More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1791 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1791  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 151 aa  312  9.999999999999999e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0701164 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2480  MerR family transcriptional regulator  60.4 
 
 		 151 aa  191  3e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0427  MerR family transcriptional regulator  56.74 
 
 		 144 aa  172  9.999999999999999e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0386  MerR family transcriptional regulator  60.47 
 
 		 144 aa  172  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.675924  normal  0.0916275 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2322  transcription regulator protein  30 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.161487 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6119  MerR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529361  normal  0.0458667 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4286  transcriptional regulator, MerR family  30.91 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4396  transcriptional regulator, MerR family  30.91 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.742321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1739  MerR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.784519 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0987  MerR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.758767  hitchhiker  0.000750648 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3790  MerR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0361759  normal  0.548118 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4066  MerR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3133  MerR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.845727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35820  predicted transcriptional regulator  43.94 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1160  MerR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.392851 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2788  MerR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.291885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2967  MerR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0238  MerR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4624  transcriptional regulator, MerR family  26.95 
 
 		 333 aa  56.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4237  MerR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0297  zinc-responsive transcriptional regulator  32.12 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4650  transcriptional regulator, MerR family  36.62 
 
 		 354 aa  55.1  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 252 aa  54.7  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  32.14 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3680  transcriptional regulator, MerR family  33.87 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.446637  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5579  transcriptional regulator, MerR family  30.33 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2399  transcriptional regulator, MerR family  30 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000424023  normal  0.796089 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3411  zinc-responsive transcriptional regulator  39.39 
 
 		 158 aa  53.9  0.0000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4910  putative transcriptional regulator, MerR family  38.89 
 
 		 334 aa  53.5  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.48977  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5280  transcriptional regulator CadR  43.48 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3218  MerR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 336 aa  53.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2999  regulatory protein, MerR  33.8 
 
 		 336 aa  53.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.645753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2189  transcriptional regulator, MerR family  33.04 
 
 		 213 aa  53.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0218623 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  40 
 
 		 252 aa  53.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3455  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 152 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.340256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02983  putative transcription regulator protein  35.56 
 
 		 152 aa  52.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.179274  normal  0.643629 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0713  MerR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.979534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4066  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 152 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3726  MerR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0760  MerR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 267 aa  52.8  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0248072  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0079  transcriptional regulator  30.97 
 
 		 120 aa  52.8  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0702  transcriptional regulator  29.51 
 
 		 119 aa  52.4  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.271355  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4014  MerR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0912  MerR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 125 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1701  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 152 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.201474  normal  0.917872 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0901  MerR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 125 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0327374 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  31.86 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3237  MerR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 137 aa  51.6  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0162  MerR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 119 aa  52  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3408  zinc-responsive transcriptional regulator  35.78 
 
 		 171 aa  52  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2009  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 152 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0895  MerR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 125 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4498  MerR family transcriptional regulator  31 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3184  transcriptional regulator, MerR family  43.75 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4622  transcriptional regulator, MerR family  29.51 
 
 		 144 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.821242  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0073  transcriptional regulator, MerR family  41.43 
 
 		 133 aa  51.2  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2464  transcriptional regulator, MerR family  31.82 
 
 		 137 aa  51.6  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02955  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  31.25 
 
 		 128 aa  51.6  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0202543  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3152  MerR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 131 aa  51.2  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.335124  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4090  putative MerR/CueR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 137 aa  51.6  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.849727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4537  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  39.06 
 
 		 132 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2579  MerR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 143 aa  51.2  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.136218  normal  0.025304 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  33.03 
 
 		 135 aa  51.2  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3620  transcriptional regulator, MerR family  35.9 
 
 		 148 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2494  transcriptional regulator, MerR family  35.9 
 
 		 148 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3828  MerR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 122 aa  50.8  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1491  regulatory protein MerR  27.45 
 
 		 326 aa  50.8  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.924645  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3016  MerR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 252 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0677  MerR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 116 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00486381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00890  predicted transcriptional regulator  29.17 
 
 		 129 aa  50.4  0.000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0094  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  33.62 
 
 		 136 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4838  regulatory protein, MerR  42.03 
 
 		 148 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1369  transcriptional regulator, MerR family  28.81 
 
 		 134 aa  50.4  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000004274 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02170  predicted transcriptional regulator  38.89 
 
 		 133 aa  50.4  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6614  MerR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 128 aa  50.4  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0123  MerR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 143 aa  50.4  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329923  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03143  zinc-responsive transcriptional regulator  30.91 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0421  transcriptional regulator, MerR family  30.91 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  30.91 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0879681  hitchhiker  0.0000172555 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3775  zinc-responsive transcriptional regulator  30.91 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.02383  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3587  zinc-responsive transcriptional regulator  30.91 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.205456  normal  0.141164 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1458  MerR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 161 aa  50.1  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0168574  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3486  zinc-responsive transcriptional regulator  30.91 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0751902  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3346  transcriptional regulator, MerR family  32.38 
 
 		 252 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00536383  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6346  MerR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 128 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3678  zinc-responsive transcriptional regulator  30.91 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4614  zinc-responsive transcriptional regulator  30.91 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000341039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0445  zinc-responsive transcriptional regulator  29.93 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.261357 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2931  MerR family transcriptional regulator  34 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.68732 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0080  transcriptional regulator, MerR family  40.91 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.671013 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1645  regulatory protein, MerR  36.76 
 
 		 154 aa  49.7  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0841182  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6523  MerR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 128 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0471751  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4116  transcriptional regulator, MerR family  28.97 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6110  MerR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.772914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3347  MerR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03094  hypothetical protein  30.91 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6757  MerR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 128 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288009  normal  0.0279244 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02950  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  37.23 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0289893  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>