aa  289  9e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0807  NADH dehydrogenase (quinone)  40.32 
 
 		 404 aa  289  9e-77  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2056  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  42.06 
 
 		 441 aa  289  9e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2099  NADH dehydrogenase (quinone)  36.42 
 
 		 634 aa  289  1e-76  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0860011  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1886  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  42.39 
 
 		 431 aa  288  2e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.415851  normal  0.35892 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>