61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3271 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1197  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  41.33 
 
 		 1031 aa  662    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0938466  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0655  putative lipoprotein  42.47 
 
 		 995 aa  678    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0562  putative lipoprotein  42.6 
 
 		 995 aa  672    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3271  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  100 
 
 		 981 aa  1953    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000771318 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1988  otnG protein  42.62 
 
 		 972 aa  683    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1942  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  43.56 
 
 		 990 aa  675    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1957  hypothetical protein  43.21 
 
 		 976 aa  678    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.52891  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3793  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  48.78 
 
 		 1261 aa  595  1e-168  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3830  hypothetical protein  39.88 
 
 		 692 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.491022  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0622  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  39.3 
 
 		 704 aa  422  1e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.944587  normal  0.172231 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2843  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  38.37 
 
 		 714 aa  404  1e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4577  putative lipoprotein  36.94 
 
 		 698 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4490  putative lipoprotein  36.65 
 
 		 698 aa  397  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.197031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3010  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  38.03 
 
 		 711 aa  399  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0811368  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03861  hypothetical protein  36.65 
 
 		 698 aa  393  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4268  putative lipoprotein  36.65 
 
 		 698 aa  395  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5508  putative lipoprotein  36.65 
 
 		 698 aa  393  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1324  hypothetical protein  37.3 
 
 		 707 aa  395  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0971322  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4001  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  36.65 
 
 		 698 aa  394  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.501947 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03901  predicted porin  36.65 
 
 		 698 aa  393  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3968  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  36.65 
 
 		 698 aa  394  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4534  putative lipoprotein  36.5 
 
 		 698 aa  392  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0234  protein of unknown function DUF940, membrane lipoprotein putative  36.08 
 
 		 698 aa  393  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.261966  normal  0.795052 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4567  hypothetical protein  35.6 
 
 		 698 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4619  putative lipoprotein  35.6 
 
 		 698 aa  385  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.264155 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4482  putative lipoprotein  35.6 
 
 		 698 aa  385  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4416  putative lipoprotein  35.6 
 
 		 698 aa  385  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00872007 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4567  putative lipoprotein  35.45 
 
 		 698 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0407808 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1496  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  34.54 
 
 		 789 aa  372  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.174983  normal  0.482942 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2880  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  34.54 
 
 		 789 aa  372  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000128107  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3204  protein of unknown function DUF940, membrane lipoprotein putative  36.14 
 
 		 709 aa  372  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.497795  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1220  group 4 capsule (G4C) polysaccharide, lipoprotein YmcA  37.01 
 
 		 698 aa  367  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.221159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00054  Fusion of WbfC- and WbfB-like uncharacterized  35.92 
 
 		 700 aa  367  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.312192  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2331  group 4 capsule (G4C) polysaccharide, lipoprotein YmcA  37.01 
 
 		 698 aa  367  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0175694  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00994  hypothetical protein  37.01 
 
 		 698 aa  367  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.579327  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3159  hypothetical protein  33.42 
 
 		 792 aa  367  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1100  putative lipoprotein  37.01 
 
 		 698 aa  368  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000283617  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00987  hypothetical protein  37.01 
 
 		 698 aa  367  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.570303  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0789  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  33.8 
 
 		 737 aa  367  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.298887  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2659  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  37.01 
 
 		 698 aa  367  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.627573  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2612  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  36.87 
 
 		 698 aa  365  3e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.161278 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1393  protein of unknown function DUF940, membrane lipoprotein putative  33.24 
 
 		 791 aa  360  5e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.244173  normal  0.032631 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3009  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  33.73 
 
 		 787 aa  360  7e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.383324  normal  0.742056 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2523  protein of unknown function DUF940, membrane lipoprotein putative  33.24 
 
 		 788 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1405  protein of unknown function DUF940, membrane lipoprotein putative  32.75 
 
 		 787 aa  353  1e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0951062 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2863  hypothetical protein  33.69 
 
 		 787 aa  353  1e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.126176  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1340  protein of unknown function DUF940, membrane lipoprotein putative  33.2 
 
 		 787 aa  352  2e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235359 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00683  hypothetical protein  33.7 
 
 		 720 aa  345  2e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001791  YjbH outer membrane lipoprotein  34.02 
 
 		 731 aa  343  5.999999999999999e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0272  putative outer membrane protein  32.64 
 
 		 735 aa  335  2e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.635582  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1187  hypothetical protein  30.85 
 
 		 722 aa  248  4e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2849  protein of unknown function DUF940, membrane lipoprotein putative  30.26 
 
 		 722 aa  248  6e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.801609 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3858  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  30.26 
 
 		 746 aa  242  2.9999999999999997e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00089637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2626  protein of unknown function DUF940, membrane lipoprotein putative  30.43 
 
 		 720 aa  234  8.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4134  protein of unknown function DUF940, membrane lipoprotein putative  28.51 
 
 		 731 aa  203  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.337752  normal  0.233467 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3831  hypothetical protein  32.19 
 
 		 243 aa  54.3  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145159  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1394  hypothetical protein  24.26 
 
 		 262 aa  48.9  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.334795  normal  0.0357874 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3158  polysaccharide synthesis-related protein  28.4 
 
 		 261 aa  47.4  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1666  hypothetical protein  30 
 
 		 699 aa  46.6  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1406  hypothetical protein  27.53 
 
 		 261 aa  44.7  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0730107 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0233  hypothetical protein  29.09 
 
 		 245 aa  44.7  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.739871  normal  0.683835 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>