More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2724 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA2724  NAD-reducing hydrogenase, alpha subunit  100 
 
 
610 aa  1245    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000462044  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0979  NADH dehydrogenase  54.66 
 
 
632 aa  681    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1670  hydrogen dehydrogenase  55.95 
 
 
598 aa  686    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3858  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  54.52 
 
 
603 aa  655    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1462  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  52.94 
 
 
627 aa  640    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.185641 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0528  putative NADH dehydrogenase subunit  51.29 
 
 
610 aa  598  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.704697  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2247  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  53.33 
 
 
627 aa  594  1e-168  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.179824  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1217  hydrogenase, NADP-reducing subunit C  50.09 
 
 
588 aa  593  1e-168  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.180172 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2751  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  46.46 
 
 
603 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4116  hydrogen dehydrogenase  44.39 
 
 
603 aa  472  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.502813  normal  0.19956 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1522  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  43.17 
 
 
602 aa  463  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000148322  hitchhiker  0.000569435 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1828  NADH dehydrogenase (quinone)  42.75 
 
 
407 aa  337  5e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0173  NADH dehydrogenase (quinone)  38.4 
 
 
597 aa  330  5.0000000000000004e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0720  NADH dehydrogenase (quinone)  44.14 
 
 
545 aa  329  8e-89  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00999729  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0993  NADH dehydrogenase (quinone)  37.35 
 
 
610 aa  329  1.0000000000000001e-88  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0696  NADH dehydrogenase (quinone)  43.72 
 
 
545 aa  329  1.0000000000000001e-88  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000417436  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1018  NADH dehydrogenase (quinone)  41.1 
 
 
407 aa  327  3e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1170  NADH dehydrogenase (quinone)  38.02 
 
 
602 aa  327  5e-88  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0919  NADH dehydrogenase (quinone)  40.6 
 
 
596 aa  325  1e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1024  NADH dehydrogenase (quinone)  40 
 
 
407 aa  325  1e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0472  NADH dehydrogenase (quinone)  40.62 
 
 
594 aa  324  4e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.524488  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0624  NADH dehydrogenase (quinone)  36.38 
 
 
614 aa  322  9.999999999999999e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000168904  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2713  NADH dehydrogenase (quinone)  38.99 
 
 
552 aa  322  1.9999999999999998e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0913  NADH dehydrogenase (quinone)  38.99 
 
 
607 aa  321  3e-86  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0935  NADH dehydrogenase (quinone)  38.99 
 
 
607 aa  321  3e-86  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06320  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 51 kDa subunit  37.72 
 
 
594 aa  318  1e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000903471  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1397  NADH dehydrogenase (quinone)  37.8 
 
 
597 aa  318  2e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0209404  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0149  NADH dehydrogenase (quinone)  38.37 
 
 
596 aa  317  3e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1686  NADH dehydrogenase (quinone)  36.4 
 
 
545 aa  317  4e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4654  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  44.76 
 
 
535 aa  317  4e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2708  NADH dehydrogenase I, F subunit  44.3 
 
 
488 aa  317  4e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0845  NADH dehydrogenase (quinone)  39.84 
 
 
572 aa  317  4e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0991  NADH dehydrogenase (quinone)  40.65 
 
 
539 aa  315  9.999999999999999e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1338  NADH dehydrogenase (quinone)  38.48 
 
 
572 aa  315  1.9999999999999998e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2160  NADH dehydrogenase (quinone)  41.53 
 
 
562 aa  314  2.9999999999999996e-84  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0757022  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4112  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  35.64 
 
 
656 aa  313  3.9999999999999997e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483313  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0095  NADH dehydrogenase (quinone)  38.59 
 
 
535 aa  313  9e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.693174 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0098  NADH dehydrogenase (quinone)  38.59 
 
 
535 aa  312  9e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1545  NADH dehydrogenase (quinone)  43.89 
 
 
668 aa  311  2e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.793702  normal  0.569986 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1168  NADH dehydrogenase (quinone)  41.03 
 
 
538 aa  311  2e-83  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.073062  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0784  NADH dehydrogenase (quinone)  40.1 
 
 
408 aa  311  2.9999999999999997e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2704  NADH dehydrogenase (quinone)  36.63 
 
 
603 aa  310  4e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.910602  normal  0.0334637 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1604  NADP-reducing hydrogenase chain C  42.08 
 
 
486 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1634  NADP-reducing hydrogenase chain C  41.62 
 
 
486 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000096005  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1844  NADP-reducing hydrogenase chain C  41.62 
 
 
486 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3505  NADH dehydrogenase (quinone)  37.33 
 
 
619 aa  307  4.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.960223  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3600  NADH dehydrogenase (quinone)  35.24 
 
 
614 aa  307  5.0000000000000004e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0279  NADH dehydrogenase (quinone)  40 
 
 
534 aa  306  7e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2479  NADH dehydrogenase (quinone)  41.3 
 
 
535 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.858375  normal  0.575903 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1887  NADH dehydrogenase (quinone)  37.72 
 
 
592 aa  305  2.0000000000000002e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0724  NADH dehydrogenase (quinone)  41.96 
 
 
485 aa  303  7.000000000000001e-81  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1298  NADH dehydrogenase (quinone)  39.11 
 
 
598 aa  303  8.000000000000001e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2233  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  37.87 
 
 
597 aa  302  9e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1248  NADH dehydrogenase (quinone)  42.45 
 
 
604 aa  302  9e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.600832  normal  0.0289049 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3830  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  38.54 
 
 
677 aa  302  9e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4166  NADH dehydrogenase (quinone)  38.08 
 
 
530 aa  302  1e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0109  NADH dehydrogenase (quinone)  37.15 
 
 
656 aa  301  3e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0157  NADH dehydrogenase (quinone)  36.62 
 
 
626 aa  300  5e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0657  NADH dehydrogenase (quinone)  42 
 
 
590 aa  300  6e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.210561  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0332  NADH dehydrogenase (quinone)  36.29 
 
 
629 aa  300  6e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2804  NADH dehydrogenase (quinone)  34.77 
 
 
636 aa  300  7e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.260588 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0341  NADH dehydrogenase (quinone)  38.57 
 
 
597 aa  300  7e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.024737  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0914  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  39.8 
 
 
446 aa  298  1e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3542  NADH dehydrogenase (quinone)  39.46 
 
 
537 aa  298  2e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0343  NADH dehydrogenase I, F subunit  40.5 
 
 
591 aa  297  4e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0491  NADH dehydrogenase (quinone)  38.6 
 
 
623 aa  297  4e-79  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3804  NADH dehydrogenase (quinone)  37.92 
 
 
595 aa  296  9e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2139  NADH dehydrogenase (quinone)  38.34 
 
 
596 aa  296  1e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1450  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  33.96 
 
 
636 aa  295  1e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.101445  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2099  NADH dehydrogenase (quinone)  35.93 
 
 
634 aa  295  2e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0860011  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1110  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  38.18 
 
 
569 aa  295  2e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.163971 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3291  NADH dehydrogenase (quinone)  37.38 
 
 
575 aa  295  2e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1365  NADH dehydrogenase (quinone)  38.48 
 
 
532 aa  294  3e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.529964  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0099  NADH dehydrogenase (quinone)  34.86 
 
 
597 aa  293  6e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.953797  hitchhiker  0.000000556523 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2721  NAD-reducing hydrogenase, alpha subunit  36.4 
 
 
570 aa  293  7e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1718  NADH dehydrogenase (quinone)  38.33 
 
 
619 aa  292  1e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.081204  normal  0.595114 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0559  NADH dehydrogenase (quinone)  41.69 
 
 
624 aa  292  1e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.382532  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1857  NADH dehydrogenase (quinone)  35.77 
 
 
600 aa  291  2e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4052  NADH dehydrogenase (quinone)  41.47 
 
 
543 aa  292  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.166316 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0703  NADH dehydrogenase (quinone)  35.48 
 
 
588 aa  292  2e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4413  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  39.45 
 
 
433 aa  291  3e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3350  NADH dehydrogenase I, F subunit  36.69 
 
 
591 aa  291  3e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.50901  normal  0.051471 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02970  NADH dehydrogenase I subunit F  39.85 
 
 
408 aa  290  4e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3516  NADH dehydrogenase (quinone)  42.35 
 
 
488 aa  290  4e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1086  NADH dehydrogenase (quinone)  40.41 
 
 
526 aa  290  6e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1278  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  40.35 
 
 
444 aa  290  7e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.327335  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3921  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  40.75 
 
 
593 aa  289  1e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0834  NADH dehydrogenase I, F subunit  35.45 
 
 
617 aa  289  1e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0589  NADH dehydrogenase (quinone)  40.61 
 
 
428 aa  288  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.232944  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4005  NADH dehydrogenase (quinone)  40.25 
 
 
593 aa  288  2e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42089e-25 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4239  NADH dehydrogenase (quinone)  40 
 
 
593 aa  288  2e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0474  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  39.95 
 
 
448 aa  288  2e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0914  NADH:ubiquinone oxidoreductase, NADH-binding (51 kD) subunit  37.36 
 
 
571 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1368  NADH dehydrogenase (quinone)  38.11 
 
 
626 aa  286  5e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01800  NADH dehydrogenase I subunit F  36.4 
 
 
624 aa  286  5.999999999999999e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.235185  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1318  NADH dehydrogenase (quinone)  37.92 
 
 
626 aa  286  9e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1274  NADH dehydrogenase (quinone)  34.44 
 
 
562 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.651709 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4868  NADH dehydrogenase (quinone)  41.12 
 
 
519 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00138717 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1517  NADH dehydrogenase (quinone)  42.05 
 
 
427 aa  285  2.0000000000000002e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1923  NADH dehydrogenase (quinone)  44.09 
 
 
539 aa  285  2.0000000000000002e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>