23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1666 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1666  hypothetical protein  100 
 
 		 699 aa  1436    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0569  hypothetical protein  30.51 
 
 		 694 aa  275  2.0000000000000002e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1434  hypothetical protein  28.63 
 
 		 689 aa  270  5.9999999999999995e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1228  hypothetical protein  30.59 
 
 		 672 aa  257  6e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.566798 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1104  hypothetical protein  27.59 
 
 		 794 aa  192  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0513  hypothetical protein  26.76 
 
 		 758 aa  185  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001762  hypothetical protein  25.49 
 
 		 620 aa  181  4.999999999999999e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2795  hypothetical protein  26.9 
 
 		 792 aa  174  6.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00054  Fusion of WbfC- and WbfB-like uncharacterized  26.67 
 
 		 700 aa  48.5  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.312192  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3858  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  24.28 
 
 		 746 aa  48.1  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00089637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3271  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  30 
 
 		 981 aa  46.6  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000771318 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1187  hypothetical protein  25.41 
 
 		 722 aa  45.8  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2880  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  28.89 
 
 		 789 aa  45.4  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000128107  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4567  putative lipoprotein  27.56 
 
 		 698 aa  45.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0407808 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4567  hypothetical protein  27.56 
 
 		 698 aa  45.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4416  putative lipoprotein  27.56 
 
 		 698 aa  45.8  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00872007 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4482  putative lipoprotein  27.56 
 
 		 698 aa  45.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4619  putative lipoprotein  27.56 
 
 		 698 aa  45.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.264155 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1496  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  28.89 
 
 		 789 aa  45.4  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.174983  normal  0.482942 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3009  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  27.94 
 
 		 787 aa  45.1  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.383324  normal  0.742056 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0272  putative outer membrane protein  26.92 
 
 		 735 aa  45.1  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.635582  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2849  protein of unknown function DUF940, membrane lipoprotein putative  24.86 
 
 		 722 aa  44.7  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.801609 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2523  protein of unknown function DUF940, membrane lipoprotein putative  29.32 
 
 		 788 aa  44.3  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>