57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E4534 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A4416  putative lipoprotein  91.55 
 
 
698 aa  1355    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00872007 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4268  putative lipoprotein  99.28 
 
 
698 aa  1435    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1100  putative lipoprotein  64.22 
 
 
698 aa  946    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000283617  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4577  putative lipoprotein  99 
 
 
698 aa  1429    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2612  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  63.94 
 
 
698 aa  941    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.161278 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4001  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  99.43 
 
 
698 aa  1436    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.501947 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4490  putative lipoprotein  98.85 
 
 
698 aa  1432    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.197031  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2331  group 4 capsule (G4C) polysaccharide, lipoprotein YmcA  64.22 
 
 
698 aa  944    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0175694  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4534  putative lipoprotein  100 
 
 
698 aa  1445    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4567  putative lipoprotein  91.69 
 
 
698 aa  1355    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0407808 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4567  hypothetical protein  91.83 
 
 
698 aa  1357    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03901  predicted porin  99.28 
 
 
698 aa  1434    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4482  putative lipoprotein  91.98 
 
 
698 aa  1358    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4619  putative lipoprotein  91.98 
 
 
698 aa  1357    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.264155 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1220  group 4 capsule (G4C) polysaccharide, lipoprotein YmcA  64.22 
 
 
698 aa  943    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.221159  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5508  putative lipoprotein  98.85 
 
 
698 aa  1431    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00994  hypothetical protein  64.22 
 
 
698 aa  943    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.579327  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03861  hypothetical protein  99.28 
 
 
698 aa  1434    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2843  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  51.77 
 
 
714 aa  684    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1324  hypothetical protein  53.21 
 
 
707 aa  706    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0971322  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3010  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  52.37 
 
 
711 aa  697    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0811368  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0234  protein of unknown function DUF940, membrane lipoprotein putative  90.97 
 
 
698 aa  1344    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.261966  normal  0.795052 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00987  hypothetical protein  64.22 
 
 
698 aa  943    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.570303  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2659  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  64.22 
 
 
698 aa  942    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.627573  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3968  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  99.28 
 
 
698 aa  1434    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00054  Fusion of WbfC- and WbfB-like uncharacterized  45.62 
 
 
700 aa  603  1.0000000000000001e-171  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.312192  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3204  protein of unknown function DUF940, membrane lipoprotein putative  45.98 
 
 
709 aa  597  1e-169  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.497795  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1340  protein of unknown function DUF940, membrane lipoprotein putative  44.96 
 
 
787 aa  585  1e-166  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235359 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3159  hypothetical protein  44.44 
 
 
792 aa  585  1e-166  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1393  protein of unknown function DUF940, membrane lipoprotein putative  45.23 
 
 
791 aa  588  1e-166  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.244173  normal  0.032631 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2880  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  43.97 
 
 
789 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000128107  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1405  protein of unknown function DUF940, membrane lipoprotein putative  44.83 
 
 
787 aa  582  1e-164  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0951062 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3009  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  44.56 
 
 
787 aa  580  1e-164  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.383324  normal  0.742056 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2863  hypothetical protein  43.9 
 
 
787 aa  579  1e-164  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.126176  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1496  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  44.11 
 
 
789 aa  582  1e-164  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.174983  normal  0.482942 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0272  putative outer membrane protein  43.5 
 
 
735 aa  575  1.0000000000000001e-163  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.635582  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2523  protein of unknown function DUF940, membrane lipoprotein putative  43.58 
 
 
788 aa  569  1e-161  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0789  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  43.27 
 
 
737 aa  544  1e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.298887  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00683  hypothetical protein  41.81 
 
 
720 aa  540  9.999999999999999e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001791  YjbH outer membrane lipoprotein  40.61 
 
 
731 aa  532  1e-150  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3830  hypothetical protein  43.13 
 
 
692 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.491022  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0622  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  40.96 
 
 
704 aa  468  9.999999999999999e-131  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.944587  normal  0.172231 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1942  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  40.26 
 
 
990 aa  451  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1197  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  39.17 
 
 
1031 aa  441  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0938466  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1957  hypothetical protein  40.14 
 
 
976 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.52891  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0655  putative lipoprotein  40.14 
 
 
995 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0562  putative lipoprotein  40 
 
 
995 aa  435  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1988  otnG protein  39.11 
 
 
972 aa  429  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3793  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  39.82 
 
 
1261 aa  427  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3271  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  36.23 
 
 
981 aa  384  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000771318 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3858  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  31 
 
 
746 aa  278  2e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00089637  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1187  hypothetical protein  28.79 
 
 
722 aa  252  1e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2849  protein of unknown function DUF940, membrane lipoprotein putative  28.37 
 
 
722 aa  251  3e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.801609 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4134  protein of unknown function DUF940, membrane lipoprotein putative  29.7 
 
 
731 aa  248  4e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.337752  normal  0.233467 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2626  protein of unknown function DUF940, membrane lipoprotein putative  29.09 
 
 
720 aa  230  6e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0513  hypothetical protein  27.46 
 
 
758 aa  45.4  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2795  hypothetical protein  27.95 
 
 
792 aa  43.9  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>