More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0386 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0386  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 144 aa  291  2e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.675924  normal  0.0916275 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0427  MerR family transcriptional regulator  93.06 
 
 		 144 aa  272  1.0000000000000001e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1791  MerR family transcriptional regulator  60.47 
 
 		 151 aa  172  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0701164 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2480  MerR family transcriptional regulator  63.2 
 
 		 151 aa  163  8e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4286  transcriptional regulator, MerR family  30.51 
 
 		 133 aa  67.4  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4396  transcriptional regulator, MerR family  30.51 
 
 		 133 aa  67.4  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.742321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6119  MerR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529361  normal  0.0458667 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2788  MerR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.291885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2967  MerR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0987  MerR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 160 aa  61.2  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.758767  hitchhiker  0.000750648 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0543  transcriptional regulator, MerR family  30.91 
 
 		 158 aa  60.8  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.166066  hitchhiker  0.000000593111 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0373  transcriptional regulator, MerR family  30.91 
 
 		 158 aa  60.8  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4237  MerR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 136 aa  60.1  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428618  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2322  transcription regulator protein  27.72 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.161487 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1790  transcriptional regulator  35.4 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.269282  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  31.78 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0437  MerR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2470  MerR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4498  MerR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2494  transcriptional regulator, MerR family  40.26 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02950  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  39.8 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0289893  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2699  MerR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 171 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3620  transcriptional regulator, MerR family  40.26 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3184  transcriptional regulator, MerR family  48.44 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02955  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  35.09 
 
 		 128 aa  57  0.00000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0202543  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  32.46 
 
 		 135 aa  57  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  30 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0713  MerR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.979534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0297  zinc-responsive transcriptional regulator  29.63 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4421  MerR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0298638  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0303  transcriptional regulator, MerR family  31.31 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00540997  normal  0.988288 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2464  transcriptional regulator, MerR family  36.08 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2198  MerR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4537  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  40.62 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4650  transcriptional regulator, MerR family  32.29 
 
 		 354 aa  54.3  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2331  MerR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4014  MerR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3704  MerR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5990  mercury resistance regulatory protein MerR  36.11 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.479863 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4910  putative transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 334 aa  53.9  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.48977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0083  putative transcriptional regulator MerR  33.33 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.68539 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0677  MerR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 116 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00486381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0714  putative transcriptional regulator, MerR family  31.9 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2129  putative transcriptional regulator MerR  32.77 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5384  transcriptional regulator, MerR family  31.36 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1739  MerR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 141 aa  53.5  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.784519 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2399  transcriptional regulator, MerR family  31.25 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000424023  normal  0.796089 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3726  MerR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 140 aa  52.8  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  34.38 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2870  transcriptional regulator, MerR family  30.11 
 
 		 119 aa  53.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.368804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3524  MerR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 120 aa  53.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1218  MerR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4384  MerR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3133  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.845727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00890  predicted transcriptional regulator  29.82 
 
 		 129 aa  52.8  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0901  MerR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0327374 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1785  MerR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 134 aa  52.8  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.370686  normal  0.0498641 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1646  MerR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0912  MerR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0895  MerR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0094  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  33.63 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2059  transcriptional regulator, MerR family  29.09 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4360  MerR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2534  transcriptional regulator, MerR family  39.19 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000567314  normal  0.0526863 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2981  MerR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4536  transcriptional regulator, MerR family  29.17 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228678  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4066  MerR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 132 aa  52  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3790  MerR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 132 aa  52  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0361759  normal  0.548118 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 252 aa  51.6  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1416  MerR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 175 aa  51.6  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.185788  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4090  putative MerR/CueR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.849727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0115  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  40 
 
 		 132 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.889131  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4341  putative transcriptional regulator MerR  35.45 
 
 		 151 aa  52  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6344  Hg(II) resistance regulatory protein MerR  33.61 
 
 		 162 aa  51.2  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000851109  unclonable  0.0000000537327 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4947  regulatory protein, MerR  29.41 
 
 		 129 aa  51.2  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.459947  decreased coverage  0.00286067 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1213  transcriptional regulator, MerR family  33.04 
 
 		 144 aa  51.6  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.276419  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3411  zinc-responsive transcriptional regulator  43.48 
 
 		 158 aa  51.6  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4116  transcriptional regulator, MerR family  29.06 
 
 		 133 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0466  MerR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 120 aa  51.6  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2343  MerR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 146 aa  51.2  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1777  MerR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4304  MerR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 164 aa  51.2  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.614703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2341  putative transcriptional regulator MerR  33.61 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1097  transcriptional regulator, MerR family  37.14 
 
 		 133 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3218  MerR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 336 aa  51.2  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0101  putative transcriptional regulator MerR  33.61 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.656805  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6498  putative transcriptional regulator MerR  33.61 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0239269  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2710  MerR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 156 aa  51.2  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6171  putative transcriptional regulator MerR  33.61 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000597544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15480  putative transcriptional regulator MerR  33.61 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000744936  unclonable  4.377399999999999e-22 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5280  transcriptional regulator CadR  40.58 
 
 		 148 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2189  transcriptional regulator, MerR family  33.03 
 
 		 213 aa  50.8  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0218623 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  30.71 
 
 		 252 aa  50.8  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2232  putative transcriptional regulator MerR  35.45 
 
 		 144 aa  50.8  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.620327  normal  0.3464 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2233  MerR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 138 aa  50.8  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35820  predicted transcriptional regulator  32.2 
 
 		 134 aa  50.8  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0203  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  29.09 
 
 		 135 aa  50.4  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1217  putative transcriptional regulator MerR  33.33 
 
 		 144 aa  50.8  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0073  transcriptional regulator, MerR family  39.76 
 
 		 133 aa  50.4  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0168  putative transcriptional regulator MerR  33.64 
 
 		 144 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>