101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3036 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3036  tail sheath protein  100 
 
 		 596 aa  1192    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00018204 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1882  tail sheath protein  51.18 
 
 		 724 aa  365  1e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.138498  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1059  tail sheath protein  35.6 
 
 		 521 aa  293  5e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0762  tail sheath protein  49.82 
 
 		 585 aa  290  4e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00265038  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5391  tail sheath protein  51.8 
 
 		 514 aa  288  1e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4383  tail sheath protein  51.06 
 
 		 544 aa  289  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.35186 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1899  tail sheath protein  51.42 
 
 		 518 aa  282  1e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0131499  normal  0.0166431 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0975  phage tail sheath protein, putative  52.48 
 
 		 660 aa  282  2e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2260  tail sheath protein  51 
 
 		 521 aa  278  2e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0965214  hitchhiker  0.000887123 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1960  tail sheath protein  51.23 
 
 		 1117 aa  278  3e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.221062  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0932  phage tail sheath protein  48.77 
 
 		 512 aa  276  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2938  tail sheath protein  40.23 
 
 		 509 aa  272  1e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316264  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4342  hypothetical protein  40.36 
 
 		 821 aa  270  7e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161782  normal  0.0681295 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1424  tail sheath protein  45.78 
 
 		 522 aa  267  4e-70  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3816  tail sheath protein  50.17 
 
 		 522 aa  263  6.999999999999999e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.414451  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26520  phage tail sheath protein FI  44.65 
 
 		 522 aa  262  2e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.849261  normal  0.473283 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2823  tail sheath protein  48 
 
 		 521 aa  260  4e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.43909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1657  phage tail sheath protein  48.33 
 
 		 521 aa  260  6e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.713042  normal  0.0422731 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0804  tail sheath protein  33.61 
 
 		 551 aa  258  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.518886 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3656  tail sheath protein  49.45 
 
 		 401 aa  258  3e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.175288  normal  0.0120421 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1758  phage tail sheath protein  31.36 
 
 		 524 aa  250  6e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53821 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1128  Phage tail sheath protein  35.71 
 
 		 638 aa  218  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2896  phage tail sheath protein FI  41.25 
 
 		 405 aa  217  4e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.929294  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1731  tail sheath protein  40.52 
 
 		 569 aa  216  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000563063 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3660  tail sheath protein  30.05 
 
 		 585 aa  213  7.999999999999999e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0242469  hitchhiker  0.00259723 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1501  tail sheath protein  38.32 
 
 		 514 aa  209  8e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1874  Phage tail sheath protein  34.37 
 
 		 599 aa  209  2e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2564  hypothetical protein  40.79 
 
 		 781 aa  203  6e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00387686  hitchhiker  0.000000000127886 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1560  tail sheath protein  42.61 
 
 		 405 aa  199  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0705385 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4249  phage tail sheath protein FI  42.75 
 
 		 402 aa  182  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.408866  normal  0.264788 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3614  putative phage tail sheath protein FI  44.62 
 
 		 649 aa  168  2.9999999999999998e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000782439 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5257  tail sheath protein  45.6 
 
 		 465 aa  166  9e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1505  tail sheath protein  43.06 
 
 		 522 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3150  Phage tail sheath protein FI-like protein  44.56 
 
 		 700 aa  163  9e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.81782  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1958  tail sheath protein  38.17 
 
 		 686 aa  160  9e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1038  hypothetical protein  37.12 
 
 		 470 aa  159  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0674  putative phage tail sheath protein FI  45.03 
 
 		 697 aa  159  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0863  phage tail sheath protein  39.29 
 
 		 542 aa  158  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00698739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0832  phage tail sheath protein  39.17 
 
 		 644 aa  157  7e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1827  phage tail sheath protein  33.16 
 
 		 802 aa  157  8e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1824  tail sheath protein  38.08 
 
 		 690 aa  156  8e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.414219  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1687  hypothetical protein  42 
 
 		 478 aa  151  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3512  hypothetical protein  35.82 
 
 		 394 aa  145  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.222517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0931  hypothetical protein  26.59 
 
 		 509 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.229261  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1889  hypothetical protein  26.59 
 
 		 509 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0540146  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4344  hypothetical protein  35.17 
 
 		 734 aa  134  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.500109  normal  0.105188 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2545  hypothetical protein  41.36 
 
 		 479 aa  133  9e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0845  Phage tail sheath protein FI-like protein  34.59 
 
 		 740 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0655  Phage tail sheath protein FI-like protein  34.59 
 
 		 740 aa  129  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1074  hypothetical protein  40.43 
 
 		 498 aa  127  7e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2466  hypothetical protein  40.54 
 
 		 497 aa  127  8.000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.424352 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3922  hypothetical protein  37.1 
 
 		 500 aa  124  6e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000725372  hitchhiker  0.00401697 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0681  hypothetical protein  36.15 
 
 		 517 aa  121  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.533709  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3815  phage tail sheath protein  27.93 
 
 		 509 aa  117  7.999999999999999e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0373  hypothetical protein  35.75 
 
 		 522 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3007  hypothetical protein  38.17 
 
 		 517 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0897  hypothetical protein  33.51 
 
 		 499 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.776782 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1041  hypothetical protein  33.51 
 
 		 499 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08070  putative phage tail sheath protein  27.34 
 
 		 386 aa  74.7  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000271691  hitchhiker  0.000268611 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3038  hypothetical protein  30.23 
 
 		 534 aa  73.6  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000011603 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0765  phage tail sheath protein  26.97 
 
 		 386 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1284  phage tail sheath protein  27.72 
 
 		 405 aa  71.6  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.326393 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1158  tail sheath protein  28.2 
 
 		 392 aa  70.9  0.00000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3396  major tail sheath protein  27.81 
 
 		 387 aa  70.5  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1860  phage tail sheath protein  25.81 
 
 		 389 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0397  contractile tail sheath protein  27.87 
 
 		 392 aa  69.3  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.503837  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1136  contractile tail sheath protein  27.87 
 
 		 392 aa  69.3  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1630  phage tail sheath protein  27.02 
 
 		 398 aa  68.9  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3059  pyocin R2_PP, tail sheath protein  26.22 
 
 		 388 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.181813 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0695  Phage tail sheath protein  25 
 
 		 391 aa  64.7  0.000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0747  hypothetical protein  29.28 
 
 		 474 aa  64.7  0.000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.346029  normal  0.109528 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4040  tail sheath protein  25.47 
 
 		 388 aa  63.9  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000103463 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0887  tail sheath protein  26.74 
 
 		 400 aa  63.9  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2213  major tail sheath protein  27.56 
 
 		 501 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1212  tail sheath protein  24.63 
 
 		 388 aa  60.8  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.562456  hitchhiker  0.00316448 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3308  phage tail sheath protein  25.94 
 
 		 391 aa  57.4  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0738809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2378  phage tail sheath protein  26.53 
 
 		 478 aa  56.6  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2295  phage tail sheath protein  25.18 
 
 		 476 aa  55.1  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0730038  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3326  phage tail sheath protein  26.61 
 
 		 478 aa  53.5  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.833077  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2592  tail sheath protein  25 
 
 		 397 aa  51.2  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.290828  hitchhiker  0.0000000176032 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2626  tail sheath protein  25 
 
 		 397 aa  51.2  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129054  hitchhiker  0.000000715616 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2848  major tail sheath protein  22.68 
 
 		 390 aa  51.2  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1918  phage tail sheath-like protein  26.03 
 
 		 391 aa  51.2  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.947366 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3031  major tail sheath protein  22.36 
 
 		 390 aa  49.7  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023583 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2919  prophage MuMc02, tail sheath protein, putative  24.43 
 
 		 485 aa  48.5  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37400  Phage P2 tail sheath FI-like protein  28.21 
 
 		 396 aa  48.1  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1565  tail sheath protein  25.68 
 
 		 475 aa  47.8  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2493  major tail sheath protein  22.82 
 
 		 390 aa  47.4  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2897  tail sheath protein  25.68 
 
 		 475 aa  47.4  0.0009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0185  tail sheath protein  26.62 
 
 		 390 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4553  phage tail sheath protein  26.62 
 
 		 475 aa  46.6  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.558981 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0942  major tail sheath protein  22.48 
 
 		 390 aa  46.2  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4554  phage tail sheath protein  26.62 
 
 		 475 aa  46.2  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00163736  normal  0.433622 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4469  phage tail sheath protein  26.62 
 
 		 475 aa  46.2  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4856  tail sheath protein  25.9 
 
 		 390 aa  45.4  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01344  phage tail sheath protein  26.72 
 
 		 388 aa  45.4  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.473608  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48496  predicted protein  38.27 
 
 		 460 aa  45.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.264136  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50210  predicted protein  38.27 
 
 		 521 aa  45.4  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.722754  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2756  tail sheath protein  22.48 
 
 		 390 aa  44.7  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000512477 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2347  tail sheath protein  23.27 
 
 		 391 aa  44.3  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>