79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1942 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3271  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  42.65 
 
 		 981 aa  676    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000771318 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0562  putative lipoprotein  44.06 
 
 		 995 aa  762    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0655  putative lipoprotein  44.27 
 
 		 995 aa  765    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3793  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  48.21 
 
 		 1261 aa  845    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1197  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  64.29 
 
 		 1031 aa  1251    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0938466  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1942  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  100 
 
 		 990 aa  1999    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1988  otnG protein  45.22 
 
 		 972 aa  763    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1957  hypothetical protein  44.16 
 
 		 976 aa  765    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.52891  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3830  hypothetical protein  43.19 
 
 		 692 aa  536  1e-150  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.491022  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0622  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  43.05 
 
 		 704 aa  499  1e-140  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.944587  normal  0.172231 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3010  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  39.88 
 
 		 711 aa  473  1e-132  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0811368  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2843  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  40.52 
 
 		 714 aa  472  1.0000000000000001e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4001  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  40.49 
 
 		 698 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.501947 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03901  predicted porin  40.49 
 
 		 698 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4268  putative lipoprotein  40.49 
 
 		 698 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4577  putative lipoprotein  40.34 
 
 		 698 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3968  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  40.49 
 
 		 698 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03861  hypothetical protein  40.49 
 
 		 698 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4490  putative lipoprotein  40.63 
 
 		 698 aa  462  9.999999999999999e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.197031  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1324  hypothetical protein  38.8 
 
 		 707 aa  461  9.999999999999999e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0971322  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0234  protein of unknown function DUF940, membrane lipoprotein putative  39.74 
 
 		 698 aa  458  1e-127  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.261966  normal  0.795052 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5508  putative lipoprotein  40.34 
 
 		 698 aa  458  1e-127  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4416  putative lipoprotein  39.71 
 
 		 698 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00872007 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4534  putative lipoprotein  40.2 
 
 		 698 aa  455  1.0000000000000001e-126  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4567  hypothetical protein  40.49 
 
 		 698 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4482  putative lipoprotein  40.49 
 
 		 698 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4567  putative lipoprotein  40.49 
 
 		 698 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0407808 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4619  putative lipoprotein  40.23 
 
 		 698 aa  452  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.264155 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1220  group 4 capsule (G4C) polysaccharide, lipoprotein YmcA  36.61 
 
 		 698 aa  421  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.221159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00994  hypothetical protein  36.61 
 
 		 698 aa  421  1e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.579327  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2659  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  36.61 
 
 		 698 aa  421  1e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.627573  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00987  hypothetical protein  36.61 
 
 		 698 aa  421  1e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.570303  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2331  group 4 capsule (G4C) polysaccharide, lipoprotein YmcA  36.47 
 
 		 698 aa  417  9.999999999999999e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0175694  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1100  putative lipoprotein  36.47 
 
 		 698 aa  419  9.999999999999999e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000283617  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2612  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  36.19 
 
 		 698 aa  415  1e-114  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.161278 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3204  protein of unknown function DUF940, membrane lipoprotein putative  36.07 
 
 		 709 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.497795  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2523  protein of unknown function DUF940, membrane lipoprotein putative  35.25 
 
 		 788 aa  403  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2880  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  34.71 
 
 		 789 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000128107  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1496  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  34.71 
 
 		 789 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.174983  normal  0.482942 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2863  hypothetical protein  35.7 
 
 		 787 aa  398  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.126176  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3009  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  35.48 
 
 		 787 aa  399  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.383324  normal  0.742056 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3159  hypothetical protein  35.57 
 
 		 792 aa  395  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1393  protein of unknown function DUF940, membrane lipoprotein putative  34.67 
 
 		 791 aa  391  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.244173  normal  0.032631 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1405  protein of unknown function DUF940, membrane lipoprotein putative  34.49 
 
 		 787 aa  391  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0951062 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1340  protein of unknown function DUF940, membrane lipoprotein putative  34.37 
 
 		 787 aa  391  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235359 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00054  Fusion of WbfC- and WbfB-like uncharacterized  36.22 
 
 		 700 aa  389  1e-106  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.312192  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0789  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  34.5 
 
 		 737 aa  384  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.298887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001791  YjbH outer membrane lipoprotein  34.36 
 
 		 731 aa  383  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00683  hypothetical protein  33.98 
 
 		 720 aa  377  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0272  putative outer membrane protein  34.14 
 
 		 735 aa  371  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.635582  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3858  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  31.17 
 
 		 746 aa  285  3.0000000000000004e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00089637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1187  hypothetical protein  32.34 
 
 		 722 aa  285  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2849  protein of unknown function DUF940, membrane lipoprotein putative  32.17 
 
 		 722 aa  284  5.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.801609 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4134  protein of unknown function DUF940, membrane lipoprotein putative  29.57 
 
 		 731 aa  265  4e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.337752  normal  0.233467 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2626  protein of unknown function DUF940, membrane lipoprotein putative  32 
 
 		 720 aa  244  6e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3831  hypothetical protein  27.69 
 
 		 243 aa  57.8  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145159  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4533  hypothetical protein  32.24 
 
 		 245 aa  52.4  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03900  hypothetical protein  32.24 
 
 		 245 aa  52.4  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4002  hypothetical protein  32.24 
 
 		 245 aa  52.4  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.413417 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4489  hypothetical protein  32.45 
 
 		 245 aa  52  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03860  hypothetical protein  32.24 
 
 		 245 aa  52.4  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4576  hypothetical protein  32.24 
 
 		 245 aa  51.6  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4267  hypothetical protein  32.24 
 
 		 245 aa  51.6  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5507  hypothetical protein  32.24 
 
 		 220 aa  51.2  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3969  protein of unknown function DUF1017  34.96 
 
 		 245 aa  50.4  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3008  hypothetical protein  28.21 
 
 		 261 aa  50.1  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00154991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2862  hypothetical protein  28.21 
 
 		 261 aa  50.4  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00254275  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4415  hypothetical protein  30.48 
 
 		 245 aa  48.1  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0260723 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2522  hypothetical protein  30.7 
 
 		 261 aa  47.8  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.979942  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4566  hypothetical protein  29.95 
 
 		 245 aa  47.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0427983 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00988  hypothetical protein  24.81 
 
 		 248 aa  46.6  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00995  hypothetical protein  24.81 
 
 		 248 aa  46.6  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0233  hypothetical protein  28.57 
 
 		 245 aa  46.6  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.739871  normal  0.683835 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4618  hypothetical protein  29.79 
 
 		 245 aa  47  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.36259 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4481  hypothetical protein  29.95 
 
 		 245 aa  47  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4566  hypothetical protein  32.52 
 
 		 245 aa  45.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.942521 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1394  hypothetical protein  34.07 
 
 		 262 aa  45.4  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.334795  normal  0.0357874 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1341  hypothetical protein  29.37 
 
 		 261 aa  45.1  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280268 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1406  hypothetical protein  30.23 
 
 		 261 aa  44.7  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0730107 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>