281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1886 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_1886  putative oxidoreductase  100 
 
 		 483 aa  998    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00334435 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2139  putative short chain dehydrogenase  94 
 
 		 483 aa  947    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.538588  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4441  putative short chain dehydrogenase  70.08 
 
 		 474 aa  644    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00530  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  66.19 
 
 		 482 aa  665    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.191096  normal  0.164201 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5303  oxidoreductase  65.21 
 
 		 463 aa  630  1e-179  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1055  oxidoreductase  63.15 
 
 		 507 aa  627  1e-178  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.730863  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4871  putative short chain dehydrogenase  65.28 
 
 		 495 aa  620  1e-176  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00534901  normal  0.736841 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0270  putative short chain dehydrogenase  65.24 
 
 		 503 aa  611  9.999999999999999e-175  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0850168  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0884  putative short chain dehydrogenase  61.55 
 
 		 570 aa  610  1e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.51688 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1517  oxidoreductase  68.17 
 
 		 492 aa  605  9.999999999999999e-173  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2123  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.97 
 
 		 485 aa  602  1.0000000000000001e-171  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1920  putative short chain dehydrogenase  68.41 
 
 		 500 aa  601  1e-170  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00730  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  60.32 
 
 		 529 aa  572  1.0000000000000001e-162  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7573  putative short chain dehydrogenase  48.35 
 
 		 454 aa  404  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4251  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  53.06 
 
 		 447 aa  371  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.044314  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2398  oxidoreductase  49.64 
 
 		 437 aa  357  2.9999999999999997e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.683331 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04190  oxidoreductase  44.61 
 
 		 527 aa  307  3e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44390  predicted protein  41.65 
 
 		 433 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0516105 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10158  short-chain dehydrogenase  41.15 
 
 		 509 aa  267  2.9999999999999995e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1626  oxidoreductase  44.42 
 
 		 539 aa  265  2e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.498473  normal  0.638708 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45855  predicted protein  38.24 
 
 		 650 aa  262  1e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.306932  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2199  oxidoreductase  43.28 
 
 		 539 aa  252  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0323008  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1678  oxidoreductase  43.28 
 
 		 538 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00133842  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1749  oxidoreductase  43.28 
 
 		 535 aa  250  4e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0726127  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.61 
 
 		 239 aa  53.5  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.09 
 
 		 284 aa  53.5  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.22798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3179  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.49 
 
 		 254 aa  53.1  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0694225  normal  0.858211 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4614  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.14 
 
 		 250 aa  53.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1674  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.89 
 
 		 254 aa  52.8  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1212  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.63 
 
 		 238 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal  0.539797 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.61 
 
 		 264 aa  52.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.296993 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0287  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.26 
 
 		 253 aa  52.4  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.129193  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2392  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.78 
 
 		 255 aa  52  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.432373 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3640  oxidoreductase  32.38 
 
 		 318 aa  52  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.66 
 
 		 246 aa  51.6  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.790974  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3466  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.84 
 
 		 292 aa  51.6  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0403  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.99 
 
 		 278 aa  51.2  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19413  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2998  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.83 
 
 		 261 aa  51.2  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2294  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.66 
 
 		 246 aa  51.2  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.08 
 
 		 240 aa  51.2  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35800  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  33.64 
 
 		 285 aa  50.8  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5711  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.76 
 
 		 246 aa  50.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1818  short chain dehydrogenase  32.98 
 
 		 255 aa  50.8  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0513  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.62 
 
 		 233 aa  51.2  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.63 
 
 		 257 aa  50.8  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2070  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.11 
 
 		 275 aa  50.8  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0241632 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.56 
 
 		 326 aa  50.8  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6414  gluconate 5-dehydrogenase  36.08 
 
 		 254 aa  50.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0118789  normal  0.389185 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.63 
 
 		 314 aa  50.4  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.825969 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1505  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.36 
 
 		 286 aa  50.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.412824 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.62 
 
 		 247 aa  50.4  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0657  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.84 
 
 		 292 aa  50.4  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.65557 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0020  short chain dehydrogenase  39.18 
 
 		 298 aa  50.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.63 
 
 		 255 aa  49.3  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1793  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.29 
 
 		 268 aa  49.7  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.152096  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0281  putative short-chain dehydrogenase, oxidoreductase  32.63 
 
 		 257 aa  49.3  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0939  short chain dehydrogenase  31.25 
 
 		 254 aa  50.1  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.8 
 
 		 295 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.66 
 
 		 246 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.66 
 
 		 246 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2390  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.66 
 
 		 246 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.509467  normal  0.742025 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3474  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.71 
 
 		 285 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  38.04 
 
 		 255 aa  48.5  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1591  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.76 
 
 		 265 aa  49.3  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.222007  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0277  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  37.76 
 
 		 251 aa  48.9  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3290  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.03 
 
 		 292 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3237  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.91 
 
 		 308 aa  48.5  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.278854  normal  0.143787 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3476  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.01 
 
 		 257 aa  48.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.746633  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2394  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.68 
 
 		 268 aa  48.5  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.097477 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.65 
 
 		 286 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.239121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.78 
 
 		 300 aa  48.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.319997  normal  0.350002 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3166  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.85 
 
 		 266 aa  48.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0752  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.46 
 
 		 241 aa  48.5  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0945  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.63 
 
 		 328 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0025  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 291 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1529  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.95 
 
 		 328 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.392114 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 		 324 aa  48.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.010862 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.19 
 
 		 227 aa  47.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6424  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.63 
 
 		 255 aa  48.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.62 
 
 		 250 aa  48.1  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2912  short chain dehydrogenase  35.45 
 
 		 261 aa  48.1  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.07408 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1765  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.17 
 
 		 237 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1523  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.78 
 
 		 269 aa  47.8  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0221  UDP-galactose 4-epimerase  32.97 
 
 		 347 aa  47.4  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  decreased coverage  0.000600389  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0273  short chain dehydrogenase  32.65 
 
 		 334 aa  47.4  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.698832 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0894  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32 
 
 		 266 aa  47.4  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4753  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 284 aa  47.4  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.163262  normal  0.97721 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4355  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.78 
 
 		 256 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22650  short-chain alcohol dehydrogenase like protein  27.04 
 
 		 306 aa  47.4  0.0007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4043  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.11 
 
 		 340 aa  47  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.138732  normal  0.0406215 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.56 
 
 		 285 aa  47.4  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.566144  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0947  gluconate 5-dehydrogenase oxidoreductase protein  34.62 
 
 		 258 aa  47  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.815693 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1601  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  32.98 
 
 		 246 aa  47  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0250629  normal  0.870822 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0022  short chain dehydrogenase  36.36 
 
 		 293 aa  47  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2454  short chain dehydrogenase  36.19 
 
 		 694 aa  47  0.0008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.86013  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.93 
 
 		 266 aa  47  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00111461  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0224  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.36 
 
 		 291 aa  47  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4486  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.78 
 
 		 292 aa  47  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0684702 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.04 
 
 		 258 aa  47  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.36 
 
 		 262 aa  47  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.351696  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>