79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3831 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3831  hypothetical protein  100 
 
 		 243 aa  480  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145159  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3793  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  36.24 
 
 		 1261 aa  84  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2862  hypothetical protein  27.73 
 
 		 261 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00254275  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3008  hypothetical protein  26.15 
 
 		 261 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00154991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4415  hypothetical protein  33.33 
 
 		 245 aa  69.7  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0260723 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4566  hypothetical protein  33.33 
 
 		 245 aa  69.3  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0427983 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4481  hypothetical protein  33.33 
 
 		 245 aa  68.9  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3203  hypothetical protein  24.7 
 
 		 247 aa  68.6  0.00000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.248312  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4489  hypothetical protein  28.83 
 
 		 245 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2522  hypothetical protein  27.08 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.979942  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4002  hypothetical protein  32.5 
 
 		 245 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.413417 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4533  hypothetical protein  32.5 
 
 		 245 aa  66.6  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03860  hypothetical protein  32.5 
 
 		 245 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1394  hypothetical protein  32.08 
 
 		 262 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.334795  normal  0.0357874 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03900  hypothetical protein  32.5 
 
 		 245 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4566  hypothetical protein  29.72 
 
 		 245 aa  66.2  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.942521 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5507  hypothetical protein  32.5 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4618  hypothetical protein  29.72 
 
 		 245 aa  65.9  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.36259 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0233  hypothetical protein  28.06 
 
 		 245 aa  64.7  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.739871  normal  0.683835 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1341  hypothetical protein  28.85 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280268 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1988  otnG protein  30.61 
 
 		 972 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4267  hypothetical protein  31.67 
 
 		 245 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4576  hypothetical protein  31.67 
 
 		 245 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3969  protein of unknown function DUF1017  31.67 
 
 		 245 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1406  hypothetical protein  28.85 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0730107 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0655  putative lipoprotein  30.77 
 
 		 995 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1197  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  26.52 
 
 		 1031 aa  61.6  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0938466  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0562  putative lipoprotein  30.77 
 
 		 995 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3158  polysaccharide synthesis-related protein  28.12 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1957  hypothetical protein  30.77 
 
 		 976 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.52891  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2879  hypothetical protein  25.46 
 
 		 261 aa  58.9  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000994717  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1497  protein of unknown function DUF1017  25 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000397908  normal  0.348491 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2264  ClpX, ATPase regulatory subunit  25.46 
 
 		 827 aa  57.4  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000642696  decreased coverage  0.000131264 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1942  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  27.69 
 
 		 990 aa  57.4  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0277  polysaccharide export periplasmic protein  23.15 
 
 		 869 aa  56.2  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1842  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  27.32 
 
 		 781 aa  54.7  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.749239  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3271  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  32.19 
 
 		 981 aa  53.9  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000771318 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2893  polysaccharide export protein  25.7 
 
 		 912 aa  52.8  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.325033  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3011  protein of unknown function DUF1017  29.11 
 
 		 260 aa  51.6  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00176721  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0794  polysaccharide export protein  24.77 
 
 		 869 aa  51.6  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.020437  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1323  hypothetical protein  29.75 
 
 		 260 aa  50.4  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00489097  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2611  hypothetical protein  30 
 
 		 248 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.285762 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1101  hypothetical protein  30 
 
 		 248 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000190243  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2658  protein of unknown function DUF1017  30 
 
 		 248 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.125045  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2330  group 4 capsule (G4C) polysaccharide, YmcB  30 
 
 		 248 aa  51.2  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000702109  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1095  group 4 capsule (G4C) polysaccharide, YmcB  30 
 
 		 248 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00988  hypothetical protein  30 
 
 		 248 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1221  group 4 capsule (G4C) polysaccharide, YmcB  28.86 
 
 		 248 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000377582  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00995  hypothetical protein  30 
 
 		 248 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0888  polysaccharide export protein  26.94 
 
 		 940 aa  50.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.434689  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3645  polysaccharide biosynthesis/export protein  26.82 
 
 		 920 aa  50.1  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1515  polysaccharide export protein  25.64 
 
 		 869 aa  49.7  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000317972  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3035  polysaccharide export protein  25.35 
 
 		 828 aa  49.7  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.636336  normal  0.407015 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3241  polysaccharide export protein  27.03 
 
 		 587 aa  49.7  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1470  polysaccharide export protein  25.35 
 
 		 828 aa  48.9  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.270093  normal  0.749053 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0530  polysaccharide export protein  24.68 
 
 		 1055 aa  48.1  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.925852 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001787  capsular polysaccharide export system periplasmic protein KpsD  25.82 
 
 		 579 aa  47.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2843  polysaccharide export protein  24.64 
 
 		 910 aa  47.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427616  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1395  polysaccharide export protein  25 
 
 		 931 aa  47  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0391429  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2732  polysaccharide export protein  23.61 
 
 		 753 aa  46.2  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445544  normal  0.725394 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1399  polysaccharide export protein  23.72 
 
 		 920 aa  46.2  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00159215  normal  0.0100644 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1651  polysaccharide export protein  24.2 
 
 		 915 aa  46.2  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.530434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2584  polysaccharide export protein  29.47 
 
 		 605 aa  45.4  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000240824 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1690  polysaccharide export protein  25.86 
 
 		 558 aa  45.4  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2676  polysaccharide export protein  27.41 
 
 		 849 aa  44.7  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2903  polysaccharide export protein  25.23 
 
 		 828 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0690654  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1576  ClpX, ATPase regulatory subunit  22.48 
 
 		 833 aa  44.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000033468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1315  polysaccharide export protein  23.5 
 
 		 837 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0893778 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1382  polysaccharide export protein  23.5 
 
 		 837 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0246  polysaccharide export protein  30.99 
 
 		 537 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000856367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2543  polysaccharide export protein  22.9 
 
 		 919 aa  43.9  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.941823  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1307  polysaccharide export protein  30.3 
 
 		 565 aa  43.5  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00687  hypothetical protein  23.26 
 
 		 897 aa  43.9  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1345  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  23.2 
 
 		 568 aa  43.5  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000291611 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1889  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  25.11 
 
 		 576 aa  43.5  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.105703  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3193  polysaccharide biosynthesis protein  24.3 
 
 		 921 aa  43.5  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1375  polysaccharide export protein  24.2 
 
 		 837 aa  42.4  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193694  decreased coverage  0.0000028911 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2236  polysaccharide export protein  23.47 
 
 		 948 aa  42.4  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.987184  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0763  polysaccharide export protein  25.45 
 
 		 852 aa  42  0.01  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00148481  normal  0.528442 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>