258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_00530 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_00530  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  100 
 
 		 482 aa  984    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.191096  normal  0.164201 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5303  oxidoreductase  68.74 
 
 		 463 aa  673    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1517  oxidoreductase  70.42 
 
 		 492 aa  638    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1886  putative oxidoreductase  66.19 
 
 		 483 aa  665    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00334435 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4871  putative short chain dehydrogenase  67.08 
 
 		 495 aa  636    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00534901  normal  0.736841 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2139  putative short chain dehydrogenase  66.39 
 
 		 483 aa  671    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.538588  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0884  putative short chain dehydrogenase  66.06 
 
 		 570 aa  645    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.51688 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4441  putative short chain dehydrogenase  69.79 
 
 		 474 aa  662    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1920  putative short chain dehydrogenase  70.21 
 
 		 500 aa  619  1e-176  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1055  oxidoreductase  62.3 
 
 		 507 aa  620  1e-176  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.730863  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0270  putative short chain dehydrogenase  66.05 
 
 		 503 aa  612  9.999999999999999e-175  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0850168  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2123  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.7 
 
 		 485 aa  601  1e-170  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00730  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  60.28 
 
 		 529 aa  567  1e-160  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7573  putative short chain dehydrogenase  48.47 
 
 		 454 aa  407  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4251  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  50.62 
 
 		 447 aa  365  1e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.044314  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2398  oxidoreductase  50.75 
 
 		 437 aa  356  5e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.683331 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04190  oxidoreductase  40.31 
 
 		 527 aa  314  2.9999999999999996e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44390  predicted protein  40.05 
 
 		 433 aa  273  5.000000000000001e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0516105 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10158  short-chain dehydrogenase  40.94 
 
 		 509 aa  261  3e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45855  predicted protein  39.25 
 
 		 650 aa  255  1.0000000000000001e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.306932  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1626  oxidoreductase  43.63 
 
 		 539 aa  253  5.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.498473  normal  0.638708 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1749  oxidoreductase  38.2 
 
 		 535 aa  249  7e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0726127  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1678  oxidoreductase  37.85 
 
 		 538 aa  246  4.9999999999999997e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00133842  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2199  oxidoreductase  37.92 
 
 		 539 aa  246  6.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0323008  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1793  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.34 
 
 		 268 aa  53.5  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.152096  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1529  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.11 
 
 		 328 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.392114 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.95 
 
 		 301 aa  52  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000491998  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2394  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.32 
 
 		 268 aa  52  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.097477 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.54 
 
 		 314 aa  51.6  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.825969 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3042  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.36 
 
 		 264 aa  51.6  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0939  short chain dehydrogenase  34.38 
 
 		 254 aa  51.2  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35800  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  35.96 
 
 		 285 aa  51.2  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.38 
 
 		 256 aa  51.2  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0601767 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6414  gluconate 5-dehydrogenase  36.73 
 
 		 254 aa  51.2  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0118789  normal  0.389185 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39 
 
 		 255 aa  50.8  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1212  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.63 
 
 		 238 aa  50.4  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal  0.539797 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1818  short chain dehydrogenase  34.02 
 
 		 255 aa  50.1  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.74 
 
 		 264 aa  50.1  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.296993 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3849  short chain dehydrogenase  31.61 
 
 		 260 aa  50.1  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1794  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.5 
 
 		 257 aa  50.1  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2623  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.3 
 
 		 284 aa  50.1  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.795257  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.3 
 
 		 284 aa  50.1  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.459641  normal  0.940814 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2348  polyketide synthase, putative  34 
 
 		 2137 aa  49.7  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0022  short chain dehydrogenase  36.36 
 
 		 293 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1038  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.48 
 
 		 247 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00179214  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3245  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 		 246 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3607  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.64 
 
 		 261 aa  49.7  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.197864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1054  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.09 
 
 		 289 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.137743 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 		 247 aa  49.7  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1064  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.48 
 
 		 247 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.104553  normal  0.448539 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2652  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.3 
 
 		 284 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690053  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2089  putative polyketide synthase  34.02 
 
 		 2338 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.71 
 
 		 246 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0020  short chain dehydrogenase  36.08 
 
 		 298 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1591  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.39 
 
 		 265 aa  48.9  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.222007  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0403  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.96 
 
 		 278 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19413  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0277  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  37.76 
 
 		 251 aa  49.3  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 		 246 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.790974  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1756  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.89 
 
 		 256 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3466  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.04 
 
 		 292 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.74 
 
 		 257 aa  48.9  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.759988  normal  0.0474831 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.43 
 
 		 351 aa  48.9  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.358421  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2129  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.34 
 
 		 289 aa  48.1  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0947  gluconate 5-dehydrogenase oxidoreductase protein  36.45 
 
 		 258 aa  48.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.815693 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2058  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.86 
 
 		 246 aa  48.5  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2596  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.94 
 
 		 287 aa  48.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.7335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1477  beta keto-acyl synthase  34.02 
 
 		 2273 aa  48.5  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0618  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.93 
 
 		 258 aa  48.1  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.063344  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1256  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.73 
 
 		 280 aa  48.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0882  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.54 
 
 		 262 aa  48.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.845671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2294  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.39 
 
 		 246 aa  48.5  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.11 
 
 		 286 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.239121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3179  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.3 
 
 		 254 aa  48.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0694225  normal  0.858211 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.95 
 
 		 258 aa  48.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0860  short chain dehydrogenase  35.96 
 
 		 291 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3147  putative polyketide synthase  34.02 
 
 		 2258 aa  48.5  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2380  putative polyketide synthase  34.02 
 
 		 2287 aa  48.5  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  39.13 
 
 		 255 aa  47.8  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0221  UDP-galactose 4-epimerase  34.07 
 
 		 347 aa  48.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  decreased coverage  0.000600389  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1484  gluconate 5-dehydrogenase  37.76 
 
 		 260 aa  47.8  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0155973  normal  0.0417322 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1443  gluconate 5-dehydrogenase  37.76 
 
 		 260 aa  47.8  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.325951  normal  0.0253033 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.96 
 
 		 341 aa  48.1  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.29527  normal  0.178629 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0287  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.02 
 
 		 253 aa  47.8  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.129193  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1116  putative polyketide synthase  33.68 
 
 		 2294 aa  47.8  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.107556  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 		 248 aa  47.4  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.46 
 
 		 254 aa  47.4  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4015  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.54 
 
 		 266 aa  47.8  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000395  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  28.5 
 
 		 252 aa  47.4  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.36672  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.8 
 
 		 252 aa  47.4  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.950748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3290  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.74 
 
 		 292 aa  47.4  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3749  short chain dehydrogenase  36.84 
 
 		 254 aa  47.4  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4753  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.29 
 
 		 284 aa  47.4  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.163262  normal  0.97721 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 		 295 aa  47.4  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1091  acetoin reductase  37.5 
 
 		 268 aa  47.4  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2392  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.62 
 
 		 255 aa  47.4  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.432373 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2577  short chain dehydrogenase  36.46 
 
 		 316 aa  47  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1523  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.76 
 
 		 269 aa  47.4  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.56 
 
 		 339 aa  47  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.38 
 
 		 249 aa  47  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.728081  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.63 
 
 		 240 aa  47  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>