161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04190 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_04190  oxidoreductase  100 
 
 
527 aa  1087    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1626  oxidoreductase  51.21 
 
 
539 aa  478  1e-134  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.498473  normal  0.638708 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1749  oxidoreductase  52.06 
 
 
535 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0726127  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2199  oxidoreductase  50.74 
 
 
539 aa  466  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0323008  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1678  oxidoreductase  51.58 
 
 
538 aa  465  1e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00133842  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10158  short-chain dehydrogenase  47.01 
 
 
509 aa  459  9.999999999999999e-129  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44390  predicted protein  46.86 
 
 
433 aa  374  1e-102  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0516105 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5303  oxidoreductase  42.28 
 
 
463 aa  340  2.9999999999999998e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45855  predicted protein  42.8 
 
 
650 aa  340  4e-92  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.306932  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1055  oxidoreductase  42.56 
 
 
507 aa  332  8e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.730863  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0884  putative short chain dehydrogenase  39.85 
 
 
570 aa  321  1.9999999999999998e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.51688 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0270  putative short chain dehydrogenase  45.2 
 
 
503 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0850168  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4441  putative short chain dehydrogenase  46.97 
 
 
474 aa  316  6e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00730  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  45.52 
 
 
529 aa  316  6e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00530  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  40.31 
 
 
482 aa  314  2.9999999999999996e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.191096  normal  0.164201 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2139  putative short chain dehydrogenase  44.98 
 
 
483 aa  308  1.0000000000000001e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.538588  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1886  putative oxidoreductase  44.61 
 
 
483 aa  307  3e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00334435 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7573  putative short chain dehydrogenase  41.73 
 
 
454 aa  305  1.0000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4871  putative short chain dehydrogenase  45.52 
 
 
495 aa  304  3.0000000000000004e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00534901  normal  0.736841 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4251  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  47.04 
 
 
447 aa  303  5.000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.044314  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2123  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.02 
 
 
485 aa  303  6.000000000000001e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2398  oxidoreductase  45.06 
 
 
437 aa  296  7e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.683331 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1920  putative short chain dehydrogenase  45.34 
 
 
500 aa  295  1e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1517  oxidoreductase  45.32 
 
 
492 aa  295  1e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2783  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.21 
 
 
327 aa  57.8  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1139  short-chain alcohol dehydrogenase-like protein  38.3 
 
 
266 aa  56.2  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33 
 
 
295 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.87 
 
 
341 aa  52.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.29527  normal  0.178629 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1674  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.79 
 
 
254 aa  52.4  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0665  short chain dehydrogenase  37.37 
 
 
301 aa  52.4  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000125417  hitchhiker  0.00844242 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0513  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.27 
 
 
233 aa  50.8  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0498  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  34.95 
 
 
252 aa  51.2  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.726139  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1253  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  35.35 
 
 
255 aa  50.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4023  short chain dehydrogenase  30.48 
 
 
671 aa  50.8  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.367232  normal  0.629555 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3494  short chain dehydrogenase  29.63 
 
 
664 aa  50.4  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.447449 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15620  oxidoreductase  30.07 
 
 
320 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000160845  hitchhiker  2.2896399999999997e-20 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0491  short chain dehydrogenase  27.36 
 
 
668 aa  50.1  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0442129 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1601  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  32.63 
 
 
246 aa  49.3  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0250629  normal  0.870822 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.08 
 
 
239 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.71 
 
 
265 aa  49.3  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.76513  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3915  acetoacetyl-CoA reductase  37.76 
 
 
252 aa  48.9  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_88990  predicted protein  32.61 
 
 
363 aa  48.9  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0137755 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_89854  predicted protein  32.61 
 
 
363 aa  48.9  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.264825  hitchhiker  0.0060203 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1529  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.04 
 
 
328 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.392114 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0299  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.3 
 
 
261 aa  49.3  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.385793 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.56 
 
 
239 aa  48.5  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.475837  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38463  predicted protein  33.01 
 
 
342 aa  48.1  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622688  normal  0.36197 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0344  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  27.93 
 
 
258 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.96 
 
 
227 aa  48.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0903  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.63 
 
 
238 aa  48.1  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3748  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.17 
 
 
331 aa  47.8  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.61 
 
 
267 aa  48.1  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.23 
 
 
240 aa  48.1  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2914  short chain dehydrogenase  23.5 
 
 
255 aa  47.8  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.37 
 
 
246 aa  47.8  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3515  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  30.3 
 
 
255 aa  47.8  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1877  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.74 
 
 
246 aa  47.8  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
304 aa  47.8  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0651953  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4308  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 
259 aa  47.4  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0763  short chain dehydrogenase  27.56 
 
 
316 aa  47.4  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.920637  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7030  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.1 
 
 
242 aa  47  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1133  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.52 
 
 
247 aa  47  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3782  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.16 
 
 
258 aa  47  0.0009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.143319  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0686  oxidoreductase  35.87 
 
 
324 aa  47  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06274  short chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_7G04540)  31.37 
 
 
345 aa  46.6  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0418357  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.01 
 
 
307 aa  46.6  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0401995  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3141  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.68 
 
 
246 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5878  gluconate 5-dehydrogenase  26.7 
 
 
259 aa  46.2  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.854497  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28 
 
 
257 aa  46.2  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.313012  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0854  short chain dehydrogenase  33.65 
 
 
291 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0871  short chain dehydrogenase  33.65 
 
 
291 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0118  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  27.88 
 
 
256 aa  46.2  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0860  short chain dehydrogenase  33.65 
 
 
291 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.321  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25521  predicted protein  33.93 
 
 
258 aa  46.2  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12290  short chain dehydrogenase  31.68 
 
 
317 aa  46.6  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.521938  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3431  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.66 
 
 
263 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4321  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.83 
 
 
255 aa  45.8  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0121776  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1054  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.91 
 
 
259 aa  45.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.508764  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0922  Short-chain alcohol dehydrogenase  25.74 
 
 
256 aa  45.4  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000799282  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0951  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.1 
 
 
261 aa  46.2  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4929  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.79 
 
 
270 aa  45.8  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.212781  normal  0.926969 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1232  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.93 
 
 
305 aa  45.8  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.623354  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0944  short chain dehydrogenase  30.08 
 
 
294 aa  45.8  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296729  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4593  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.1 
 
 
255 aa  45.8  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2410  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.61 
 
 
255 aa  45.8  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3749  short chain dehydrogenase  30.84 
 
 
254 aa  45.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2929  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 
1229 aa  45.8  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.663255  normal  0.36299 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0224  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.16 
 
 
291 aa  45.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.97 
 
 
255 aa  45.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal  0.349855 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.07 
 
 
254 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.496264  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.37 
 
 
304 aa  45.1  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177477  normal  0.189843 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.59 
 
 
272 aa  45.4  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2591  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29 
 
 
250 aa  45.1  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.573259 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0026  short chain dehydrogenase  33.94 
 
 
319 aa  45.4  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122051  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0923  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.26 
 
 
341 aa  45.1  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.406343  normal  0.0918592 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1454  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.34 
 
 
256 aa  45.1  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.108685 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.26 
 
 
324 aa  45.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.35 
 
 
324 aa  45.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.010862 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.98 
 
 
247 aa  45.4  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3640  oxidoreductase  32.61 
 
 
318 aa  45.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>