More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1674 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1674  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
254 aa  514  1.0000000000000001e-145  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0470  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  41.46 
 
 
249 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000863447  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1347  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  41.06 
 
 
249 aa  193  3e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.52 
 
 
251 aa  189  4e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0423  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  39.02 
 
 
252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0399  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  39.02 
 
 
252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2412  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  38.96 
 
 
258 aa  182  5.0000000000000004e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0187  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.04 
 
 
259 aa  180  2e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.978165  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.67 
 
 
277 aa  165  8e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0837629  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1133  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.56 
 
 
247 aa  151  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.89 
 
 
259 aa  150  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.732421  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3886  Beta-ketoacyl synthase  35.34 
 
 
2014 aa  150  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.190721 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5030  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 
248 aa  149  4e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.574158  normal  0.46394 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2058  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.74 
 
 
246 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 
250 aa  146  3e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2361  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.29 
 
 
258 aa  143  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.11166  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.69 
 
 
257 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.66 
 
 
248 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2380  putative polyketide synthase  34.15 
 
 
2287 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2089  putative polyketide synthase  34.15 
 
 
2338 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3147  putative polyketide synthase  34.15 
 
 
2258 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1116  putative polyketide synthase  34.16 
 
 
2294 aa  139  6e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.107556  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1972  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.25 
 
 
247 aa  138  7.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1395  putative polyketide synthase  34.17 
 
 
2285 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1477  beta keto-acyl synthase  34.15 
 
 
2273 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1953  Beta-ketoacyl synthase  32.93 
 
 
2081 aa  137  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.272599 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4233  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.89 
 
 
257 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2348  polyketide synthase, putative  34.15 
 
 
2137 aa  137  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1378  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.95 
 
 
247 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1751  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.27 
 
 
257 aa  135  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0168825 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2226  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.05 
 
 
248 aa  135  5e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1396  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 
248 aa  135  8e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.872133 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.35 
 
 
251 aa  134  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.612185 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3261  beta keto-acyl synthase  33.75 
 
 
2262 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0093  glucose/ribitol dehydrogenase  33.46 
 
 
259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7068  SDR family dehydrogenase/reductase  33.87 
 
 
257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.894165 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3160  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.4 
 
 
248 aa  133  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.328176  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2870  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  34.09 
 
 
254 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3181  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.16 
 
 
260 aa  132  7.999999999999999e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.100274  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2541  acetoin reductases  35.29 
 
 
259 aa  132  7.999999999999999e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0776085  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4347  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.48 
 
 
247 aa  131  9e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.296553  normal  0.0123355 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07806  Versicolorin reductase (EC 1.1.-.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00791]  32.3 
 
 
264 aa  130  1.0000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00450533  normal  0.460888 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0701  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.48 
 
 
247 aa  131  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000555171 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 
249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.964587  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0936  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.66 
 
 
248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.340631  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1418  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.66 
 
 
248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.470556  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0838  acetoin reductase  32.55 
 
 
259 aa  129  4.0000000000000003e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.37801  normal  0.387931 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3675  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.55 
 
 
248 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.933884  hitchhiker  0.00557136 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.18 
 
 
254 aa  129  6e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.818797  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 
251 aa  129  6e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.755812  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0934  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  33.47 
 
 
247 aa  129  6e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00491532  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.83 
 
 
265 aa  128  8.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.243411  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3239  short chain dehydrogenase  34.38 
 
 
254 aa  128  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304035  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1337  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.06 
 
 
248 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.378694  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00146  oxidoreductase, putative (Eurofung)  33.2 
 
 
265 aa  128  1.0000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.465009  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.89 
 
 
247 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0549  putative short-chain type dehydrogenase/reductase  34.77 
 
 
248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.613292 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3110  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 
246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2043  short chain dehydrogenase  33.59 
 
 
254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.179832  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2960  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.41 
 
 
251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4562  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.06 
 
 
248 aa  126  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0570869  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38 
 
 
247 aa  126  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3184  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.22 
 
 
249 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0196402  normal  0.84005 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1298  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.06 
 
 
248 aa  126  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.06 
 
 
262 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.469065 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.53 
 
 
250 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1428  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.94 
 
 
249 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.596689 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3213  short chain dehydrogenase  33.2 
 
 
254 aa  125  5e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2985  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.66 
 
 
248 aa  125  5e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0207781  normal  0.0184598 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.98 
 
 
258 aa  125  5e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.13463  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1293  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.52 
 
 
246 aa  125  6e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.252649  hitchhiker  0.0000000000000846656 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 
248 aa  125  6e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2392  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 
255 aa  125  6e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.432373 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2998  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 
261 aa  125  7e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4043  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 
254 aa  125  7e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3950  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.52 
 
 
246 aa  125  7e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3702  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.87 
 
 
246 aa  125  9e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.852261  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3592  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.87 
 
 
246 aa  125  9e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3610  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.87 
 
 
246 aa  125  9e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3989  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.87 
 
 
246 aa  125  9e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0408742  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3865  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.87 
 
 
246 aa  125  9e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.78131e-47 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1756  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 
256 aa  125  9e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0943  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.9 
 
 
246 aa  125  9e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000752112  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3893  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.87 
 
 
246 aa  124  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2906  short chain dehydrogenase  34.11 
 
 
257 aa  124  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.01573  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0128  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.27 
 
 
246 aa  124  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2059  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  31.87 
 
 
247 aa  124  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0884699 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.27 
 
 
265 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2591  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.04 
 
 
250 aa  124  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.573259 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0260  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.69 
 
 
261 aa  125  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.18961  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1180  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.33 
 
 
247 aa  123  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000457862  decreased coverage  0.00144514 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2927  short chain dehydrogenase  33.98 
 
 
254 aa  124  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.29 
 
 
255 aa  123  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0969  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
256 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.760882  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3674  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.47 
 
 
246 aa  123  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.119797  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1800  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.22 
 
 
274 aa  123  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2114  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 
248 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.34 
 
 
239 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0783  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  28.85 
 
 
262 aa  123  2e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1493  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.34 
 
 
249 aa  124  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000373028  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>