More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1522 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007973  Rmet_1522  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  100 
 
 
602 aa  1242    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000148322  hitchhiker  0.000569435 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4116  hydrogen dehydrogenase  71.24 
 
 
603 aa  893    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.502813  normal  0.19956 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2751  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  48.98 
 
 
603 aa  536  1e-151  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3858  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  42.25 
 
 
603 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2724  NAD-reducing hydrogenase, alpha subunit  43.17 
 
 
610 aa  463  1e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000462044  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1462  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  42.01 
 
 
627 aa  461  9.999999999999999e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.185641 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0979  NADH dehydrogenase  41.51 
 
 
632 aa  459  9.999999999999999e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0528  putative NADH dehydrogenase subunit  41.57 
 
 
610 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.704697  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1670  hydrogen dehydrogenase  42.08 
 
 
598 aa  445  1e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2247  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  42.21 
 
 
627 aa  434  1e-120  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.179824  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1217  hydrogenase, NADP-reducing subunit C  38.24 
 
 
588 aa  424  1e-117  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.180172 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1170  NADH dehydrogenase (quinone)  36.52 
 
 
602 aa  336  7e-91  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2708  NADH dehydrogenase I, F subunit  44.76 
 
 
488 aa  333  7.000000000000001e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0919  NADH dehydrogenase (quinone)  38.24 
 
 
596 aa  333  8e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0913  NADH dehydrogenase (quinone)  36.57 
 
 
607 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0993  NADH dehydrogenase (quinone)  36.12 
 
 
610 aa  328  2.0000000000000001e-88  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0935  NADH dehydrogenase (quinone)  36.57 
 
 
607 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0173  NADH dehydrogenase (quinone)  37.84 
 
 
597 aa  324  3e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0624  NADH dehydrogenase (quinone)  36.13 
 
 
614 aa  323  6e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000168904  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1397  NADH dehydrogenase (quinone)  35.8 
 
 
597 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0209404  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3600  NADH dehydrogenase (quinone)  34.67 
 
 
614 aa  321  3e-86  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0724  NADH dehydrogenase (quinone)  44.94 
 
 
485 aa  320  3.9999999999999996e-86  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06320  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 51 kDa subunit  37.29 
 
 
594 aa  318  2e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000903471  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0279  NADH dehydrogenase (quinone)  36.1 
 
 
534 aa  318  2e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1828  NADH dehydrogenase (quinone)  42.6 
 
 
407 aa  317  4e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4654  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  41.15 
 
 
535 aa  316  9.999999999999999e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0095  NADH dehydrogenase (quinone)  35.73 
 
 
535 aa  313  6.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.693174 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1024  NADH dehydrogenase (quinone)  41.04 
 
 
407 aa  313  6.999999999999999e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1248  NADH dehydrogenase (quinone)  36.76 
 
 
604 aa  312  1e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.600832  normal  0.0289049 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0098  NADH dehydrogenase (quinone)  35.73 
 
 
535 aa  312  1e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0149  NADH dehydrogenase (quinone)  42.05 
 
 
596 aa  310  4e-83  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2713  NADH dehydrogenase (quinone)  33.65 
 
 
552 aa  310  5.9999999999999995e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0845  NADH dehydrogenase (quinone)  38.14 
 
 
572 aa  310  6.999999999999999e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1110  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  35.05 
 
 
569 aa  309  8e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.163971 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1604  NADP-reducing hydrogenase chain C  40.15 
 
 
486 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0559  NADH dehydrogenase (quinone)  39.75 
 
 
624 aa  308  3e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.382532  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1634  NADP-reducing hydrogenase chain C  40.15 
 
 
486 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000096005  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1844  NADP-reducing hydrogenase chain C  40.15 
 
 
486 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3291  NADH dehydrogenase (quinone)  36.05 
 
 
575 aa  306  6e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1168  NADH dehydrogenase (quinone)  39.79 
 
 
538 aa  306  8.000000000000001e-82  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.073062  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1018  NADH dehydrogenase (quinone)  40.41 
 
 
407 aa  305  2.0000000000000002e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1338  NADH dehydrogenase (quinone)  34.89 
 
 
572 aa  304  4.0000000000000003e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4166  NADH dehydrogenase (quinone)  36.33 
 
 
530 aa  303  7.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4052  NADH dehydrogenase (quinone)  36.89 
 
 
543 aa  303  8.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.166316 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1150  NADH dehydrogenase (quinone)  41.95 
 
 
404 aa  302  1e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.247919  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1274  NADH dehydrogenase (quinone)  39.03 
 
 
562 aa  301  2e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.651709 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0472  NADH dehydrogenase (quinone)  36.44 
 
 
594 aa  301  2e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.524488  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3804  NADH dehydrogenase (quinone)  34.89 
 
 
595 aa  301  2e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0784  NADH dehydrogenase (quinone)  39.43 
 
 
408 aa  301  3e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3516  NADH dehydrogenase (quinone)  40.5 
 
 
488 aa  301  3e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02970  NADH dehydrogenase I subunit F  41.58 
 
 
408 aa  300  4e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1686  NADH dehydrogenase (quinone)  41.1 
 
 
545 aa  300  4e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0914  NADH:ubiquinone oxidoreductase, NADH-binding (51 kD) subunit  38.93 
 
 
571 aa  300  6e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1368  NADH dehydrogenase (quinone)  35.35 
 
 
626 aa  299  9e-80  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0696  NADH dehydrogenase (quinone)  39.9 
 
 
545 aa  299  1e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000417436  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1318  NADH dehydrogenase (quinone)  35.16 
 
 
626 aa  298  2e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3542  NADH dehydrogenase (quinone)  36.63 
 
 
537 aa  298  2e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4239  NADH dehydrogenase (quinone)  41.3 
 
 
593 aa  297  3e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2804  NADH dehydrogenase (quinone)  31.85 
 
 
636 aa  297  4e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.260588 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2479  NADH dehydrogenase (quinone)  36.23 
 
 
535 aa  296  5e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.858375  normal  0.575903 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2160  NADH dehydrogenase (quinone)  33.75 
 
 
562 aa  297  5e-79  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0757022  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1086  NADH dehydrogenase (quinone)  39.11 
 
 
526 aa  296  5e-79  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0657  NADH dehydrogenase (quinone)  37.58 
 
 
590 aa  296  6e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.210561  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0720  NADH dehydrogenase (quinone)  40.42 
 
 
545 aa  296  7e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00999729  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2721  NAD-reducing hydrogenase, alpha subunit  34.48 
 
 
570 aa  296  8e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2099  NADH dehydrogenase (quinone)  33.39 
 
 
634 aa  295  2e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0860011  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3830  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  34.27 
 
 
677 aa  295  2e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1365  NADH dehydrogenase (quinone)  37.68 
 
 
532 aa  294  3e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.529964  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1450  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  31.85 
 
 
636 aa  294  3e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.101445  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0991  NADH dehydrogenase (quinone)  40.74 
 
 
539 aa  294  4e-78  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4005  NADH dehydrogenase (quinone)  40.1 
 
 
593 aa  293  6e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42089e-25 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0109  NADH dehydrogenase (quinone)  39.04 
 
 
656 aa  293  8e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0341  NADH dehydrogenase (quinone)  36.98 
 
 
597 aa  292  1e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.024737  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0343  NADH dehydrogenase I, F subunit  34.85 
 
 
591 aa  292  1e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3921  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  40.1 
 
 
593 aa  291  2e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0157  NADH dehydrogenase (quinone)  34.38 
 
 
626 aa  291  3e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0844  NADH dehydrogenase (quinone)  39.03 
 
 
562 aa  291  3e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0257852  normal  0.19292 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0834  NADH dehydrogenase I, F subunit  35.83 
 
 
617 aa  290  4e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01800  NADH dehydrogenase I subunit F  41.82 
 
 
624 aa  290  5.0000000000000004e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.235185  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2704  NADH dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 
603 aa  288  2e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.910602  normal  0.0334637 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0099  NADH dehydrogenase (quinone)  31.85 
 
 
597 aa  287  4e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.953797  hitchhiker  0.000000556523 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3350  NADH dehydrogenase I, F subunit  34.14 
 
 
591 aa  287  4e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.50901  normal  0.051471 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0332  NADH dehydrogenase (quinone)  38.6 
 
 
629 aa  287  5e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1545  NADH dehydrogenase (quinone)  39.44 
 
 
668 aa  286  5.999999999999999e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.793702  normal  0.569986 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0491  NADH dehydrogenase (quinone)  39.49 
 
 
623 aa  286  5.999999999999999e-76  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1887  NADH dehydrogenase (quinone)  34.7 
 
 
592 aa  285  1.0000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0822  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  38.65 
 
 
426 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.76792  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2794  NADH dehydrogenase (quinone)  38.11 
 
 
572 aa  282  1e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3505  NADH dehydrogenase (quinone)  34.36 
 
 
619 aa  281  2e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.960223  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1298  NADH dehydrogenase (quinone)  40.36 
 
 
598 aa  280  4e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2625  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  37.86 
 
 
427 aa  280  6e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2056  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  38.74 
 
 
441 aa  280  6e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2252  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  37.86 
 
 
427 aa  280  6e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000522116 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1857  NADH dehydrogenase (quinone)  33.67 
 
 
600 aa  280  8e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3480  NADH dehydrogenase (quinone)  38.3 
 
 
520 aa  278  2e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.3807  normal  0.394192 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2233  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  34.55 
 
 
597 aa  278  2e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2139  NADH dehydrogenase (quinone)  34.46 
 
 
596 aa  277  4e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1718  NADH dehydrogenase (quinone)  36.99 
 
 
619 aa  277  4e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.081204  normal  0.595114 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4112  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  32.78 
 
 
656 aa  276  8e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483313  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0226  NADH dehydrogenase (quinone)  39.63 
 
 
632 aa  276  8e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.096685  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>