37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2844 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2844  protein of unknown function DUF1017  100 
 
 
259 aa  530  1e-150  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1323  hypothetical protein  49.61 
 
 
260 aa  280  2e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00489097  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3011  protein of unknown function DUF1017  50 
 
 
260 aa  279  4e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00176721  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1221  group 4 capsule (G4C) polysaccharide, YmcB  33.64 
 
 
248 aa  120  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000377582  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00995  hypothetical protein  32.71 
 
 
248 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00988  hypothetical protein  32.71 
 
 
248 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2611  hypothetical protein  32.71 
 
 
248 aa  117  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.285762 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1101  hypothetical protein  32.71 
 
 
248 aa  117  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000190243  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1095  group 4 capsule (G4C) polysaccharide, YmcB  32.71 
 
 
248 aa  117  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2658  protein of unknown function DUF1017  32.71 
 
 
248 aa  117  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.125045  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2330  group 4 capsule (G4C) polysaccharide, YmcB  32.24 
 
 
248 aa  115  8.999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000702109  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4566  hypothetical protein  29.88 
 
 
245 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0427983 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4618  hypothetical protein  29.88 
 
 
245 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.36259 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4481  hypothetical protein  29.88 
 
 
245 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4415  hypothetical protein  29.48 
 
 
245 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0260723 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4267  hypothetical protein  31.1 
 
 
245 aa  102  6e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4576  hypothetical protein  31.1 
 
 
245 aa  102  6e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03900  hypothetical protein  31.1 
 
 
245 aa  102  7e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03860  hypothetical protein  31.1 
 
 
245 aa  102  7e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4002  hypothetical protein  31.1 
 
 
245 aa  102  7e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.413417 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4489  hypothetical protein  30.47 
 
 
245 aa  102  8e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4566  hypothetical protein  29.48 
 
 
245 aa  101  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.942521 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4533  hypothetical protein  31.89 
 
 
245 aa  99.8  4e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3969  protein of unknown function DUF1017  30.47 
 
 
245 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0233  hypothetical protein  27.69 
 
 
245 aa  97.8  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.739871  normal  0.683835 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5507  hypothetical protein  33.55 
 
 
220 aa  96.3  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2862  hypothetical protein  23.29 
 
 
261 aa  62.4  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00254275  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2522  hypothetical protein  26.67 
 
 
261 aa  62.4  0.000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.979942  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3008  hypothetical protein  22.58 
 
 
261 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00154991  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1406  hypothetical protein  22.89 
 
 
261 aa  59.7  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0730107 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1341  hypothetical protein  22.18 
 
 
261 aa  59.7  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280268 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2879  hypothetical protein  24.1 
 
 
261 aa  55.5  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000994717  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1497  protein of unknown function DUF1017  23.59 
 
 
261 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000397908  normal  0.348491 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3158  polysaccharide synthesis-related protein  22.35 
 
 
261 aa  53.5  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1394  hypothetical protein  23.95 
 
 
262 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.334795  normal  0.0357874 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0273  exported protein  21.39 
 
 
254 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3203  hypothetical protein  22.22 
 
 
247 aa  47.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.248312  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>