23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0513 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0513  hypothetical protein  100 
 
 
758 aa  1551    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2795  hypothetical protein  72.79 
 
 
792 aa  1135    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1104  hypothetical protein  70.58 
 
 
794 aa  1108    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1666  hypothetical protein  26.76 
 
 
699 aa  185  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1434  hypothetical protein  23.96 
 
 
689 aa  168  4e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0569  hypothetical protein  25.13 
 
 
694 aa  167  5.9999999999999996e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001762  hypothetical protein  26.54 
 
 
620 aa  162  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1228  hypothetical protein  26.21 
 
 
672 aa  123  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.566798 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4619  putative lipoprotein  26.42 
 
 
698 aa  48.5  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.264155 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4482  putative lipoprotein  26.42 
 
 
698 aa  48.5  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4416  putative lipoprotein  26.42 
 
 
698 aa  48.5  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00872007 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4567  putative lipoprotein  26.42 
 
 
698 aa  48.5  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0407808 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4567  hypothetical protein  26.42 
 
 
698 aa  48.5  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4577  putative lipoprotein  27.46 
 
 
698 aa  45.4  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03861  hypothetical protein  27.46 
 
 
698 aa  45.8  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5508  putative lipoprotein  27.46 
 
 
698 aa  45.8  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4534  putative lipoprotein  27.46 
 
 
698 aa  45.4  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4490  putative lipoprotein  27.46 
 
 
698 aa  45.8  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.197031  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4001  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  27.46 
 
 
698 aa  45.8  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.501947 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03901  predicted porin  27.46 
 
 
698 aa  45.8  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4268  putative lipoprotein  27.46 
 
 
698 aa  45.8  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3968  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  27.46 
 
 
698 aa  45.8  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0234  protein of unknown function DUF940, membrane lipoprotein putative  23.9 
 
 
698 aa  44.7  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.261966  normal  0.795052 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>