68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_1626 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_1678  oxidoreductase  78.6 
 
 
538 aa  785    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00133842  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1626  oxidoreductase  100 
 
 
539 aa  1077    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.498473  normal  0.638708 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2199  oxidoreductase  79.39 
 
 
539 aa  781    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0323008  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1749  oxidoreductase  78.41 
 
 
535 aa  785    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0726127  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04190  oxidoreductase  51.21 
 
 
527 aa  496  1e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10158  short-chain dehydrogenase  43.14 
 
 
509 aa  447  1.0000000000000001e-124  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44390  predicted protein  45.63 
 
 
433 aa  343  5.999999999999999e-93  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0516105 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00730  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  43.86 
 
 
529 aa  291  2e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4441  putative short chain dehydrogenase  44.52 
 
 
474 aa  283  8.000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0884  putative short chain dehydrogenase  43.05 
 
 
570 aa  281  3e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.51688 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1055  oxidoreductase  43.83 
 
 
507 aa  278  1e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.730863  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2139  putative short chain dehydrogenase  43.06 
 
 
483 aa  278  2e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.538588  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1886  putative oxidoreductase  44.42 
 
 
483 aa  278  2e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00334435 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5303  oxidoreductase  45.32 
 
 
463 aa  276  5e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7573  putative short chain dehydrogenase  38.61 
 
 
454 aa  273  7e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0270  putative short chain dehydrogenase  43.52 
 
 
503 aa  272  9e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0850168  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2123  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.67 
 
 
485 aa  271  2e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4871  putative short chain dehydrogenase  43.42 
 
 
495 aa  270  7e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00534901  normal  0.736841 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00530  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  43.63 
 
 
482 aa  268  2e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.191096  normal  0.164201 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1920  putative short chain dehydrogenase  44.2 
 
 
500 aa  264  3e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1517  oxidoreductase  44.55 
 
 
492 aa  262  1e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4251  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  44.96 
 
 
447 aa  254  3e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.044314  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2398  oxidoreductase  42.04 
 
 
437 aa  249  6e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.683331 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45855  predicted protein  43.8 
 
 
650 aa  195  2e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.306932  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_88990  predicted protein  38.38 
 
 
363 aa  57.8  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0137755 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_89854  predicted protein  38.38 
 
 
363 aa  57.8  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.264825  hitchhiker  0.0060203 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
295 aa  57.4  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2783  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.61 
 
 
327 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0513  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.22 
 
 
233 aa  51.2  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.11 
 
 
239 aa  51.6  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_003296  RS02396  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  33.65 
 
 
261 aa  48.5  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.613287  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.36 
 
 
304 aa  47.4  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0651953  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1331  short chain dehydrogenase  35.42 
 
 
265 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1674  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34 
 
 
254 aa  46.6  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1239  short chain dehydrogenase  35.42 
 
 
265 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.363004  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0729  short-chain dehydrogenase/reductase  28.28 
 
 
308 aa  46.6  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.486158  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2499  short chain dehydrogenase  35.42 
 
 
265 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.830572  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2529  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.6 
 
 
299 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0314  short chain dehydrogenase  35.42 
 
 
265 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.265928  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0590  short chain dehydrogenase  35.42 
 
 
265 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.155951  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1312  short chain dehydrogenase  35.42 
 
 
265 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.445214  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0977  short chain dehydrogenase  35.42 
 
 
265 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.423513  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1497  NAD/NADP dependent oxidoreductase  59.46 
 
 
246 aa  45.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.445063  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0026  short chain dehydrogenase  35.92 
 
 
319 aa  45.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122051  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0944  short chain dehydrogenase  34 
 
 
294 aa  45.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296729  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35 
 
 
287 aa  46.2  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.97 
 
 
260 aa  45.4  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3749  short chain dehydrogenase  32 
 
 
254 aa  45.1  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.14 
 
 
312 aa  44.7  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17961  Short-chain dehydrogenase/reductase (SDR) superfamily protein  36.56 
 
 
300 aa  44.7  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.140714 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0951  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.38 
 
 
261 aa  44.7  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.82 
 
 
229 aa  44.7  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2032  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.22 
 
 
436 aa  44.3  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0304773  normal  0.779517 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31 
 
 
303 aa  44.3  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7064  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
265 aa  43.9  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282667  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3108  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  36.19 
 
 
263 aa  43.9  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0812933  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.46 
 
 
265 aa  43.9  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.76513  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2706  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.19 
 
 
263 aa  43.9  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000459649  unclonable  0.0000000000323747 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.08 
 
 
278 aa  43.9  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.561593  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.75 
 
 
255 aa  43.9  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0213  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.35 
 
 
264 aa  43.9  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1716  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  29.7 
 
 
253 aa  43.9  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1529  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.35 
 
 
328 aa  43.9  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.392114 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1835  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  26.6 
 
 
244 aa  43.5  0.009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.686329  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5265  short chain dehydrogenase  31.31 
 
 
265 aa  43.5  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1552  Methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP(+))  42 
 
 
288 aa  43.5  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000645737 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1877  methylenetetrahydrofolate dehydrogenase/methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase  42 
 
 
288 aa  43.5  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.337489  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.35 
 
 
239 aa  43.5  0.01  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.475837  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>