46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1749 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1749  oxidoreductase  100 
 
 		 535 aa  1065    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0726127  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2199  oxidoreductase  94.99 
 
 		 539 aa  961    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0323008  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1678  oxidoreductase  97.21 
 
 		 538 aa  1003    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00133842  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1626  oxidoreductase  78.64 
 
 		 539 aa  788    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.498473  normal  0.638708 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04190  oxidoreductase  52.06 
 
 		 527 aa  491  1e-137  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10158  short-chain dehydrogenase  44.81 
 
 		 509 aa  445  1e-123  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44390  predicted protein  47.26 
 
 		 433 aa  352  8e-96  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0516105 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45855  predicted protein  38.03 
 
 		 650 aa  328  2.0000000000000001e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.306932  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7573  putative short chain dehydrogenase  45.04 
 
 		 454 aa  290  3e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00730  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  44.69 
 
 		 529 aa  287  2.9999999999999996e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4441  putative short chain dehydrogenase  45.15 
 
 		 474 aa  276  9e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5303  oxidoreductase  39.17 
 
 		 463 aa  275  1.0000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2139  putative short chain dehydrogenase  42.93 
 
 		 483 aa  268  1e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.538588  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2123  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.61 
 
 		 485 aa  269  1e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00530  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  38.62 
 
 		 482 aa  267  4e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.191096  normal  0.164201 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0270  putative short chain dehydrogenase  42.68 
 
 		 503 aa  266  5.999999999999999e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0850168  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1055  oxidoreductase  37.7 
 
 		 507 aa  264  2e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.730863  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1886  putative oxidoreductase  42.62 
 
 		 483 aa  265  2e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00334435 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4871  putative short chain dehydrogenase  37.94 
 
 		 495 aa  263  6e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00534901  normal  0.736841 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0884  putative short chain dehydrogenase  41.57 
 
 		 570 aa  260  4e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.51688 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1920  putative short chain dehydrogenase  42.3 
 
 		 500 aa  259  9e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2398  oxidoreductase  44.23 
 
 		 437 aa  258  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.683331 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4251  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  44.64 
 
 		 447 aa  256  9e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.044314  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1517  oxidoreductase  42.82 
 
 		 492 aa  248  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.38 
 
 		 239 aa  57.4  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0513  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.92 
 
 		 233 aa  55.5  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.78 
 
 		 229 aa  51.6  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2783  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.61 
 
 		 327 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.44 
 
 		 227 aa  51.2  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.54 
 
 		 295 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0213  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.35 
 
 		 264 aa  47.4  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.51 
 
 		 240 aa  47.4  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.78 
 
 		 239 aa  47.8  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.475837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_88990  predicted protein  34.34 
 
 		 363 aa  47.4  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0137755 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_89854  predicted protein  34.34 
 
 		 363 aa  47.4  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.264825  hitchhiker  0.0060203 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 		 265 aa  45.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.76513  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11105  short-chain dehydrogenase/reductase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03280)  30 
 
 		 332 aa  45.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02396  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  33.96 
 
 		 261 aa  46.2  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.613287  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1674  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34 
 
 		 254 aa  45.4  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1139  short-chain alcohol dehydrogenase-like protein  30.36 
 
 		 266 aa  45.1  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1221  bifunctional 5,10-methylene-tetrahydrofolate dehydrogenase/ 5,10-methylene-tetrahydrofolate cyclohydrolase  36.9 
 
 		 282 aa  44.7  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00020406  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4550  Male sterility domain protein  31.96 
 
 		 659 aa  44.3  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 		 233 aa  43.9  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000223483  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33 
 
 		 252 aa  43.5  0.009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0944  short chain dehydrogenase  32.04 
 
 		 294 aa  43.5  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.78 
 
 		 255 aa  43.5  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.420878 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>