15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1104 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0513  hypothetical protein  70.58 
 
 
758 aa  1119    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2795  hypothetical protein  85 
 
 
792 aa  1354    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1104  hypothetical protein  100 
 
 
794 aa  1619    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0569  hypothetical protein  27.96 
 
 
694 aa  204  5e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1666  hypothetical protein  27.56 
 
 
699 aa  194  4e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001762  hypothetical protein  25.53 
 
 
620 aa  156  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1434  hypothetical protein  23.33 
 
 
689 aa  154  5.9999999999999996e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1228  hypothetical protein  26.47 
 
 
672 aa  140  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.566798 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4482  putative lipoprotein  28.83 
 
 
698 aa  45.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4567  putative lipoprotein  28.83 
 
 
698 aa  44.7  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0407808 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4567  hypothetical protein  28.83 
 
 
698 aa  45.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4416  putative lipoprotein  28.83 
 
 
698 aa  45.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00872007 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4619  putative lipoprotein  28.83 
 
 
698 aa  45.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.264155 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3159  hypothetical protein  22.22 
 
 
792 aa  44.7  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0234  protein of unknown function DUF940, membrane lipoprotein putative  26.67 
 
 
698 aa  44.3  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.261966  normal  0.795052 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>