44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_1678 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_1626  oxidoreductase  78.6 
 
 
539 aa  787    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.498473  normal  0.638708 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1678  oxidoreductase  100 
 
 
538 aa  1072    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00133842  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2199  oxidoreductase  95.36 
 
 
539 aa  965    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0323008  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1749  oxidoreductase  97.58 
 
 
535 aa  1004    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0726127  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04190  oxidoreductase  52.22 
 
 
527 aa  489  1e-137  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10158  short-chain dehydrogenase  44.38 
 
 
509 aa  441  9.999999999999999e-123  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44390  predicted protein  47.26 
 
 
433 aa  352  7e-96  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0516105 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45855  predicted protein  37.66 
 
 
650 aa  327  3e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.306932  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7573  putative short chain dehydrogenase  44.71 
 
 
454 aa  289  7e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00730  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  44.69 
 
 
529 aa  289  1e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5303  oxidoreductase  38.95 
 
 
463 aa  275  2.0000000000000002e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4441  putative short chain dehydrogenase  45.45 
 
 
474 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2139  putative short chain dehydrogenase  43.53 
 
 
483 aa  268  1e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.538588  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0270  putative short chain dehydrogenase  42.24 
 
 
503 aa  268  2.9999999999999995e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0850168  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2123  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.37 
 
 
485 aa  268  2.9999999999999995e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00530  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  37.99 
 
 
482 aa  264  2e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.191096  normal  0.164201 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1055  oxidoreductase  43 
 
 
507 aa  265  2e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.730863  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1886  putative oxidoreductase  43.18 
 
 
483 aa  265  2e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00334435 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0884  putative short chain dehydrogenase  40.67 
 
 
570 aa  261  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.51688 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4871  putative short chain dehydrogenase  38.29 
 
 
495 aa  261  3e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00534901  normal  0.736841 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1920  putative short chain dehydrogenase  42.57 
 
 
500 aa  258  2e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2398  oxidoreductase  42.96 
 
 
437 aa  258  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.683331 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4251  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  44.64 
 
 
447 aa  256  8e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.044314  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1517  oxidoreductase  43.69 
 
 
492 aa  248  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.38 
 
 
239 aa  57.4  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0513  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.92 
 
 
233 aa  55.5  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.78 
 
 
229 aa  51.6  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2783  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.61 
 
 
327 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.44 
 
 
227 aa  51.2  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.54 
 
 
295 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0213  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.35 
 
 
264 aa  47.4  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.78 
 
 
239 aa  47.4  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.475837  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_89854  predicted protein  33.67 
 
 
363 aa  47.4  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.264825  hitchhiker  0.0060203 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.51 
 
 
240 aa  47.4  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_88990  predicted protein  33.67 
 
 
363 aa  47.4  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0137755 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 
265 aa  45.8  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.76513  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11105  short-chain dehydrogenase/reductase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03280)  30 
 
 
332 aa  45.8  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02396  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  33.96 
 
 
261 aa  46.2  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.613287  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1674  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34 
 
 
254 aa  45.4  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1221  bifunctional 5,10-methylene-tetrahydrofolate dehydrogenase/ 5,10-methylene-tetrahydrofolate cyclohydrolase  36.9 
 
 
282 aa  44.7  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00020406  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1139  short-chain alcohol dehydrogenase-like protein  30.95 
 
 
266 aa  44.7  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4550  Male sterility domain protein  31.96 
 
 
659 aa  44.3  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 
233 aa  43.5  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000223483  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33 
 
 
252 aa  43.5  0.009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>