More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_2480 on replicon NC_007968
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007968  Pcryo_2480  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 151 aa  317  3e-86  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1791  MerR family transcriptional regulator  60.4 
 
 		 151 aa  191  3e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0701164 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0427  MerR family transcriptional regulator  60.61 
 
 		 144 aa  166  1e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0386  MerR family transcriptional regulator  63.2 
 
 		 144 aa  163  9e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.675924  normal  0.0916275 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4498  MerR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0987  MerR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.758767  hitchhiker  0.000750648 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4286  transcriptional regulator, MerR family  31.25 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4396  transcriptional regulator, MerR family  31.25 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.742321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2189  transcriptional regulator, MerR family  31.2 
 
 		 213 aa  57.4  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0218623 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6119  MerR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529361  normal  0.0458667 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2788  MerR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.291885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4237  MerR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1739  MerR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.784519 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2967  MerR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02170  predicted transcriptional regulator  31.11 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2322  transcription regulator protein  32.22 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.161487 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3524  MerR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 120 aa  54.7  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3184  transcriptional regulator, MerR family  35.71 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3620  transcriptional regulator, MerR family  38.46 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2494  transcriptional regulator, MerR family  38.46 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453842  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  32.63 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2675  MerR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.995117  normal  0.398735 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0713  MerR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.979534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2331  MerR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 153 aa  53.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3704  MerR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0486  MerR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 135 aa  52.8  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2059  transcriptional regulator, MerR family  31.07 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0297  zinc-responsive transcriptional regulator  36.79 
 
 		 159 aa  52.4  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2399  transcriptional regulator, MerR family  31.3 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000424023  normal  0.796089 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2464  transcriptional regulator, MerR family  29.77 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5990  mercury resistance regulatory protein MerR  34.55 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.479863 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3329  zinc-responsive transcriptional regulator  35.51 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.886267 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2009  transcriptional regulator, MerR family  28.32 
 
 		 152 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3411  zinc-responsive transcriptional regulator  42.5 
 
 		 158 aa  52  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1701  transcriptional regulator, MerR family  28.32 
 
 		 152 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.201474  normal  0.917872 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3408  zinc-responsive transcriptional regulator  34.82 
 
 		 171 aa  51.2  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3828  MerR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 122 aa  51.2  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4304  MerR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 164 aa  51.2  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.614703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3133  MerR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.845727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  31.58 
 
 		 129 aa  51.2  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3680  transcriptional regulator, MerR family  30.63 
 
 		 133 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.446637  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0373  transcriptional regulator, MerR family  32.67 
 
 		 158 aa  50.8  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0162  MerR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 119 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0543  transcriptional regulator, MerR family  32.67 
 
 		 158 aa  50.8  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.166066  hitchhiker  0.000000593111 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5026  MerR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 121 aa  50.8  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5294  transcriptional regulator, MerR family  29.51 
 
 		 122 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5407  MerR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 121 aa  50.8  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4871  MerR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 122 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4090  putative MerR/CueR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 137 aa  50.4  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.849727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4537  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  28.57 
 
 		 132 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5264  transcriptional regulator, MerR family  29.51 
 
 		 122 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5339  transcriptional regulator, MerR family  29.51 
 
 		 122 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0433  zinc-responsive transcriptional regulator  37.37 
 
 		 173 aa  50.4  0.000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5281  MerR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 122 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2699  MerR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 171 aa  50.4  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35820  predicted transcriptional regulator  41.18 
 
 		 134 aa  50.4  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5663  transcriptional regulator, MerR family  29.51 
 
 		 122 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4014  MerR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4856  MerR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 122 aa  50.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0677  MerR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00486381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0912  MerR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 125 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4798  MerR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2470  MerR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0895  MerR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 125 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0024  MerR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 156 aa  49.7  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00394  putative Zn(II)-responsive transcriptional regulator, regulates Zn export (MerR family) protein  30.77 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0901  MerR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 125 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0327374 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  29.84 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_003296  RS02983  putative transcription regulator protein  28.45 
 
 		 152 aa  49.7  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.179274  normal  0.643629 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5384  transcriptional regulator, MerR family  40.3 
 
 		 149 aa  49.7  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2841  zinc-responsive transcriptional regulator  38.64 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0481985  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00890  predicted transcriptional regulator  26.13 
 
 		 129 aa  49.7  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2718  transcriptional regulator, MerR family  32.1 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.654055  hitchhiker  0.0000347436 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2357  MerR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 136 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.120567 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2836  transcriptional regulator, MerR family  30.71 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0211  transcriptional regulator, MerR family protein  33.64 
 
 		 148 aa  49.7  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0608  zinc-responsive transcriptional regulator  30 
 
 		 144 aa  49.7  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000357731  normal  0.723537 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3888  zinc-responsive transcriptional regulator  30 
 
 		 141 aa  49.7  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00039361  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0310  zinc-responsive transcriptional regulator  30 
 
 		 141 aa  49.7  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3790  MerR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0361759  normal  0.548118 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4066  MerR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3912  zinc-responsive transcriptional regulator  32.14 
 
 		 171 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1338  MerR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.683374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  32.14 
 
 		 176 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4035  zinc-responsive transcriptional regulator  32.14 
 
 		 176 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3839  zinc-responsive transcriptional regulator  32.14 
 
 		 171 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.231012 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6523  MerR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0471751  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6757  MerR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288009  normal  0.0279244 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0445  zinc-responsive transcriptional regulator  33.9 
 
 		 159 aa  48.5  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.261357 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6346  MerR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4517  zinc-responsive transcriptional regulator  30.91 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00152846  hitchhiker  0.0000330659 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  40.91 
 
 		 155 aa  48.1  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2841  transcriptional regulator, MerR family  25.98 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.429169  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1724  MerR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.232228 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1930  MerR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 123 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3005  MerR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.44472  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4970  MerR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 122 aa  48.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0525  putative transcriptional regulator, MerR family  32.29 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0178502 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1777  MerR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02950  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  35.71 
 
 		 131 aa  47.8  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0289893  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>