56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0273 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0273  exported protein  100 
 
 		 254 aa  508  1e-143  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3008  hypothetical protein  31.74 
 
 		 261 aa  112  6e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00154991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1497  protein of unknown function DUF1017  31.66 
 
 		 261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000397908  normal  0.348491 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2879  hypothetical protein  31.66 
 
 		 261 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000994717  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2522  hypothetical protein  30.6 
 
 		 261 aa  105  6e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.979942  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2862  hypothetical protein  30.43 
 
 		 261 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00254275  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3158  polysaccharide synthesis-related protein  30.8 
 
 		 261 aa  101  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1341  hypothetical protein  30.7 
 
 		 261 aa  101  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280268 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1406  hypothetical protein  30.7 
 
 		 261 aa  101  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0730107 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1394  hypothetical protein  29.17 
 
 		 262 aa  96.7  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.334795  normal  0.0357874 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0790  hypothetical protein  27.07 
 
 		 263 aa  90.5  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000388685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4481  hypothetical protein  28.87 
 
 		 245 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4415  hypothetical protein  28.87 
 
 		 245 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0260723 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4618  hypothetical protein  27.84 
 
 		 245 aa  83.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.36259 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3969  protein of unknown function DUF1017  29.59 
 
 		 245 aa  82.8  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4002  hypothetical protein  29.59 
 
 		 245 aa  82.4  0.000000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.413417 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5507  hypothetical protein  29.59 
 
 		 220 aa  82.4  0.000000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03900  hypothetical protein  29.59 
 
 		 245 aa  82.4  0.000000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03860  hypothetical protein  29.59 
 
 		 245 aa  82.4  0.000000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4533  hypothetical protein  30.1 
 
 		 245 aa  82  0.000000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4267  hypothetical protein  30.1 
 
 		 245 aa  82.4  0.000000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4576  hypothetical protein  30.1 
 
 		 245 aa  82.4  0.000000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4566  hypothetical protein  28.87 
 
 		 245 aa  82  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.942521 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0233  hypothetical protein  28.21 
 
 		 245 aa  81.3  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.739871  normal  0.683835 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4566  hypothetical protein  27.84 
 
 		 245 aa  80.1  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0427983 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1095  group 4 capsule (G4C) polysaccharide, YmcB  29.08 
 
 		 248 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1101  hypothetical protein  29.08 
 
 		 248 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000190243  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2330  group 4 capsule (G4C) polysaccharide, YmcB  29.08 
 
 		 248 aa  80.5  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000702109  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2611  hypothetical protein  29.08 
 
 		 248 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.285762 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2658  protein of unknown function DUF1017  29.08 
 
 		 248 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.125045  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00995  hypothetical protein  29.15 
 
 		 248 aa  79  0.00000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4489  hypothetical protein  29.59 
 
 		 245 aa  78.6  0.00000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00988  hypothetical protein  29.15 
 
 		 248 aa  79  0.00000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1221  group 4 capsule (G4C) polysaccharide, YmcB  29.08 
 
 		 248 aa  78.6  0.00000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000377582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3203  hypothetical protein  23.85 
 
 		 247 aa  68.2  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.248312  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3011  protein of unknown function DUF1017  25.38 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00176721  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00684  hypothetical protein  24.27 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1323  hypothetical protein  24.49 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00489097  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001790  hypothetical protein  26.32 
 
 		 251 aa  57  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2903  polysaccharide export protein  27.94 
 
 		 828 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0690654  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1315  polysaccharide export protein  27.49 
 
 		 837 aa  52.4  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0893778 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1382  polysaccharide export protein  27.49 
 
 		 837 aa  52  0.000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1470  polysaccharide export protein  26.47 
 
 		 828 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.270093  normal  0.749053 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3035  polysaccharide export protein  26.47 
 
 		 828 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.636336  normal  0.407015 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0277  polysaccharide export periplasmic protein  24.87 
 
 		 869 aa  49.3  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1375  polysaccharide export protein  27.08 
 
 		 837 aa  49.3  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193694  decreased coverage  0.0000028911 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2844  protein of unknown function DUF1017  21.3 
 
 		 259 aa  48.1  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0794  polysaccharide export protein  24.08 
 
 		 869 aa  46.2  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.020437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1395  polysaccharide export protein  27.21 
 
 		 931 aa  45.8  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0391429  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2843  polysaccharide export protein  26.7 
 
 		 910 aa  45.8  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427616  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3793  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  28.21 
 
 		 1261 aa  45.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0473  polysaccharide export protein  25.67 
 
 		 824 aa  44.7  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2671  polysaccharide export protein  25.93 
 
 		 919 aa  43.5  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2543  polysaccharide export protein  25 
 
 		 919 aa  43.1  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.941823  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2893  polysaccharide export protein  26.47 
 
 		 912 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.325033  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3032  polysaccharide export protein  27.01 
 
 		 922 aa  42.4  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190653  normal  0.0184914 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>