91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_45855 on replicon NC_011676
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011676  PHATRDRAFT_45855  predicted protein  100 
 
 		 650 aa  1358    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.306932  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10158  short-chain dehydrogenase  41.72 
 
 		 509 aa  350  6e-95  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04190  oxidoreductase  42.8 
 
 		 527 aa  348  1e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2199  oxidoreductase  43.17 
 
 		 539 aa  328  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0323008  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1678  oxidoreductase  37.66 
 
 		 538 aa  325  1e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00133842  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1749  oxidoreductase  37.66 
 
 		 535 aa  323  5e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0726127  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0884  putative short chain dehydrogenase  38.35 
 
 		 570 aa  284  3.0000000000000004e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.51688 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2139  putative short chain dehydrogenase  38.49 
 
 		 483 aa  269  1e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.538588  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4441  putative short chain dehydrogenase  39.43 
 
 		 474 aa  268  2e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1886  putative oxidoreductase  38.24 
 
 		 483 aa  266  5.999999999999999e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00334435 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1517  oxidoreductase  38.96 
 
 		 492 aa  266  1e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00530  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  39.25 
 
 		 482 aa  259  9e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.191096  normal  0.164201 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2123  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.44 
 
 		 485 aa  252  1e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1920  putative short chain dehydrogenase  38.67 
 
 		 500 aa  252  2e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0270  putative short chain dehydrogenase  36.97 
 
 		 503 aa  249  8e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0850168  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00730  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  36.36 
 
 		 529 aa  249  9e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44390  predicted protein  53.67 
 
 		 433 aa  234  3e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0516105 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1626  oxidoreductase  43.8 
 
 		 539 aa  184  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.498473  normal  0.638708 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7573  putative short chain dehydrogenase  50 
 
 		 454 aa  168  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5303  oxidoreductase  39.6 
 
 		 463 aa  166  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1055  oxidoreductase  48.04 
 
 		 507 aa  164  3e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.730863  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4871  putative short chain dehydrogenase  48.89 
 
 		 495 aa  160  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00534901  normal  0.736841 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2398  oxidoreductase  48.62 
 
 		 437 aa  149  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.683331 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4251  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  37.5 
 
 		 447 aa  145  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.044314  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4550  Male sterility domain protein  29.41 
 
 		 659 aa  53.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0491  short chain dehydrogenase  28.3 
 
 		 668 aa  50.1  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0442129 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15671  short-chain dehydrogenase/reductase  31.11 
 
 		 300 aa  49.7  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0732777  normal  0.472072 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1457  hypothetical protein  40.54 
 
 		 213 aa  49.7  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.66 
 
 		 246 aa  48.1  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.667413 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.65 
 
 		 295 aa  48.1  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1041  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.66 
 
 		 246 aa  48.1  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0420142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.69 
 
 		 324 aa  48.1  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.010862 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.58 
 
 		 262 aa  48.1  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2801  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.38 
 
 		 248 aa  47.8  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1253  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.84 
 
 		 256 aa  47.8  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224395  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1270  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.84 
 
 		 256 aa  47.8  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0026  short chain dehydrogenase  29.2 
 
 		 319 aa  47.4  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122051  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_88990  predicted protein  29.2 
 
 		 363 aa  47.4  0.0009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0137755 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_89854  predicted protein  29.2 
 
 		 363 aa  47.4  0.0009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.264825  hitchhiker  0.0060203 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1280  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.03 
 
 		 256 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.367673  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1947  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.04 
 
 		 308 aa  46.6  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.156536  normal  0.0102569 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0944  short chain dehydrogenase  29.01 
 
 		 294 aa  47  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3350  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.43 
 
 		 314 aa  47  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.244541  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2507  short chain dehydrogenase  27.27 
 
 		 661 aa  46.6  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0729  short-chain dehydrogenase/reductase  28.89 
 
 		 308 aa  46.2  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.486158  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3526  short chain dehydrogenase  30.37 
 
 		 665 aa  46.6  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.309759  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10290  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.33 
 
 		 250 aa  45.8  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00209821  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0299  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.35 
 
 		 261 aa  45.4  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.385793 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 		 301 aa  45.8  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000491998  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1347  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  28.46 
 
 		 249 aa  45.8  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 		 239 aa  45.8  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47583  predicted protein  31.73 
 
 		 296 aa  45.8  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2573  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.37 
 
 		 248 aa  45.8  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000159991  hitchhiker  0.00324451 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.41 
 
 		 254 aa  45.8  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00727999  normal  0.180483 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0726  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.07 
 
 		 250 aa  45.8  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_65964  short-chain dehydrogenase/reductase (SDR) family protein  24.75 
 
 		 257 aa  45.4  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.647739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1719  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.37 
 
 		 248 aa  45.8  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131365  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54817  putative short chain dehydrogenase  31.63 
 
 		 255 aa  45.4  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.176178  normal  0.315077 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1582  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.37 
 
 		 248 aa  45.8  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000004002  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1716  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.37 
 
 		 248 aa  45.8  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000469264  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2494  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.69 
 
 		 248 aa  45.8  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000082608  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31 
 
 		 254 aa  45.4  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0672528  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1759  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.37 
 
 		 248 aa  45.8  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000535211  normal  0.457957 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1698  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.68 
 
 		 298 aa  45.4  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0217  short chain dehydrogenase  32.87 
 
 		 286 aa  45.1  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.743608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0143  short chain dehydrogenase  34.07 
 
 		 303 aa  45.1  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0945  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.45 
 
 		 328 aa  45.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165164  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1526  hypothetical protein  37.84 
 
 		 213 aa  45.1  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2326  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.67 
 
 		 249 aa  44.7  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2500  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.71 
 
 		 250 aa  45.1  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2701  oxidoreductase  35.11 
 
 		 320 aa  44.7  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0359887  normal  0.322148 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7081  oxidoreductase  32.98 
 
 		 321 aa  44.3  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.347841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0344  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  32.22 
 
 		 265 aa  44.7  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0690  short chain dehydrogenase  35.09 
 
 		 292 aa  44.7  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965776 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.31 
 
 		 307 aa  44.3  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0401995  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1088  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  31.68 
 
 		 250 aa  44.3  0.007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.885603  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3716  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.09 
 
 		 253 aa  44.3  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0213931 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1497  NAD/NADP dependent oxidoreductase  31.31 
 
 		 246 aa  44.3  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.445063  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1765  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.34 
 
 		 237 aa  44.3  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2293  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.63 
 
 		 248 aa  44.3  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000712528  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.19 
 
 		 248 aa  44.3  0.007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32278  putative short chain dehydrogenase  30.43 
 
 		 255 aa  44.3  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0032  short chain dehydrogenase  33.01 
 
 		 300 aa  44.3  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1980  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.63 
 
 		 248 aa  44.3  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000000830224  decreased coverage  0.000580002 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0686  oxidoreductase  32.14 
 
 		 324 aa  44.3  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.87 
 
 		 227 aa  43.9  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2564  short-chain dehydrogenase/reductase  32.26 
 
 		 302 aa  43.9  0.009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.554832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2499  short chain dehydrogenase  34.38 
 
 		 265 aa  43.9  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.830572  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1312  short chain dehydrogenase  34.38 
 
 		 265 aa  43.9  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.445214  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1239  short chain dehydrogenase  34.38 
 
 		 265 aa  43.9  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.363004  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1943  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.35 
 
 		 320 aa  43.9  0.01  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.756699  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>