38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1323 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1323  hypothetical protein  100 
 
 		 260 aa  525  1e-148  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00489097  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3011  protein of unknown function DUF1017  93.08 
 
 		 260 aa  493  9.999999999999999e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00176721  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2844  protein of unknown function DUF1017  49.61 
 
 		 259 aa  268  5e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2611  hypothetical protein  31.78 
 
 		 248 aa  120  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.285762 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00995  hypothetical protein  33.83 
 
 		 248 aa  120  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00988  hypothetical protein  33.83 
 
 		 248 aa  120  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1101  hypothetical protein  31.78 
 
 		 248 aa  120  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000190243  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2658  protein of unknown function DUF1017  31.78 
 
 		 248 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.125045  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1095  group 4 capsule (G4C) polysaccharide, YmcB  31.78 
 
 		 248 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1221  group 4 capsule (G4C) polysaccharide, YmcB  31.78 
 
 		 248 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000377582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2330  group 4 capsule (G4C) polysaccharide, YmcB  31.4 
 
 		 248 aa  118  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000702109  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4489  hypothetical protein  35.45 
 
 		 245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03900  hypothetical protein  35.82 
 
 		 245 aa  112  6e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03860  hypothetical protein  35.82 
 
 		 245 aa  112  6e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4481  hypothetical protein  32.84 
 
 		 245 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4566  hypothetical protein  32.84 
 
 		 245 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0427983 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4002  hypothetical protein  35.82 
 
 		 245 aa  112  6e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.413417 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4415  hypothetical protein  32.84 
 
 		 245 aa  112  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0260723 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4533  hypothetical protein  35.32 
 
 		 245 aa  110  3e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4576  hypothetical protein  35.32 
 
 		 245 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4267  hypothetical protein  35.32 
 
 		 245 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4618  hypothetical protein  32.34 
 
 		 245 aa  109  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.36259 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4566  hypothetical protein  32.34 
 
 		 245 aa  108  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.942521 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3969  protein of unknown function DUF1017  33.46 
 
 		 245 aa  107  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0233  hypothetical protein  31.84 
 
 		 245 aa  106  4e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.739871  normal  0.683835 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5507  hypothetical protein  34.83 
 
 		 220 aa  105  5e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1406  hypothetical protein  27.89 
 
 		 261 aa  77  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0730107 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1341  hypothetical protein  27.49 
 
 		 261 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280268 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1394  hypothetical protein  27.96 
 
 		 262 aa  72  0.000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.334795  normal  0.0357874 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3158  polysaccharide synthesis-related protein  26.29 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2522  hypothetical protein  25.25 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.979942  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2862  hypothetical protein  25.74 
 
 		 261 aa  62.4  0.000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00254275  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3008  hypothetical protein  25.25 
 
 		 261 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00154991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0273  exported protein  24.49 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3203  hypothetical protein  22.04 
 
 		 247 aa  53.1  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.248312  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2879  hypothetical protein  25.1 
 
 		 261 aa  53.1  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000994717  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1497  protein of unknown function DUF1017  24.02 
 
 		 261 aa  52.8  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000397908  normal  0.348491 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3831  hypothetical protein  29.75 
 
 		 243 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145159  normal  0.393051 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>