280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4871 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4441  putative short chain dehydrogenase  69.58 
 
 		 474 aa  650    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1517  oxidoreductase  70.33 
 
 		 492 aa  639    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4871  putative short chain dehydrogenase  100 
 
 		 495 aa  998    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00534901  normal  0.736841 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00530  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  67.08 
 
 		 482 aa  647    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.191096  normal  0.164201 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2139  putative short chain dehydrogenase  66.11 
 
 		 483 aa  636    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.538588  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0884  putative short chain dehydrogenase  65.59 
 
 		 570 aa  637    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.51688 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1886  putative oxidoreductase  65.28 
 
 		 483 aa  631  1e-180  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00334435 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5303  oxidoreductase  65.97 
 
 		 463 aa  622  1e-177  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1920  putative short chain dehydrogenase  70.86 
 
 		 500 aa  599  1e-170  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0270  putative short chain dehydrogenase  63.88 
 
 		 503 aa  588  1e-167  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0850168  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1055  oxidoreductase  60.08 
 
 		 507 aa  582  1.0000000000000001e-165  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.730863  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2123  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.07 
 
 		 485 aa  569  1e-161  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00730  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  58.65 
 
 		 529 aa  538  9.999999999999999e-153  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7573  putative short chain dehydrogenase  50.41 
 
 		 454 aa  419  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4251  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  52.84 
 
 		 447 aa  373  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.044314  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2398  oxidoreductase  49.06 
 
 		 437 aa  356  5e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.683331 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04190  oxidoreductase  40.15 
 
 		 527 aa  305  2.0000000000000002e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44390  predicted protein  41.99 
 
 		 433 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0516105 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10158  short-chain dehydrogenase  40.74 
 
 		 509 aa  271  1e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1626  oxidoreductase  44.04 
 
 		 539 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.498473  normal  0.638708 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2199  oxidoreductase  42.82 
 
 		 539 aa  249  6e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0323008  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1678  oxidoreductase  42.65 
 
 		 538 aa  246  4.9999999999999997e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00133842  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1749  oxidoreductase  42.65 
 
 		 535 aa  246  9e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0726127  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45855  predicted protein  48.89 
 
 		 650 aa  160  6e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.306932  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.79 
 
 		 240 aa  55.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6414  gluconate 5-dehydrogenase  40.21 
 
 		 254 aa  55.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0118789  normal  0.389185 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 256 aa  54.3  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0601767 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1818  short chain dehydrogenase  34.04 
 
 		 255 aa  53.5  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3179  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.55 
 
 		 254 aa  52.8  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0694225  normal  0.858211 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2348  polyketide synthase, putative  38.71 
 
 		 2137 aa  51.6  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1794  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.62 
 
 		 257 aa  52  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0287  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.14 
 
 		 253 aa  52  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.129193  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1038  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.08 
 
 		 247 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00179214  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2623  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.66 
 
 		 284 aa  52  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.795257  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1064  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.08 
 
 		 247 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.104553  normal  0.448539 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.66 
 
 		 284 aa  52  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.459641  normal  0.940814 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 		 227 aa  51.6  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.62 
 
 		 314 aa  51.2  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.825969 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1054  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.08 
 
 		 289 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.137743 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.96 
 
 		 300 aa  50.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.319997  normal  0.350002 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.04 
 
 		 257 aa  51.2  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.759988  normal  0.0474831 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2652  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.66 
 
 		 284 aa  51.2  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3640  oxidoreductase  35.79 
 
 		 318 aa  50.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1212  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.71 
 
 		 238 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal  0.539797 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2089  putative polyketide synthase  36.56 
 
 		 2338 aa  50.8  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.56 
 
 		 343 aa  50.8  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.550402 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2380  putative polyketide synthase  36.56 
 
 		 2287 aa  50.8  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1477  beta keto-acyl synthase  36.56 
 
 		 2273 aa  50.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0997  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.78 
 
 		 260 aa  50.8  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.75 
 
 		 295 aa  50.8  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3147  putative polyketide synthase  36.56 
 
 		 2258 aa  50.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.75 
 
 		 264 aa  50.4  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.296993 
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  40.38 
 
 		 255 aa  50.4  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3245  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.94 
 
 		 246 aa  50.4  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0311  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.75 
 
 		 295 aa  50.4  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.373471  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.75 
 
 		 295 aa  50.4  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.33498 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0947  gluconate 5-dehydrogenase oxidoreductase protein  37.38 
 
 		 258 aa  50.1  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.815693 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1793  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.32 
 
 		 268 aa  50.1  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.152096  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2294  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.66 
 
 		 246 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0277  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  38.78 
 
 		 251 aa  49.3  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3476  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 		 257 aa  49.3  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.746633  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.66 
 
 		 246 aa  49.7  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.790974  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.94 
 
 		 246 aa  50.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0894  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.46 
 
 		 266 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1116  putative polyketide synthase  36.26 
 
 		 2294 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.107556  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4328  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.63 
 
 		 294 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2998  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.05 
 
 		 261 aa  48.9  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35 
 
 		 255 aa  48.9  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08531  UDP-glucose 4-epimerase  33.7 
 
 		 348 aa  49.3  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.264639  hitchhiker  0.00180619 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0945  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.17 
 
 		 328 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2390  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.66 
 
 		 246 aa  48.5  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.509467  normal  0.742025 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2394  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.3 
 
 		 268 aa  48.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.097477 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.66 
 
 		 246 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.07 
 
 		 341 aa  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.29527  normal  0.178629 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1167  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 		 252 aa  48.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5540  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 		 333 aa  48.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.752467  normal  0.0103168 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.66 
 
 		 246 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.24 
 
 		 324 aa  47.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.010862 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5711  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.66 
 
 		 246 aa  48.1  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.17 
 
 		 286 aa  48.1  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.239121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.11 
 
 		 301 aa  47.8  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000491998  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5123  acetoacetyl-CoA reductase  35.58 
 
 		 248 aa  47.8  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.753936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.02 
 
 		 239 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35800  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  36.45 
 
 		 285 aa  48.1  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1591  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.78 
 
 		 265 aa  47.8  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.222007  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0498  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  40.38 
 
 		 252 aa  47.8  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.726139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.95 
 
 		 253 aa  47.8  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.538738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0308  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.6 
 
 		 253 aa  47.8  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.22 
 
 		 255 aa  47.4  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.24294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3466  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.29 
 
 		 292 aa  47.8  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1529  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.54 
 
 		 328 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.392114 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4127  acetoacetyl-CoA reductase  39.58 
 
 		 247 aa  47.4  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.39 
 
 		 247 aa  47.4  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1851  gluconate 5-dehydrogenase  35.71 
 
 		 260 aa  47.4  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.198252 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.78 
 
 		 254 aa  47.4  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4098  short chain dehydrogenase  37.23 
 
 		 265 aa  47.4  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.474708 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3749  short chain dehydrogenase  41.3 
 
 		 254 aa  47.4  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0618  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.14 
 
 		 258 aa  47.4  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.063344  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 		 252 aa  47  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.950748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7133  hypothetical protein  58.82 
 
 		 35 aa  47  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>