111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3396 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3059  pyocin R2_PP, tail sheath protein  83.64 
 
 		 388 aa  668    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.181813 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3396  major tail sheath protein  100 
 
 		 387 aa  790    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4040  tail sheath protein  83.64 
 
 		 388 aa  680    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000103463 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1212  tail sheath protein  80.52 
 
 		 388 aa  632  1e-180  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.562456  hitchhiker  0.00316448 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0765  phage tail sheath protein  76.94 
 
 		 386 aa  614  1e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08070  putative phage tail sheath protein  75.91 
 
 		 386 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000271691  hitchhiker  0.000268611 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1860  phage tail sheath protein  68.49 
 
 		 389 aa  529  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1158  tail sheath protein  44.22 
 
 		 392 aa  305  1.0000000000000001e-81  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0397  contractile tail sheath protein  43.7 
 
 		 392 aa  303  5.000000000000001e-81  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.503837  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1136  contractile tail sheath protein  43.7 
 
 		 392 aa  303  5.000000000000001e-81  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1630  phage tail sheath protein  43.29 
 
 		 398 aa  301  2e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0887  tail sheath protein  41.1 
 
 		 400 aa  285  1.0000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1284  phage tail sheath protein  40.3 
 
 		 405 aa  272  8.000000000000001e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.326393 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0695  Phage tail sheath protein  40.21 
 
 		 391 aa  262  6e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0747  hypothetical protein  46.5 
 
 		 474 aa  224  2e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.346029  normal  0.109528 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2895  tail sheath protein  33.68 
 
 		 389 aa  220  3e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.736844 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3482  phage tail sheath protein  35.55 
 
 		 395 aa  220  3.9999999999999997e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.345078  normal  0.101066 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3192  tail sheath protein  35.6 
 
 		 389 aa  218  1e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2300  tail sheath protein  33.25 
 
 		 389 aa  215  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2347  tail sheath protein  32.98 
 
 		 391 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2848  major tail sheath protein  33.86 
 
 		 390 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3031  major tail sheath protein  33.86 
 
 		 390 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023583 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1815  tail sheath protein  34.55 
 
 		 389 aa  213  4.9999999999999996e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0447536  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2493  major tail sheath protein  33.77 
 
 		 390 aa  211  1e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2099  tail sheath protein  34.03 
 
 		 389 aa  212  1e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2187  tail sheath protein  32.45 
 
 		 389 aa  211  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0942  major tail sheath protein  33.25 
 
 		 390 aa  210  3e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2756  tail sheath protein  33.25 
 
 		 390 aa  210  3e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000512477 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0185  tail sheath protein  34.37 
 
 		 390 aa  209  8e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0863  tail sheath protein  33.51 
 
 		 389 aa  207  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.360153  hitchhiker  0.00380861 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4383  phage tail sheath protein  34.53 
 
 		 395 aa  206  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.301789  hitchhiker  0.000355682 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3030  phage tail sheath protein  34.43 
 
 		 396 aa  204  2e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296103 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4345  phage tail sheath protein  34.94 
 
 		 396 aa  202  6e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0327685 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4856  tail sheath protein  32.56 
 
 		 390 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3308  phage tail sheath protein  32.9 
 
 		 391 aa  192  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0738809  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1918  phage tail sheath-like protein  32.02 
 
 		 391 aa  191  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.947366 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37400  Phage P2 tail sheath FI-like protein  31.87 
 
 		 396 aa  191  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01344  phage tail sheath protein  32.89 
 
 		 388 aa  188  2e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.473608  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1379  phage tail sheath protein  30.15 
 
 		 394 aa  179  5.999999999999999e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.569041  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2213  major tail sheath protein  32.37 
 
 		 501 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2592  tail sheath protein  30.47 
 
 		 397 aa  167  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.290828  hitchhiker  0.0000000176032 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2626  tail sheath protein  30.47 
 
 		 397 aa  167  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129054  hitchhiker  0.000000715616 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1331  Phage tail sheath protein  30.53 
 
 		 390 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2675  phage tail sheath protein  29.58 
 
 		 394 aa  159  8e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.825453  normal  0.0163922 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1945  phage tail sheath protein  29.84 
 
 		 394 aa  157  3e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2664  tail sheath protein  28.61 
 
 		 397 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1565  tail sheath protein  33.44 
 
 		 475 aa  152  8.999999999999999e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2919  prophage MuMc02, tail sheath protein, putative  32.04 
 
 		 485 aa  151  2e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2897  tail sheath protein  33.11 
 
 		 475 aa  150  4e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4553  phage tail sheath protein  32.48 
 
 		 475 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.558981 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4469  phage tail sheath protein  32.48 
 
 		 475 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4554  phage tail sheath protein  32.48 
 
 		 475 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00163736  normal  0.433622 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2378  phage tail sheath protein  35.51 
 
 		 478 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3326  phage tail sheath protein  34.57 
 
 		 478 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.833077  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0227  major tail sheath protein  31.43 
 
 		 397 aa  127  3e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2295  phage tail sheath protein  33.19 
 
 		 476 aa  123  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0730038  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0691  Phage tail sheath protein FI-like protein  27.04 
 
 		 485 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3656  tail sheath protein  25.44 
 
 		 401 aa  95.5  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.175288  normal  0.0120421 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01996  hypothetical protein  26.51 
 
 		 387 aa  93.6  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2334  phage tail sheath protein  26.09 
 
 		 420 aa  87  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4383  tail sheath protein  28.89 
 
 		 544 aa  84  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.35186 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2938  tail sheath protein  27.13 
 
 		 509 aa  80.9  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316264  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26520  phage tail sheath protein FI  29.95 
 
 		 522 aa  79.3  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.849261  normal  0.473283 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5391  tail sheath protein  25.98 
 
 		 514 aa  76.6  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1424  tail sheath protein  30.48 
 
 		 522 aa  76.3  0.0000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0762  tail sheath protein  24.83 
 
 		 585 aa  74.3  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00265038  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1059  tail sheath protein  29.41 
 
 		 521 aa  74.3  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2260  tail sheath protein  29.69 
 
 		 521 aa  72.4  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0965214  hitchhiker  0.000887123 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3036  tail sheath protein  27.81 
 
 		 596 aa  70.5  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00018204 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1657  phage tail sheath protein  28.11 
 
 		 521 aa  70.1  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.713042  normal  0.0422731 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2823  tail sheath protein  28.11 
 
 		 521 aa  69.7  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.43909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1899  tail sheath protein  28.65 
 
 		 518 aa  69.3  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0131499  normal  0.0166431 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1882  tail sheath protein  27.31 
 
 		 724 aa  67  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.138498  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0932  phage tail sheath protein  27.84 
 
 		 512 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1145  Phage tail sheath protein FI-like  23.26 
 
 		 388 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1824  tail sheath protein  27.78 
 
 		 690 aa  64.7  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.414219  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1128  Phage tail sheath protein  26.56 
 
 		 638 aa  64.7  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3816  tail sheath protein  27.55 
 
 		 522 aa  63.9  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.414451  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0975  phage tail sheath protein, putative  28.19 
 
 		 660 aa  62.8  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1212  hypothetical protein  25.39 
 
 		 485 aa  62.4  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.127356  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1960  tail sheath protein  29.28 
 
 		 1117 aa  62  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.221062  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4130  hypothetical protein  25.09 
 
 		 428 aa  59.7  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.277985 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0804  tail sheath protein  25.89 
 
 		 551 aa  59.7  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.518886 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1560  tail sheath protein  28.42 
 
 		 405 aa  59.3  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0705385 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2896  phage tail sheath protein FI  24.57 
 
 		 405 aa  58.2  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.929294  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4249  phage tail sheath protein FI  25 
 
 		 402 aa  57.4  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.408866  normal  0.264788 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1491  hypothetical protein  23.04 
 
 		 501 aa  57  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0863  phage tail sheath protein  27.55 
 
 		 542 aa  56.2  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00698739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1874  Phage tail sheath protein  27.75 
 
 		 599 aa  55.5  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2564  hypothetical protein  27.69 
 
 		 781 aa  55.8  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00387686  hitchhiker  0.000000000127886 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1731  tail sheath protein  26.4 
 
 		 569 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000563063 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2043  Phage tail sheath protein FI-like protein  33.91 
 
 		 248 aa  54.3  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.751057  normal  0.823629 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1758  phage tail sheath protein  23.44 
 
 		 524 aa  53.5  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53821 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3660  tail sheath protein  24.89 
 
 		 585 aa  53.5  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0242469  hitchhiker  0.00259723 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4342  hypothetical protein  25.35 
 
 		 821 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161782  normal  0.0681295 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0832  phage tail sheath protein  26.19 
 
 		 644 aa  51.2  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4914  hypothetical protein  25.55 
 
 		 486 aa  51.6  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.832556 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3922  hypothetical protein  25.82 
 
 		 500 aa  50.8  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000725372  hitchhiker  0.00401697 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0579  hypothetical protein  26.09 
 
 		 428 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.903684  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3512  hypothetical protein  24.86 
 
 		 394 aa  50.4  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.222517  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>