91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01344 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_01344  phage tail sheath protein  100 
 
 		 388 aa  788    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.473608  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2895  tail sheath protein  60.94 
 
 		 389 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.736844 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3192  tail sheath protein  61.04 
 
 		 389 aa  472  1e-132  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0863  tail sheath protein  60.52 
 
 		 389 aa  473  1e-132  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.360153  hitchhiker  0.00380861 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2099  tail sheath protein  60.78 
 
 		 389 aa  471  1e-132  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2347  tail sheath protein  61.6 
 
 		 391 aa  472  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2187  tail sheath protein  61.82 
 
 		 389 aa  471  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2848  major tail sheath protein  61.08 
 
 		 390 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3308  phage tail sheath protein  61.3 
 
 		 391 aa  467  9.999999999999999e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0738809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2300  tail sheath protein  60.78 
 
 		 389 aa  466  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3031  major tail sheath protein  60.82 
 
 		 390 aa  468  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023583 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1815  tail sheath protein  60.52 
 
 		 389 aa  468  9.999999999999999e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0447536  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37400  Phage P2 tail sheath FI-like protein  61.68 
 
 		 396 aa  467  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2493  major tail sheath protein  60.67 
 
 		 390 aa  464  1e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0942  major tail sheath protein  60.67 
 
 		 390 aa  464  1e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2756  tail sheath protein  60.41 
 
 		 390 aa  463  1e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000512477 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4856  tail sheath protein  57.44 
 
 		 390 aa  457  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0185  tail sheath protein  56.92 
 
 		 390 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1918  phage tail sheath-like protein  58.35 
 
 		 391 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.947366 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3482  phage tail sheath protein  57.03 
 
 		 395 aa  444  1e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.345078  normal  0.101066 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3030  phage tail sheath protein  59.08 
 
 		 396 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296103 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4345  phage tail sheath protein  59.85 
 
 		 396 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0327685 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2592  tail sheath protein  59.14 
 
 		 397 aa  437  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.290828  hitchhiker  0.0000000176032 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1379  phage tail sheath protein  57.51 
 
 		 394 aa  435  1e-121  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.569041  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2626  tail sheath protein  59.14 
 
 		 397 aa  437  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129054  hitchhiker  0.000000715616 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4383  phage tail sheath protein  59.59 
 
 		 395 aa  434  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.301789  hitchhiker  0.000355682 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1331  Phage tail sheath protein  58.51 
 
 		 390 aa  432  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2664  tail sheath protein  51.52 
 
 		 397 aa  383  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1945  phage tail sheath protein  49.61 
 
 		 394 aa  353  2e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2675  phage tail sheath protein  49.22 
 
 		 394 aa  352  7e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.825453  normal  0.0163922 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1158  tail sheath protein  37.6 
 
 		 392 aa  249  8e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0397  contractile tail sheath protein  37.08 
 
 		 392 aa  246  4.9999999999999997e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.503837  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1136  contractile tail sheath protein  37.08 
 
 		 392 aa  246  4.9999999999999997e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0695  Phage tail sheath protein  40.37 
 
 		 391 aa  238  9e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1630  phage tail sheath protein  34.52 
 
 		 398 aa  224  2e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0887  tail sheath protein  34.5 
 
 		 400 aa  220  3e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08070  putative phage tail sheath protein  35.17 
 
 		 386 aa  199  6e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000271691  hitchhiker  0.000268611 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0765  phage tail sheath protein  34.91 
 
 		 386 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1284  phage tail sheath protein  33 
 
 		 405 aa  196  5.000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.326393 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3059  pyocin R2_PP, tail sheath protein  33.33 
 
 		 388 aa  192  9e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.181813 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4040  tail sheath protein  34.21 
 
 		 388 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000103463 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1212  tail sheath protein  33.59 
 
 		 388 aa  189  7e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.562456  hitchhiker  0.00316448 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3396  major tail sheath protein  32.89 
 
 		 387 aa  188  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1860  phage tail sheath protein  32.2 
 
 		 389 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2213  major tail sheath protein  31.56 
 
 		 501 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1565  tail sheath protein  32.89 
 
 		 475 aa  149  8e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2897  tail sheath protein  32.89 
 
 		 475 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4553  phage tail sheath protein  33.87 
 
 		 475 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.558981 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4469  phage tail sheath protein  33.87 
 
 		 475 aa  143  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4554  phage tail sheath protein  33.55 
 
 		 475 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00163736  normal  0.433622 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2919  prophage MuMc02, tail sheath protein, putative  32.26 
 
 		 485 aa  134  3e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0747  hypothetical protein  29.72 
 
 		 474 aa  117  3e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.346029  normal  0.109528 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2295  phage tail sheath protein  40.91 
 
 		 476 aa  103  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0730038  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2378  phage tail sheath protein  26.42 
 
 		 478 aa  100  4e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3326  phage tail sheath protein  37.58 
 
 		 478 aa  96.7  6e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.833077  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2334  phage tail sheath protein  26.42 
 
 		 420 aa  88.6  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0579  hypothetical protein  25.54 
 
 		 428 aa  77  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.903684  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4130  hypothetical protein  28.99 
 
 		 428 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.277985 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0691  Phage tail sheath protein FI-like protein  36.05 
 
 		 485 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1491  hypothetical protein  42.11 
 
 		 501 aa  68.2  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0762  tail sheath protein  28.33 
 
 		 585 aa  63.9  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00265038  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01996  hypothetical protein  25.2 
 
 		 387 aa  62.8  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2043  Phage tail sheath protein FI-like protein  30.83 
 
 		 248 aa  58.5  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.751057  normal  0.823629 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2065  hypothetical protein  65.79 
 
 		 46 aa  57.8  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000835722  decreased coverage  0.0000157116 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0227  major tail sheath protein  25.86 
 
 		 397 aa  57.4  0.0000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2260  tail sheath protein  24.87 
 
 		 521 aa  56.6  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0965214  hitchhiker  0.000887123 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1059  tail sheath protein  27.81 
 
 		 521 aa  55.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1212  hypothetical protein  22.98 
 
 		 485 aa  54.3  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.127356  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2938  tail sheath protein  25.63 
 
 		 509 aa  53.1  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316264  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3656  tail sheath protein  26.79 
 
 		 401 aa  53.5  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.175288  normal  0.0120421 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1424  tail sheath protein  26.04 
 
 		 522 aa  51.6  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4383  tail sheath protein  25.13 
 
 		 544 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.35186 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3816  tail sheath protein  23.57 
 
 		 522 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.414451  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26520  phage tail sheath protein FI  24.85 
 
 		 522 aa  51.2  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.849261  normal  0.473283 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1874  Phage tail sheath protein  27.43 
 
 		 599 aa  50.1  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1657  phage tail sheath protein  27.06 
 
 		 521 aa  49.7  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.713042  normal  0.0422731 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2823  tail sheath protein  27.06 
 
 		 521 aa  49.7  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.43909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1899  tail sheath protein  23.04 
 
 		 518 aa  49.7  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0131499  normal  0.0166431 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1882  tail sheath protein  26.37 
 
 		 724 aa  49.7  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.138498  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0975  phage tail sheath protein, putative  27.78 
 
 		 660 aa  48.9  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0932  phage tail sheath protein  23.3 
 
 		 512 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5391  tail sheath protein  23.76 
 
 		 514 aa  48.5  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4342  hypothetical protein  21.19 
 
 		 821 aa  48.9  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161782  normal  0.0681295 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4914  hypothetical protein  23.36 
 
 		 486 aa  45.8  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.832556 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3660  tail sheath protein  23.86 
 
 		 585 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0242469  hitchhiker  0.00259723 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3036  tail sheath protein  26.72 
 
 		 596 aa  45.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00018204 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1145  Phage tail sheath protein FI-like  23.86 
 
 		 388 aa  44.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1560  tail sheath protein  25.32 
 
 		 405 aa  44.3  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0705385 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0931  hypothetical protein  23.97 
 
 		 509 aa  43.1  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.229261  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1889  hypothetical protein  23.97 
 
 		 509 aa  43.1  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0540146  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3815  phage tail sheath protein  24.32 
 
 		 509 aa  43.1  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>