55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1324 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010468  EcolC_4001  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  53.21 
 
 		 698 aa  709    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.501947 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1324  hypothetical protein  100 
 
 		 707 aa  1463    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0971322  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0234  protein of unknown function DUF940, membrane lipoprotein putative  52.47 
 
 		 698 aa  706    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.261966  normal  0.795052 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4482  putative lipoprotein  50.28 
 
 		 698 aa  702    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4268  putative lipoprotein  53.21 
 
 		 698 aa  708    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1100  putative lipoprotein  50.84 
 
 		 698 aa  707    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000283617  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4577  putative lipoprotein  53.06 
 
 		 698 aa  707    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2843  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  67.13 
 
 		 714 aa  1009    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2612  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  50.7 
 
 		 698 aa  705    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.161278 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03901  predicted porin  53.36 
 
 		 698 aa  711    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4490  putative lipoprotein  53.06 
 
 		 698 aa  709    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.197031  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03861  hypothetical protein  53.36 
 
 		 698 aa  711    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2331  group 4 capsule (G4C) polysaccharide, lipoprotein YmcA  50.84 
 
 		 698 aa  706    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0175694  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4534  putative lipoprotein  53.21 
 
 		 698 aa  706    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4567  putative lipoprotein  50.14 
 
 		 698 aa  701    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0407808 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4567  hypothetical protein  50.14 
 
 		 698 aa  701    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4416  putative lipoprotein  50.28 
 
 		 698 aa  702    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00872007 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4619  putative lipoprotein  50.28 
 
 		 698 aa  701    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.264155 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2659  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  50.84 
 
 		 698 aa  708    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.627573  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3010  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  90.18 
 
 		 711 aa  1335    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0811368  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1220  group 4 capsule (G4C) polysaccharide, lipoprotein YmcA  50.98 
 
 		 698 aa  710    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.221159  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3968  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  53.21 
 
 		 698 aa  709    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00994  hypothetical protein  50.98 
 
 		 698 aa  710    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.579327  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5508  putative lipoprotein  52.91 
 
 		 698 aa  707    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00987  hypothetical protein  50.98 
 
 		 698 aa  710    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.570303  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00054  Fusion of WbfC- and WbfB-like uncharacterized  47.52 
 
 		 700 aa  628  1e-178  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.312192  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0789  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  45.02 
 
 		 737 aa  611  1e-173  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.298887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2880  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  44.1 
 
 		 789 aa  610  1e-173  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000128107  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1496  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  43.9 
 
 		 789 aa  609  1e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.174983  normal  0.482942 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3204  protein of unknown function DUF940, membrane lipoprotein putative  45.1 
 
 		 709 aa  610  1e-173  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.497795  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1340  protein of unknown function DUF940, membrane lipoprotein putative  43.87 
 
 		 787 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235359 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0272  putative outer membrane protein  45.32 
 
 		 735 aa  603  1.0000000000000001e-171  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.635582  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1405  protein of unknown function DUF940, membrane lipoprotein putative  43.87 
 
 		 787 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0951062 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2863  hypothetical protein  43.34 
 
 		 787 aa  599  1e-170  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.126176  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3009  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  43.61 
 
 		 787 aa  595  1e-169  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.383324  normal  0.742056 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3159  hypothetical protein  43.57 
 
 		 792 aa  595  1e-169  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1393  protein of unknown function DUF940, membrane lipoprotein putative  43.5 
 
 		 791 aa  597  1e-169  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.244173  normal  0.032631 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2523  protein of unknown function DUF940, membrane lipoprotein putative  43.45 
 
 		 788 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00683  hypothetical protein  43.4 
 
 		 720 aa  559  1e-158  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001791  YjbH outer membrane lipoprotein  42.19 
 
 		 731 aa  552  1e-156  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3830  hypothetical protein  44.25 
 
 		 692 aa  542  1e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.491022  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0562  putative lipoprotein  40.17 
 
 		 995 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0655  putative lipoprotein  40.32 
 
 		 995 aa  484  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1988  otnG protein  40.17 
 
 		 972 aa  485  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1957  hypothetical protein  40.17 
 
 		 976 aa  482  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.52891  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1197  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  41.44 
 
 		 1031 aa  479  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0938466  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0622  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  39.55 
 
 		 704 aa  462  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.944587  normal  0.172231 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1942  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  38.94 
 
 		 990 aa  459  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3793  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  39.38 
 
 		 1261 aa  461  9.999999999999999e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3271  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  37.67 
 
 		 981 aa  391  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000771318 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3858  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  29.73 
 
 		 746 aa  273  1e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00089637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2849  protein of unknown function DUF940, membrane lipoprotein putative  29.62 
 
 		 722 aa  270  8e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.801609 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1187  hypothetical protein  29.49 
 
 		 722 aa  269  1e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2626  protein of unknown function DUF940, membrane lipoprotein putative  28.97 
 
 		 720 aa  243  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4134  protein of unknown function DUF940, membrane lipoprotein putative  29.76 
 
 		 731 aa  243  1e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.337752  normal  0.233467 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>