More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_44390 on replicon NC_009365
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009365  OSTLU_44390  predicted protein  100 
 
 		 433 aa  895    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0516105 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04190  oxidoreductase  46.86 
 
 		 527 aa  375  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10158  short-chain dehydrogenase  44.39 
 
 		 509 aa  344  2e-93  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2199  oxidoreductase  47.73 
 
 		 539 aa  341  1e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0323008  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1678  oxidoreductase  47.26 
 
 		 538 aa  339  7e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00133842  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1749  oxidoreductase  47.26 
 
 		 535 aa  339  7e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0726127  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1626  oxidoreductase  45.63 
 
 		 539 aa  329  5.0000000000000004e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.498473  normal  0.638708 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4871  putative short chain dehydrogenase  41.99 
 
 		 495 aa  285  8e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00534901  normal  0.736841 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5303  oxidoreductase  41.69 
 
 		 463 aa  283  5.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00730  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  42.03 
 
 		 529 aa  281  1e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7573  putative short chain dehydrogenase  41.12 
 
 		 454 aa  281  2e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2139  putative short chain dehydrogenase  42.13 
 
 		 483 aa  281  2e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.538588  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0884  putative short chain dehydrogenase  40.51 
 
 		 570 aa  280  4e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.51688 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4441  putative short chain dehydrogenase  40.74 
 
 		 474 aa  279  6e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1055  oxidoreductase  41.88 
 
 		 507 aa  279  6e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.730863  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1886  putative oxidoreductase  41.41 
 
 		 483 aa  276  4e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00334435 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2398  oxidoreductase  40.62 
 
 		 437 aa  276  7e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.683331 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1517  oxidoreductase  43.03 
 
 		 492 aa  274  2.0000000000000002e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00530  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  40.05 
 
 		 482 aa  273  3e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.191096  normal  0.164201 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0270  putative short chain dehydrogenase  39.61 
 
 		 503 aa  268  1e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0850168  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4251  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  38.72 
 
 		 447 aa  266  4e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.044314  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2123  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.51 
 
 		 485 aa  265  2e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1920  putative short chain dehydrogenase  40.59 
 
 		 500 aa  257  2e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45855  predicted protein  53.67 
 
 		 650 aa  235  1.0000000000000001e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.306932  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41 
 
 		 295 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0944  short chain dehydrogenase  40.35 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2783  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.32 
 
 		 327 aa  57  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0026  short chain dehydrogenase  41.07 
 
 		 319 aa  57  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122051  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2917  short chain dehydrogenase  37.37 
 
 		 665 aa  56.6  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0126943  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5145  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 263 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.622858  normal  0.939609 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1299  fatty acyl-CoA reductase protein  34.86 
 
 		 295 aa  55.1  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4550  Male sterility domain protein  34.91 
 
 		 659 aa  55.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1497  NAD/NADP dependent oxidoreductase  37.89 
 
 		 246 aa  54.7  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.445063  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3637  short chain dehydrogenase  32.84 
 
 		 254 aa  53.9  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4714  short chain dehydrogenase  32.84 
 
 		 254 aa  53.9  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0274692  decreased coverage  0.00406557 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.71 
 
 		 246 aa  53.5  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.667413 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1041  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.71 
 
 		 246 aa  53.5  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0420142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0412  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.17 
 
 		 249 aa  53.5  0.000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.956154 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.04 
 
 		 246 aa  53.5  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1835  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.04 
 
 		 244 aa  53.5  0.000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.686329  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.89 
 
 		 254 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00727999  normal  0.180483 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1566  short chain dehydrogenase  26.83 
 
 		 258 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0726  short chain dehydrogenase  33.09 
 
 		 291 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.352329 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1079  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.86 
 
 		 295 aa  53.1  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.366872  normal  0.186845 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0732  short chain dehydrogenase  33.09 
 
 		 291 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.403449  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0746  short chain dehydrogenase  33.09 
 
 		 291 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.095749 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1373  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.3 
 
 		 248 aa  52.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0032  short chain dehydrogenase  32.67 
 
 		 300 aa  52  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.58 
 
 		 303 aa  51.6  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0811669 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3515  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  33.33 
 
 		 255 aa  52  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4288  short chain dehydrogenase  39.56 
 
 		 287 aa  51.6  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01160  LSDR, putative  32.52 
 
 		 293 aa  51.6  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0729  short-chain dehydrogenase/reductase  34.34 
 
 		 308 aa  51.6  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.486158  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1583  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.35 
 
 		 349 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.216927  normal  0.0361789 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 304 aa  51.6  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0651953  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0452  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.98 
 
 		 255 aa  51.2  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2942  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.02 
 
 		 256 aa  51.2  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.351374 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.54 
 
 		 272 aa  50.8  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.106718  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3334  short chain dehydrogenase  34.65 
 
 		 299 aa  51.2  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1379  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.02 
 
 		 292 aa  51.2  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0182353  hitchhiker  0.000251864 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2206  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35 
 
 		 254 aa  50.8  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0824665  hitchhiker  0.00853535 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.24 
 
 		 254 aa  51.2  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0672528  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1787  short chain dehydrogenase  28.46 
 
 		 258 aa  50.8  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02396  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  36.79 
 
 		 261 aa  50.8  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.613287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1626  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  41.24 
 
 		 245 aa  50.8  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0813857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1363  short chain dehydrogenase  26.02 
 
 		 258 aa  50.4  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.737736 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.23 
 
 		 232 aa  50.8  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_89854  predicted protein  36.96 
 
 		 363 aa  50.4  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.264825  hitchhiker  0.0060203 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0726  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.56 
 
 		 250 aa  50.4  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_88990  predicted protein  36.96 
 
 		 363 aa  50.4  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0137755 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2764  short chain dehydrogenase  26.02 
 
 		 258 aa  50.4  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.191986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3982  short chain dehydrogenase  29.69 
 
 		 260 aa  50.4  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0357942 
 
 
-
 
NC_004310  BR0445  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.48 
 
 		 246 aa  50.1  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2456  short chain dehydrogenase  28.57 
 
 		 255 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716886 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.38 
 
 		 284 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0168044 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38463  predicted protein  37.5 
 
 		 342 aa  50.1  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622688  normal  0.36197 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3128  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.74 
 
 		 263 aa  50.1  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0549693 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2073  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.11 
 
 		 292 aa  49.7  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.08 
 
 		 255 aa  49.3  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal  0.349855 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4067  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  33.7 
 
 		 298 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.122191  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl172  dehydrogenase  35.16 
 
 		 279 aa  49.3  0.0001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1601  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  35.79 
 
 		 246 aa  49.7  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0250629  normal  0.870822 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.4 
 
 		 251 aa  49.3  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3215  short chain dehydrogenase  28.36 
 
 		 255 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.57556 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1204  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.46 
 
 		 238 aa  49.7  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2188  thiamine pyrophosphate protein central region  40 
 
 		 847 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.941679 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.34 
 
 		 324 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.010862 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4270  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  35.85 
 
 		 261 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149446  normal  0.650814 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4380  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  35.85 
 
 		 261 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.209201  normal  0.21753 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3138  short chain dehydrogenase  29.6 
 
 		 260 aa  49.7  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0721208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1917  short chain dehydrogenase  31.63 
 
 		 248 aa  48.5  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.242165  hitchhiker  0.00000598098 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.95 
 
 		 303 aa  48.9  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.96 
 
 		 261 aa  48.9  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.537071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3449  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.74 
 
 		 263 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.978544 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0308  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.89 
 
 		 253 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2071  short chain dehydrogenase  31.82 
 
 		 256 aa  48.9  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0860  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.19 
 
 		 287 aa  48.5  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.943731  normal  0.246629 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1232  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.54 
 
 		 305 aa  48.9  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.623354  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15671  short-chain dehydrogenase/reductase  30.39 
 
 		 300 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0732777  normal  0.472072 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1893  3-hydroxy acid dehydrogenase  35.35 
 
 		 249 aa  48.1  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>