More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4116 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1522  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  71.24 
 
 		 602 aa  893    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000148322  hitchhiker  0.000569435 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4116  hydrogen dehydrogenase  100 
 
 		 603 aa  1226    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.502813  normal  0.19956 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2751  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  49.83 
 
 		 603 aa  529  1e-149  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3858  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  45.22 
 
 		 603 aa  473  1e-132  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2724  NAD-reducing hydrogenase, alpha subunit  44.39 
 
 		 610 aa  472  1.0000000000000001e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000462044  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0979  NADH dehydrogenase  43.24 
 
 		 632 aa  472  1.0000000000000001e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0528  putative NADH dehydrogenase subunit  43.95 
 
 		 610 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.704697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1462  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  43.46 
 
 		 627 aa  465  9.999999999999999e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.185641 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1670  hydrogen dehydrogenase  42.52 
 
 		 598 aa  457  1e-127  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1217  hydrogenase, NADP-reducing subunit C  39.79 
 
 		 588 aa  444  1e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.180172 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2247  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  43.71 
 
 		 627 aa  428  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.179824  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1170  NADH dehydrogenase (quinone)  38.25 
 
 		 602 aa  333  5e-90  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0919  NADH dehydrogenase (quinone)  40.23 
 
 		 596 aa  332  2e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0173  NADH dehydrogenase (quinone)  39.05 
 
 		 597 aa  324  3e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0993  NADH dehydrogenase (quinone)  38.09 
 
 		 610 aa  322  9.999999999999999e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0935  NADH dehydrogenase (quinone)  38.03 
 
 		 607 aa  322  1.9999999999999998e-86  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0913  NADH dehydrogenase (quinone)  38.03 
 
 		 607 aa  322  1.9999999999999998e-86  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0624  NADH dehydrogenase (quinone)  37.01 
 
 		 614 aa  316  7e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000168904  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1397  NADH dehydrogenase (quinone)  37.17 
 
 		 597 aa  316  9e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0209404  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4654  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  43.7 
 
 		 535 aa  315  1.9999999999999998e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06320  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 51 kDa subunit  36.78 
 
 		 594 aa  309  8e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000903471  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3600  NADH dehydrogenase (quinone)  41.04 
 
 		 614 aa  309  9e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0559  NADH dehydrogenase (quinone)  41.47 
 
 		 624 aa  306  7e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.382532  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1318  NADH dehydrogenase (quinone)  42.89 
 
 		 626 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1248  NADH dehydrogenase (quinone)  38.45 
 
 		 604 aa  303  4.0000000000000003e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.600832  normal  0.0289049 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0696  NADH dehydrogenase (quinone)  40.66 
 
 		 545 aa  303  5.000000000000001e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000417436  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1368  NADH dehydrogenase (quinone)  42.89 
 
 		 626 aa  303  5.000000000000001e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0720  NADH dehydrogenase (quinone)  40.66 
 
 		 545 aa  301  2e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00999729  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0472  NADH dehydrogenase (quinone)  39.5 
 
 		 594 aa  301  3e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.524488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1828  NADH dehydrogenase (quinone)  41.47 
 
 		 407 aa  301  3e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3804  NADH dehydrogenase (quinone)  34.2 
 
 		 595 aa  300  4e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2479  NADH dehydrogenase (quinone)  38.35 
 
 		 535 aa  300  5e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.858375  normal  0.575903 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1686  NADH dehydrogenase (quinone)  41.02 
 
 		 545 aa  300  6e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1274  NADH dehydrogenase (quinone)  35.45 
 
 		 562 aa  300  6e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.651709 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4052  NADH dehydrogenase (quinone)  37.86 
 
 		 543 aa  299  1e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.166316 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2708  NADH dehydrogenase I, F subunit  40.98 
 
 		 488 aa  299  1e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0279  NADH dehydrogenase (quinone)  42.78 
 
 		 534 aa  297  3e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0724  NADH dehydrogenase (quinone)  41.45 
 
 		 485 aa  297  3e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0149  NADH dehydrogenase (quinone)  35.2 
 
 		 596 aa  295  2e-78  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1338  NADH dehydrogenase (quinone)  36.02 
 
 		 572 aa  295  2e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2713  NADH dehydrogenase (quinone)  36.72 
 
 		 552 aa  294  3e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3516  NADH dehydrogenase (quinone)  42.71 
 
 		 488 aa  294  4e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0914  NADH:ubiquinone oxidoreductase, NADH-binding (51 kD) subunit  40.16 
 
 		 571 aa  293  6e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4166  NADH dehydrogenase (quinone)  36.65 
 
 		 530 aa  293  6e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1024  NADH dehydrogenase (quinone)  38.18 
 
 		 407 aa  293  6e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0095  NADH dehydrogenase (quinone)  37 
 
 		 535 aa  293  7e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.693174 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3350  NADH dehydrogenase I, F subunit  42.64 
 
 		 591 aa  293  8e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.50901  normal  0.051471 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0098  NADH dehydrogenase (quinone)  40.48 
 
 		 535 aa  292  1e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4005  NADH dehydrogenase (quinone)  38.84 
 
 		 593 aa  292  1e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42089e-25 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0657  NADH dehydrogenase (quinone)  38.81 
 
 		 590 aa  292  1e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.210561  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3542  NADH dehydrogenase (quinone)  38.43 
 
 		 537 aa  291  2e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0991  NADH dehydrogenase (quinone)  39.07 
 
 		 539 aa  291  2e-77  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0343  NADH dehydrogenase I, F subunit  42.13 
 
 		 591 aa  291  3e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3830  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  37.22 
 
 		 677 aa  291  3e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3921  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  38.85 
 
 		 593 aa  291  3e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4239  NADH dehydrogenase (quinone)  37.63 
 
 		 593 aa  290  4e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02970  NADH dehydrogenase I subunit F  41.58 
 
 		 408 aa  290  4e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1298  NADH dehydrogenase (quinone)  36.51 
 
 		 598 aa  290  5.0000000000000004e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3505  NADH dehydrogenase (quinone)  36.84 
 
 		 619 aa  290  7e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.960223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3291  NADH dehydrogenase (quinone)  34.96 
 
 		 575 aa  289  9e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0157  NADH dehydrogenase (quinone)  39.69 
 
 		 626 aa  289  1e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0784  NADH dehydrogenase (quinone)  39.18 
 
 		 408 aa  289  1e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1604  NADP-reducing hydrogenase chain C  38.82 
 
 		 486 aa  288  2e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1110  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  36.44 
 
 		 569 aa  288  2e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.163971 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1887  NADH dehydrogenase (quinone)  36.63 
 
 		 592 aa  288  2e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1365  NADH dehydrogenase (quinone)  37.89 
 
 		 532 aa  288  2e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.529964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1168  NADH dehydrogenase (quinone)  34.3 
 
 		 538 aa  288  2e-76  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.073062  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1634  NADP-reducing hydrogenase chain C  38.82 
 
 		 486 aa  286  5e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000096005  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1844  NADP-reducing hydrogenase chain C  38.82 
 
 		 486 aa  286  5e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4112  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  34.41 
 
 		 656 aa  287  5e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0341  NADH dehydrogenase (quinone)  37.45 
 
 		 597 aa  286  7e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.024737  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2804  NADH dehydrogenase (quinone)  32.62 
 
 		 636 aa  286  1.0000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.260588 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0491  NADH dehydrogenase (quinone)  41.04 
 
 		 623 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0845  NADH dehydrogenase (quinone)  43.5 
 
 		 572 aa  285  1.0000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01800  NADH dehydrogenase I subunit F  36.59 
 
 		 624 aa  285  2.0000000000000002e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.235185  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1018  NADH dehydrogenase (quinone)  39.95 
 
 		 407 aa  285  2.0000000000000002e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0332  NADH dehydrogenase (quinone)  39.95 
 
 		 629 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07430  NADH dehydrogenase subunit F  40.2 
 
 		 449 aa  284  3.0000000000000004e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0432719 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0099  NADH dehydrogenase (quinone)  40.53 
 
 		 597 aa  283  5.000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.953797  hitchhiker  0.000000556523 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2099  NADH dehydrogenase (quinone)  34.4 
 
 		 634 aa  283  5.000000000000001e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0860011  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0109  NADH dehydrogenase (quinone)  41.27 
 
 		 656 aa  282  1e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2160  NADH dehydrogenase (quinone)  33.12 
 
 		 562 aa  282  1e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0757022  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1450  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  32.44 
 
 		 636 aa  281  2e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.101445  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2233  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  35.67 
 
 		 597 aa  281  3e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2721  NAD-reducing hydrogenase, alpha subunit  40.1 
 
 		 570 aa  280  4e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3133  NADH dehydrogenase (quinone)  40.1 
 
 		 590 aa  280  7e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.846536  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1701  NADH dehydrogenase (quinone)  36.19 
 
 		 604 aa  279  1e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1857  NADH dehydrogenase (quinone)  40.16 
 
 		 600 aa  279  1e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2690  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  38.89 
 
 		 438 aa  278  2e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.363357  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1150  NADH dehydrogenase (quinone)  37.22 
 
 		 404 aa  278  2e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.247919  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03210  NADH dehydrogenase subunit F  40.41 
 
 		 424 aa  278  2e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589987  normal  0.53715 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2711  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  39.54 
 
 		 444 aa  277  3e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0226  NADH dehydrogenase (quinone)  40.11 
 
 		 632 aa  277  4e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.096685  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0589  NADH dehydrogenase (quinone)  38.48 
 
 		 428 aa  277  4e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.232944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1517  NADH dehydrogenase (quinone)  40.77 
 
 		 427 aa  276  6e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0544  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  39.03 
 
 		 448 aa  276  8e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.789941 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1086  NADH dehydrogenase (quinone)  39.63 
 
 		 526 aa  275  2.0000000000000002e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1923  NADH dehydrogenase (quinone)  44.35 
 
 		 539 aa  275  2.0000000000000002e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0807  NADH dehydrogenase (quinone)  37.5 
 
 		 404 aa  275  2.0000000000000002e-72  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0272  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  39.31 
 
 		 434 aa  274  3e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>