More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2751 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2751  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  100 
 
 		 603 aa  1220    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1522  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  48.98 
 
 		 602 aa  536  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000148322  hitchhiker  0.000569435 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4116  hydrogen dehydrogenase  49.83 
 
 		 603 aa  529  1e-149  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.502813  normal  0.19956 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2724  NAD-reducing hydrogenase, alpha subunit  46.46 
 
 		 610 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000462044  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1670  hydrogen dehydrogenase  45.16 
 
 		 598 aa  501  1e-140  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0979  NADH dehydrogenase  44.57 
 
 		 632 aa  498  1e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0528  putative NADH dehydrogenase subunit  43.4 
 
 		 610 aa  480  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.704697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1217  hydrogenase, NADP-reducing subunit C  42.29 
 
 		 588 aa  479  1e-134  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.180172 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1462  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  42.95 
 
 		 627 aa  478  1e-133  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.185641 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3858  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  44.76 
 
 		 603 aa  477  1e-133  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2247  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  45.23 
 
 		 627 aa  460  9.999999999999999e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.179824  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1170  NADH dehydrogenase (quinone)  43.86 
 
 		 602 aa  332  9e-90  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0993  NADH dehydrogenase (quinone)  44.13 
 
 		 610 aa  331  2e-89  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4654  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  44.74 
 
 		 535 aa  326  7e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0991  NADH dehydrogenase (quinone)  44.44 
 
 		 539 aa  325  1e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0919  NADH dehydrogenase (quinone)  39.45 
 
 		 596 aa  321  1.9999999999999998e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1274  NADH dehydrogenase (quinone)  35.39 
 
 		 562 aa  321  3e-86  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.651709 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0696  NADH dehydrogenase (quinone)  43.46 
 
 		 545 aa  321  3e-86  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000417436  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0624  NADH dehydrogenase (quinone)  35.87 
 
 		 614 aa  320  3.9999999999999996e-86  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000168904  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0720  NADH dehydrogenase (quinone)  43.46 
 
 		 545 aa  320  5e-86  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00999729  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0397  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  33.86 
 
 		 706 aa  319  1e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0935  NADH dehydrogenase (quinone)  43.83 
 
 		 607 aa  318  2e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1168  NADH dehydrogenase (quinone)  42.63 
 
 		 538 aa  318  2e-85  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.073062  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0913  NADH dehydrogenase (quinone)  43.83 
 
 		 607 aa  318  2e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0472  NADH dehydrogenase (quinone)  45.74 
 
 		 594 aa  318  3e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.524488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1248  NADH dehydrogenase (quinone)  43.23 
 
 		 604 aa  316  8e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.600832  normal  0.0289049 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06320  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 51 kDa subunit  38.81 
 
 		 594 aa  315  1.9999999999999998e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000903471  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2160  NADH dehydrogenase (quinone)  41.67 
 
 		 562 aa  315  1.9999999999999998e-84  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0757022  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0149  NADH dehydrogenase (quinone)  37.85 
 
 		 596 aa  314  2.9999999999999996e-84  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3600  NADH dehydrogenase (quinone)  42.31 
 
 		 614 aa  314  2.9999999999999996e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2708  NADH dehydrogenase I, F subunit  43.54 
 
 		 488 aa  313  4.999999999999999e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1338  NADH dehydrogenase (quinone)  41.9 
 
 		 572 aa  313  4.999999999999999e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1828  NADH dehydrogenase (quinone)  41.39 
 
 		 407 aa  312  9e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2713  NADH dehydrogenase (quinone)  37.52 
 
 		 552 aa  312  1e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1024  NADH dehydrogenase (quinone)  39.59 
 
 		 407 aa  311  2e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0724  NADH dehydrogenase (quinone)  44.88 
 
 		 485 aa  310  2.9999999999999997e-83  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1368  NADH dehydrogenase (quinone)  39.04 
 
 		 626 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1018  NADH dehydrogenase (quinone)  42.9 
 
 		 407 aa  310  4e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1545  NADH dehydrogenase (quinone)  43.86 
 
 		 668 aa  310  5.9999999999999995e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.793702  normal  0.569986 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0173  NADH dehydrogenase (quinone)  42.97 
 
 		 597 aa  309  1.0000000000000001e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1318  NADH dehydrogenase (quinone)  38.65 
 
 		 626 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2479  NADH dehydrogenase (quinone)  42.06 
 
 		 535 aa  307  4.0000000000000004e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.858375  normal  0.575903 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0914  NADH:ubiquinone oxidoreductase, NADH-binding (51 kD) subunit  41.65 
 
 		 571 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0559  NADH dehydrogenase (quinone)  41.33 
 
 		 624 aa  305  2.0000000000000002e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.382532  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1397  NADH dehydrogenase (quinone)  37.53 
 
 		 597 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0209404  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4112  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  36.67 
 
 		 656 aa  305  2.0000000000000002e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1634  NADP-reducing hydrogenase chain C  41.25 
 
 		 486 aa  303  6.000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000096005  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1844  NADP-reducing hydrogenase chain C  41.25 
 
 		 486 aa  303  6.000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1278  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  42.38 
 
 		 444 aa  303  6.000000000000001e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.327335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4166  NADH dehydrogenase (quinone)  43.98 
 
 		 530 aa  303  6.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0784  NADH dehydrogenase (quinone)  40.15 
 
 		 408 aa  303  8.000000000000001e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2099  NADH dehydrogenase (quinone)  36.6 
 
 		 634 aa  302  1e-80  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0860011  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1604  NADP-reducing hydrogenase chain C  40.99 
 
 		 486 aa  301  3e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0332  NADH dehydrogenase (quinone)  39.74 
 
 		 629 aa  300  4e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3291  NADH dehydrogenase (quinone)  43.52 
 
 		 575 aa  300  4e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0845  NADH dehydrogenase (quinone)  44.13 
 
 		 572 aa  300  4e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3542  NADH dehydrogenase (quinone)  40.71 
 
 		 537 aa  300  5e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0098  NADH dehydrogenase (quinone)  38.68 
 
 		 535 aa  300  6e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3804  NADH dehydrogenase (quinone)  41.67 
 
 		 595 aa  300  7e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0095  NADH dehydrogenase (quinone)  36.6 
 
 		 535 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.693174 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3350  NADH dehydrogenase I, F subunit  43.34 
 
 		 591 aa  299  1e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.50901  normal  0.051471 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2721  NAD-reducing hydrogenase, alpha subunit  41.28 
 
 		 570 aa  298  2e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0544  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  39.45 
 
 		 448 aa  297  3e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.789941 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0657  NADH dehydrogenase (quinone)  43.6 
 
 		 590 aa  297  4e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.210561  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0157  NADH dehydrogenase (quinone)  37.45 
 
 		 626 aa  297  5e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0914  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  41.16 
 
 		 446 aa  297  5e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1365  NADH dehydrogenase (quinone)  40.34 
 
 		 532 aa  296  6e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.529964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0491  NADH dehydrogenase (quinone)  42.53 
 
 		 623 aa  296  6e-79  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2233  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  41.78 
 
 		 597 aa  296  7e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3516  NADH dehydrogenase (quinone)  42.41 
 
 		 488 aa  296  8e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1450  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  40.21 
 
 		 636 aa  295  1e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.101445  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1872  NADH-quinone oxidoreductase F subunit  41.51 
 
 		 438 aa  295  1e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.901047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0109  NADH dehydrogenase (quinone)  41.53 
 
 		 656 aa  295  2e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2804  NADH dehydrogenase (quinone)  39.95 
 
 		 636 aa  295  2e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.260588 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01800  NADH dehydrogenase I subunit F  44.13 
 
 		 624 aa  294  3e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.235185  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0099  NADH dehydrogenase (quinone)  39.95 
 
 		 597 aa  294  3e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.953797  hitchhiker  0.000000556523 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0844  NADH dehydrogenase (quinone)  38.52 
 
 		 562 aa  293  4e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0257852  normal  0.19292 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3921  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  43.34 
 
 		 593 aa  294  4e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07430  NADH dehydrogenase subunit F  39.95 
 
 		 449 aa  293  5e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0432719 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0834  NADH dehydrogenase I, F subunit  36.55 
 
 		 617 aa  293  6e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0343  NADH dehydrogenase I, F subunit  43.08 
 
 		 591 aa  292  1e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3830  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  42.82 
 
 		 677 aa  292  1e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1298  NADH dehydrogenase (quinone)  43.34 
 
 		 598 aa  292  1e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4052  NADH dehydrogenase (quinone)  42.08 
 
 		 543 aa  292  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.166316 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4005  NADH dehydrogenase (quinone)  42.56 
 
 		 593 aa  291  2e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42089e-25 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1110  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  35.05 
 
 		 569 aa  291  2e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.163971 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0279  NADH dehydrogenase (quinone)  39.69 
 
 		 534 aa  291  2e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1086  NADH dehydrogenase (quinone)  40.21 
 
 		 526 aa  291  2e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1686  NADH dehydrogenase (quinone)  39.58 
 
 		 545 aa  291  2e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02970  NADH dehydrogenase I subunit F  40.47 
 
 		 408 aa  291  2e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0341  NADH dehydrogenase (quinone)  43.27 
 
 		 597 aa  291  2e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.024737  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0804  NADH dehydrogenase (quinone)  38.86 
 
 		 518 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2704  NADH dehydrogenase (quinone)  42.42 
 
 		 603 aa  288  1e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.910602  normal  0.0334637 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7014  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  41.29 
 
 		 454 aa  288  2e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4083  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  38.92 
 
 		 446 aa  286  5.999999999999999e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.323862  normal  0.192714 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2831  NADH dehydrogenase I chain F  40.91 
 
 		 425 aa  286  7e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2700  NADH dehydrogenase I chain F  40.91 
 
 		 425 aa  286  7e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1241  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  38.81 
 
 		 456 aa  286  9e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4239  NADH dehydrogenase (quinone)  42.04 
 
 		 593 aa  286  9e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0926  NADH dehydrogenase I subunit F  41.98 
 
 		 431 aa  286  9e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>