68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1197 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_3271  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  41.46 
 
 
981 aa  666    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000771318 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3793  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  48.96 
 
 
1261 aa  867    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1197  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  100 
 
 
1031 aa  2091    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0938466  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1942  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  63.15 
 
 
990 aa  1269    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0562  putative lipoprotein  45.51 
 
 
995 aa  791    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1957  hypothetical protein  45.61 
 
 
976 aa  793    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.52891  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0655  putative lipoprotein  45.61 
 
 
995 aa  792    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1988  otnG protein  44.71 
 
 
972 aa  784    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3830  hypothetical protein  44.3 
 
 
692 aa  543  1e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.491022  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0622  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  41.59 
 
 
704 aa  502  1e-140  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.944587  normal  0.172231 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3010  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  42.04 
 
 
711 aa  498  1e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0811368  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2843  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  42.76 
 
 
714 aa  489  1e-137  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1324  hypothetical protein  40.56 
 
 
707 aa  485  1e-135  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0971322  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0234  protein of unknown function DUF940, membrane lipoprotein putative  39.6 
 
 
698 aa  453  1.0000000000000001e-126  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.261966  normal  0.795052 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1405  protein of unknown function DUF940, membrane lipoprotein putative  38.48 
 
 
787 aa  450  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0951062 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1496  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  36.79 
 
 
789 aa  450  1e-125  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.174983  normal  0.482942 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4577  putative lipoprotein  39.51 
 
 
698 aa  449  1e-125  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1100  putative lipoprotein  38.34 
 
 
698 aa  450  1e-125  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000283617  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4490  putative lipoprotein  39.89 
 
 
698 aa  450  1e-125  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.197031  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03901  predicted porin  39.94 
 
 
698 aa  450  1e-125  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2880  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  36.79 
 
 
789 aa  451  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000128107  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03861  hypothetical protein  39.94 
 
 
698 aa  450  1e-125  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4268  putative lipoprotein  39.74 
 
 
698 aa  449  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2659  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  38.48 
 
 
698 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.627573  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4001  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  39.74 
 
 
698 aa  449  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.501947 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00987  hypothetical protein  38.34 
 
 
698 aa  448  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.570303  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1340  protein of unknown function DUF940, membrane lipoprotein putative  38.35 
 
 
787 aa  449  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235359 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3968  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  39.74 
 
 
698 aa  449  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3204  protein of unknown function DUF940, membrane lipoprotein putative  37.55 
 
 
709 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.497795  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2331  group 4 capsule (G4C) polysaccharide, lipoprotein YmcA  38.34 
 
 
698 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0175694  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1220  group 4 capsule (G4C) polysaccharide, lipoprotein YmcA  38.34 
 
 
698 aa  448  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.221159  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00994  hypothetical protein  38.34 
 
 
698 aa  448  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.579327  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3159  hypothetical protein  38.25 
 
 
792 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4534  putative lipoprotein  39.6 
 
 
698 aa  446  1e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2523  protein of unknown function DUF940, membrane lipoprotein putative  37.9 
 
 
788 aa  444  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5508  putative lipoprotein  39.46 
 
 
698 aa  445  1e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2612  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  38.05 
 
 
698 aa  446  1e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.161278 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4567  hypothetical protein  39.66 
 
 
698 aa  442  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4567  putative lipoprotein  39.66 
 
 
698 aa  442  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0407808 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4416  putative lipoprotein  39.69 
 
 
698 aa  442  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00872007 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3009  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  38.23 
 
 
787 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.383324  normal  0.742056 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4619  putative lipoprotein  39.51 
 
 
698 aa  440  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.264155 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4482  putative lipoprotein  39.66 
 
 
698 aa  442  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2863  hypothetical protein  37.8 
 
 
787 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.126176  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1393  protein of unknown function DUF940, membrane lipoprotein putative  37.93 
 
 
791 aa  438  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.244173  normal  0.032631 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001791  YjbH outer membrane lipoprotein  36.49 
 
 
731 aa  416  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00683  hypothetical protein  34.98 
 
 
720 aa  407  1.0000000000000001e-112  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00054  Fusion of WbfC- and WbfB-like uncharacterized  35.55 
 
 
700 aa  408  1.0000000000000001e-112  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.312192  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0789  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  35.29 
 
 
737 aa  402  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.298887  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0272  putative outer membrane protein  33.78 
 
 
735 aa  399  1e-109  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.635582  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2849  protein of unknown function DUF940, membrane lipoprotein putative  33.15 
 
 
722 aa  308  3e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.801609 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1187  hypothetical protein  33.01 
 
 
722 aa  308  5.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3858  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  31.87 
 
 
746 aa  293  9e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00089637  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2626  protein of unknown function DUF940, membrane lipoprotein putative  31.54 
 
 
720 aa  264  6.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4134  protein of unknown function DUF940, membrane lipoprotein putative  28.71 
 
 
731 aa  245  3.9999999999999997e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.337752  normal  0.233467 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3831  hypothetical protein  26.52 
 
 
243 aa  62.4  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145159  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2862  hypothetical protein  29.63 
 
 
261 aa  52  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00254275  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3008  hypothetical protein  29.63 
 
 
261 aa  51.6  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00154991  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1394  hypothetical protein  28.83 
 
 
262 aa  50.4  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.334795  normal  0.0357874 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5507  hypothetical protein  34.17 
 
 
220 aa  47.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4576  hypothetical protein  32.2 
 
 
245 aa  46.6  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4267  hypothetical protein  32.2 
 
 
245 aa  46.6  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3969  protein of unknown function DUF1017  32.2 
 
 
245 aa  46.2  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4533  hypothetical protein  31.36 
 
 
245 aa  45.8  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4002  hypothetical protein  31.36 
 
 
245 aa  45.8  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.413417 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03860  hypothetical protein  31.36 
 
 
245 aa  45.8  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03900  hypothetical protein  31.36 
 
 
245 aa  45.8  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4489  hypothetical protein  33.33 
 
 
245 aa  45.4  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>