49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2199 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1749  oxidoreductase  95.18 
 
 
535 aa  984    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0726127  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2199  oxidoreductase  100 
 
 
539 aa  1072    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0323008  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1678  oxidoreductase  95.18 
 
 
538 aa  990    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00133842  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1626  oxidoreductase  78.98 
 
 
539 aa  799    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.498473  normal  0.638708 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04190  oxidoreductase  52.42 
 
 
527 aa  492  9.999999999999999e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10158  short-chain dehydrogenase  44.12 
 
 
509 aa  444  1e-123  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44390  predicted protein  47.29 
 
 
433 aa  356  5.999999999999999e-97  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0516105 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45855  predicted protein  38.47 
 
 
650 aa  337  3.9999999999999995e-91  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.306932  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00730  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  45.19 
 
 
529 aa  294  3e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7573  putative short chain dehydrogenase  45.59 
 
 
454 aa  288  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4441  putative short chain dehydrogenase  45.59 
 
 
474 aa  277  4e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5303  oxidoreductase  39.25 
 
 
463 aa  276  8e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1055  oxidoreductase  43.63 
 
 
507 aa  272  1e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.730863  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2123  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.61 
 
 
485 aa  271  2e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0270  putative short chain dehydrogenase  43.17 
 
 
503 aa  271  2.9999999999999997e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0850168  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2139  putative short chain dehydrogenase  42.82 
 
 
483 aa  269  8e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.538588  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00530  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  38.15 
 
 
482 aa  268  2e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.191096  normal  0.164201 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4871  putative short chain dehydrogenase  39.07 
 
 
495 aa  266  5.999999999999999e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00534901  normal  0.736841 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1886  putative oxidoreductase  42.62 
 
 
483 aa  265  2e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00334435 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2398  oxidoreductase  44.13 
 
 
437 aa  264  4e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.683331 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0884  putative short chain dehydrogenase  42.28 
 
 
570 aa  262  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.51688 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1920  putative short chain dehydrogenase  43.56 
 
 
500 aa  260  4e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4251  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  45.39 
 
 
447 aa  259  6e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.044314  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1517  oxidoreductase  43.93 
 
 
492 aa  253  5.000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.75 
 
 
239 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0513  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.27 
 
 
233 aa  53.5  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2783  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.61 
 
 
327 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.5 
 
 
295 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.04 
 
 
229 aa  48.1  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.75 
 
 
227 aa  47.4  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02396  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  33.64 
 
 
261 aa  47  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.613287  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0213  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.03 
 
 
264 aa  47  0.0009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.51 
 
 
240 aa  46.6  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11105  short-chain dehydrogenase/reductase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03280)  31 
 
 
332 aa  45.8  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.54 
 
 
239 aa  45.8  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.475837  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.04 
 
 
258 aa  45.4  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.500717  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_89854  predicted protein  33.33 
 
 
363 aa  45.1  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.264825  hitchhiker  0.0060203 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_88990  predicted protein  33.33 
 
 
363 aa  45.1  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0137755 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 
233 aa  45.4  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000223483  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34 
 
 
252 aa  44.7  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.33 
 
 
265 aa  44.3  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.76513  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3108  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  30.97 
 
 
263 aa  43.9  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0812933  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.04 
 
 
258 aa  43.9  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1674  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.34 
 
 
254 aa  43.9  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.04 
 
 
258 aa  43.9  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2706  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.97 
 
 
263 aa  43.9  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000459649  unclonable  0.0000000000323747 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4550  Male sterility domain protein  31.96 
 
 
659 aa  43.5  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 
304 aa  43.5  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0651953  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2646  phosphatidylserine decarboxylase  26.26 
 
 
258 aa  43.5  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.229989  normal  0.216925 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>