47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3203 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3203  hypothetical protein  100 
 
 		 247 aa  508  1e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.248312  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3158  polysaccharide synthesis-related protein  32.38 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1394  hypothetical protein  34.21 
 
 		 262 aa  106  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.334795  normal  0.0357874 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4415  hypothetical protein  29.24 
 
 		 245 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0260723 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4566  hypothetical protein  29.24 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0427983 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4618  hypothetical protein  29.24 
 
 		 245 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.36259 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4481  hypothetical protein  30.04 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1497  protein of unknown function DUF1017  31.13 
 
 		 261 aa  102  4e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000397908  normal  0.348491 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4566  hypothetical protein  29.49 
 
 		 245 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.942521 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1406  hypothetical protein  31.58 
 
 		 261 aa  102  8e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0730107 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1341  hypothetical protein  31.58 
 
 		 261 aa  101  9e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280268 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2879  hypothetical protein  31.13 
 
 		 261 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000994717  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2862  hypothetical protein  34.9 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00254275  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4533  hypothetical protein  26.51 
 
 		 245 aa  97.4  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2522  hypothetical protein  34.54 
 
 		 261 aa  96.7  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.979942  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3008  hypothetical protein  33.85 
 
 		 261 aa  97.1  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00154991  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03860  hypothetical protein  26.51 
 
 		 245 aa  96.3  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4002  hypothetical protein  26.51 
 
 		 245 aa  96.3  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.413417 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03900  hypothetical protein  26.51 
 
 		 245 aa  96.3  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4489  hypothetical protein  26.51 
 
 		 245 aa  95.5  7e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3969  protein of unknown function DUF1017  26.1 
 
 		 245 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4267  hypothetical protein  26.1 
 
 		 245 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4576  hypothetical protein  26.1 
 
 		 245 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5507  hypothetical protein  27.1 
 
 		 220 aa  92  7e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0233  hypothetical protein  26.53 
 
 		 245 aa  89.4  5e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.739871  normal  0.683835 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1101  hypothetical protein  26.19 
 
 		 248 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000190243  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2611  hypothetical protein  26.19 
 
 		 248 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.285762 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2330  group 4 capsule (G4C) polysaccharide, YmcB  26.19 
 
 		 248 aa  81.3  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000702109  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2658  protein of unknown function DUF1017  26.19 
 
 		 248 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.125045  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1221  group 4 capsule (G4C) polysaccharide, YmcB  24.39 
 
 		 248 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000377582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1095  group 4 capsule (G4C) polysaccharide, YmcB  26.19 
 
 		 248 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00988  hypothetical protein  26.19 
 
 		 248 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00995  hypothetical protein  26.19 
 
 		 248 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00052  hypothetical protein  32.14 
 
 		 181 aa  75.5  0.0000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0522077  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3831  hypothetical protein  24.7 
 
 		 243 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145159  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0273  exported protein  23.85 
 
 		 254 aa  68.2  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1323  hypothetical protein  22.04 
 
 		 260 aa  53.1  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00489097  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3011  protein of unknown function DUF1017  23.48 
 
 		 260 aa  51.2  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00176721  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00053  WbfC protein Wbf genes involved in EPS (not LPS)  40.35 
 
 		 60 aa  51.2  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0203788  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1988  otnG protein  30.39 
 
 		 972 aa  49.7  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2844  protein of unknown function DUF1017  22.22 
 
 		 259 aa  47.4  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1957  hypothetical protein  31.37 
 
 		 976 aa  46.6  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.52891  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0655  putative lipoprotein  31.37 
 
 		 995 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0562  putative lipoprotein  31.37 
 
 		 995 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3790  polysaccharide export protein  26.79 
 
 		 803 aa  46.6  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0794  polysaccharide export protein  24.02 
 
 		 869 aa  44.7  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.020437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0648  polysaccharide export protein  30.59 
 
 		 779 aa  43.1  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>