165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7573 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7573  putative short chain dehydrogenase  100 
 
 		 454 aa  907    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4251  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  61.96 
 
 		 447 aa  462  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.044314  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4441  putative short chain dehydrogenase  52.61 
 
 		 474 aa  426  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5303  oxidoreductase  50.86 
 
 		 463 aa  421  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2398  oxidoreductase  57.64 
 
 		 437 aa  414  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.683331 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4871  putative short chain dehydrogenase  50.41 
 
 		 495 aa  409  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00534901  normal  0.736841 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00530  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  48.47 
 
 		 482 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.191096  normal  0.164201 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1886  putative oxidoreductase  48.35 
 
 		 483 aa  404  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00334435 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0884  putative short chain dehydrogenase  47.19 
 
 		 570 aa  399  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.51688 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2139  putative short chain dehydrogenase  46.9 
 
 		 483 aa  398  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.538588  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0270  putative short chain dehydrogenase  49.26 
 
 		 503 aa  390  1e-107  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0850168  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2123  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.65 
 
 		 485 aa  390  1e-107  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1920  putative short chain dehydrogenase  56.4 
 
 		 500 aa  382  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1055  oxidoreductase  46.49 
 
 		 507 aa  381  1e-104  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.730863  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1517  oxidoreductase  48.09 
 
 		 492 aa  381  1e-104  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00730  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  46.29 
 
 		 529 aa  355  1e-96  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04190  oxidoreductase  41.73 
 
 		 527 aa  305  9.000000000000001e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10158  short-chain dehydrogenase  40.18 
 
 		 509 aa  298  1e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44390  predicted protein  41.12 
 
 		 433 aa  280  3e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0516105 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2199  oxidoreductase  45.59 
 
 		 539 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0323008  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1678  oxidoreductase  45.34 
 
 		 538 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00133842  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1749  oxidoreductase  45.34 
 
 		 535 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0726127  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1626  oxidoreductase  43.72 
 
 		 539 aa  258  2e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.498473  normal  0.638708 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45855  predicted protein  50 
 
 		 650 aa  167  2.9999999999999998e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.306932  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1529  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.83 
 
 		 328 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.392114 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.45 
 
 		 240 aa  53.1  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0455  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.48 
 
 		 269 aa  53.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0513  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.41 
 
 		 233 aa  52  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.2 
 
 		 301 aa  52  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000491998  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2577  short chain dehydrogenase  42.55 
 
 		 316 aa  52.4  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.65 
 
 		 298 aa  52  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.51 
 
 		 324 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.11 
 
 		 314 aa  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.825969 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.66 
 
 		 239 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.63 
 
 		 295 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 		 286 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.239121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.78 
 
 		 256 aa  51.2  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0601767 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15641  short-chain dehydrogenase/reductase  30.48 
 
 		 309 aa  51.2  0.00004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4069  short chain dehydrogenase  31.37 
 
 		 239 aa  50.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0596677  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0699  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 		 312 aa  50.1  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.711865  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1086  short chain dehydrogenase  28.69 
 
 		 232 aa  50.1  0.00008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15491  short-chain dehydrogenase/reductase  31.37 
 
 		 309 aa  50.1  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.821697  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35363  predicted protein  27.48 
 
 		 253 aa  50.1  0.00009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.267844  normal  0.139954 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.31 
 
 		 255 aa  50.1  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4043  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.97 
 
 		 340 aa  50.1  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.138732  normal  0.0406215 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0979  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  28.69 
 
 		 232 aa  50.1  0.00009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.61 
 
 		 341 aa  50.1  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.29527  normal  0.178629 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.58 
 
 		 239 aa  49.7  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.475837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15241  short-chain dehydrogenase/reductase  29.66 
 
 		 309 aa  49.7  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.957013  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.89 
 
 		 312 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0287  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.62 
 
 		 253 aa  49.7  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.129193  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.04 
 
 		 333 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.726058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12290  short chain dehydrogenase  37.23 
 
 		 317 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.521938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2783  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.86 
 
 		 327 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.77 
 
 		 343 aa  48.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.550402 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5843  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.71 
 
 		 248 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.364281 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3748  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.67 
 
 		 331 aa  48.5  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3484  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.17 
 
 		 331 aa  48.5  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4410  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.67 
 
 		 331 aa  47.8  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0139677  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.71 
 
 		 227 aa  47.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1750  Male sterility domain protein  32.35 
 
 		 642 aa  47.8  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5032  gluconate 5-dehydrogenase  35.45 
 
 		 252 aa  47.4  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.930013  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1746  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.52 
 
 		 339 aa  47.8  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146223 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3640  oxidoreductase  33.65 
 
 		 318 aa  47.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2129  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  23.85 
 
 		 289 aa  47  0.0006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2188  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.67 
 
 		 292 aa  47.4  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.907948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1459  short-chain dehydrogenase/reductase  31.31 
 
 		 309 aa  47  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.392397  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3892  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.51 
 
 		 331 aa  47.4  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0013  2,3-dihydroxybenzoate-2,3-dehydrogenase  37.37 
 
 		 258 aa  47  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.7 
 
 		 324 aa  47  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3466  short chain dehydrogenase  37.5 
 
 		 294 aa  47  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.241299 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0010  2,3-dihydroxybenzoate-2,3-dehydrogenase  37.37 
 
 		 258 aa  47  0.0007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1793  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.68 
 
 		 268 aa  47  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.152096  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3986  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.74 
 
 		 297 aa  47  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3825  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.04 
 
 		 261 aa  46.6  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3895  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  36 
 
 		 248 aa  46.6  0.0009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.589012  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0042  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.64 
 
 		 282 aa  46.6  0.0009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144902 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0146  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.3 
 
 		 244 aa  46.2  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2849  glucose 1-dehydrogenase  38.68 
 
 		 245 aa  46.2  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.753993 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3237  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.45 
 
 		 308 aa  46.6  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.278854  normal  0.143787 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4214  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.59 
 
 		 262 aa  46.2  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3431  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.96 
 
 		 263 aa  46.6  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 		 310 aa  46.2  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0206248  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.94 
 
 		 247 aa  46.6  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.677675  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1765  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29 
 
 		 237 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6414  gluconate 5-dehydrogenase  32.35 
 
 		 254 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0118789  normal  0.389185 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.85 
 
 		 324 aa  45.8  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.010862 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.64 
 
 		 257 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2623  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.26 
 
 		 284 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.795257  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.48 
 
 		 300 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.319997  normal  0.350002 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0641  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.64 
 
 		 257 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.26 
 
 		 284 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.459641  normal  0.940814 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05560  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  34.26 
 
 		 303 aa  45.4  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0491  short chain dehydrogenase  29.23 
 
 		 668 aa  45.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0442129 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.52 
 
 		 339 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3749  short chain dehydrogenase  32.67 
 
 		 254 aa  45.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.07 
 
 		 303 aa  45.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0811669 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.19 
 
 		 303 aa  45.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.4 
 
 		 247 aa  45.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.64 
 
 		 257 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.600374  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>