44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_4489 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_4489  hypothetical protein  100 
 
 		 245 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03900  hypothetical protein  98.37 
 
 		 245 aa  484  1e-136  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03860  hypothetical protein  98.37 
 
 		 245 aa  484  1e-136  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4002  hypothetical protein  98.37 
 
 		 245 aa  484  1e-136  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.413417 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4576  hypothetical protein  97.55 
 
 		 245 aa  457  9.999999999999999e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4533  hypothetical protein  97.96 
 
 		 245 aa  459  9.999999999999999e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4267  hypothetical protein  97.55 
 
 		 245 aa  457  9.999999999999999e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3969  protein of unknown function DUF1017  97.14 
 
 		 245 aa  456  1e-127  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5507  hypothetical protein  95.91 
 
 		 220 aa  407  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4415  hypothetical protein  74.69 
 
 		 245 aa  367  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0260723 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4566  hypothetical protein  74.29 
 
 		 245 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0427983 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4481  hypothetical protein  73.88 
 
 		 245 aa  363  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4618  hypothetical protein  73.88 
 
 		 245 aa  363  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.36259 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4566  hypothetical protein  73.47 
 
 		 245 aa  361  7.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.942521 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0233  hypothetical protein  65.42 
 
 		 245 aa  332  5e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.739871  normal  0.683835 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2330  group 4 capsule (G4C) polysaccharide, YmcB  41.8 
 
 		 248 aa  195  7e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000702109  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2658  protein of unknown function DUF1017  41.8 
 
 		 248 aa  194  8.000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.125045  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1095  group 4 capsule (G4C) polysaccharide, YmcB  41.8 
 
 		 248 aa  194  8.000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1101  hypothetical protein  41.8 
 
 		 248 aa  194  9e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000190243  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2611  hypothetical protein  41.8 
 
 		 248 aa  194  9e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.285762 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1221  group 4 capsule (G4C) polysaccharide, YmcB  41.8 
 
 		 248 aa  192  3e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000377582  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00995  hypothetical protein  41.39 
 
 		 248 aa  191  6e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00988  hypothetical protein  41.39 
 
 		 248 aa  191  6e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3011  protein of unknown function DUF1017  36.22 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00176721  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1323  hypothetical protein  35.45 
 
 		 260 aa  121  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00489097  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2844  protein of unknown function DUF1017  31.19 
 
 		 259 aa  105  6e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1394  hypothetical protein  31.25 
 
 		 262 aa  100  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.334795  normal  0.0357874 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3203  hypothetical protein  26.51 
 
 		 247 aa  99  7e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.248312  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2862  hypothetical protein  31.58 
 
 		 261 aa  97.8  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00254275  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2522  hypothetical protein  31.05 
 
 		 261 aa  96.7  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.979942  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1406  hypothetical protein  30 
 
 		 261 aa  95.9  5e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0730107 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3158  polysaccharide synthesis-related protein  28.95 
 
 		 261 aa  95.5  7e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2879  hypothetical protein  29.26 
 
 		 261 aa  95.5  7e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000994717  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1497  protein of unknown function DUF1017  29.26 
 
 		 261 aa  95.1  9e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000397908  normal  0.348491 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1341  hypothetical protein  29.47 
 
 		 261 aa  93.6  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280268 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3008  hypothetical protein  30.53 
 
 		 261 aa  92.4  6e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00154991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0273  exported protein  29.08 
 
 		 254 aa  82.4  0.000000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3831  hypothetical protein  29.28 
 
 		 243 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145159  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1942  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  32.45 
 
 		 990 aa  57.8  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3793  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  32.76 
 
 		 1261 aa  56.2  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0790  hypothetical protein  24.4 
 
 		 263 aa  52.4  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000388685  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1197  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  29.73 
 
 		 1031 aa  46.6  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0938466  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1470  polysaccharide export protein  26.71 
 
 		 828 aa  42.4  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.270093  normal  0.749053 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2903  polysaccharide export protein  26.09 
 
 		 828 aa  42  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0690654  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>