96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2378 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_2295  phage tail sheath protein  78.83 
 
 		 476 aa  749    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0730038  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2378  phage tail sheath protein  100 
 
 		 478 aa  970    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3326  phage tail sheath protein  96.23 
 
 		 478 aa  916    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.833077  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0747  hypothetical protein  42.55 
 
 		 474 aa  303  4.0000000000000003e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.346029  normal  0.109528 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1284  phage tail sheath protein  30.11 
 
 		 405 aa  161  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.326393 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2919  prophage MuMc02, tail sheath protein, putative  29.3 
 
 		 485 aa  160  5e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0691  Phage tail sheath protein FI-like protein  27.2 
 
 		 485 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1158  tail sheath protein  37.39 
 
 		 392 aa  150  6e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0887  tail sheath protein  40.69 
 
 		 400 aa  148  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0397  contractile tail sheath protein  36.97 
 
 		 392 aa  145  1e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.503837  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1136  contractile tail sheath protein  36.97 
 
 		 392 aa  145  1e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0695  Phage tail sheath protein  32.79 
 
 		 391 aa  144  3e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1565  tail sheath protein  29.38 
 
 		 475 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0765  phage tail sheath protein  35.92 
 
 		 386 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08070  putative phage tail sheath protein  34.38 
 
 		 386 aa  141  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000271691  hitchhiker  0.000268611 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2897  tail sheath protein  28.57 
 
 		 475 aa  139  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1212  tail sheath protein  36.33 
 
 		 388 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.562456  hitchhiker  0.00316448 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4554  phage tail sheath protein  36.02 
 
 		 475 aa  133  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00163736  normal  0.433622 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4553  phage tail sheath protein  36.02 
 
 		 475 aa  133  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.558981 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4469  phage tail sheath protein  35.63 
 
 		 475 aa  132  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4040  tail sheath protein  35.78 
 
 		 388 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000103463 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3059  pyocin R2_PP, tail sheath protein  35.1 
 
 		 388 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.181813 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3396  major tail sheath protein  35.51 
 
 		 387 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2213  major tail sheath protein  34.92 
 
 		 501 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1491  hypothetical protein  27.58 
 
 		 501 aa  129  9.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1860  phage tail sheath protein  33.06 
 
 		 389 aa  120  7e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2895  tail sheath protein  29.49 
 
 		 389 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.736844 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1630  phage tail sheath protein  32.89 
 
 		 398 aa  107  4e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01344  phage tail sheath protein  26.42 
 
 		 388 aa  100  6e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.473608  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1918  phage tail sheath-like protein  29.91 
 
 		 391 aa  100  6e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.947366 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37400  Phage P2 tail sheath FI-like protein  29.11 
 
 		 396 aa  99.8  9e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1945  phage tail sheath protein  24.24 
 
 		 394 aa  99  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1815  tail sheath protein  27.85 
 
 		 389 aa  95.9  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0447536  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0185  tail sheath protein  27.66 
 
 		 390 aa  95.5  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2664  tail sheath protein  29.44 
 
 		 397 aa  95.5  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4856  tail sheath protein  28.39 
 
 		 390 aa  94.4  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2347  tail sheath protein  28.35 
 
 		 391 aa  93.2  8e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2300  tail sheath protein  28.35 
 
 		 389 aa  93.2  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2187  tail sheath protein  28.35 
 
 		 389 aa  93.2  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0863  tail sheath protein  28.24 
 
 		 389 aa  92  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.360153  hitchhiker  0.00380861 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2099  tail sheath protein  27.73 
 
 		 389 aa  90.5  6e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2675  phage tail sheath protein  27.12 
 
 		 394 aa  90.1  8e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.825453  normal  0.0163922 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3192  tail sheath protein  27.43 
 
 		 389 aa  89.7  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0942  major tail sheath protein  27.38 
 
 		 390 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2756  tail sheath protein  27.97 
 
 		 390 aa  88.6  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000512477 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2493  major tail sheath protein  26.59 
 
 		 390 aa  87.4  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3031  major tail sheath protein  27.38 
 
 		 390 aa  87  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023583 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2848  major tail sheath protein  27.69 
 
 		 390 aa  87  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1331  Phage tail sheath protein  30 
 
 		 390 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3308  phage tail sheath protein  35.03 
 
 		 391 aa  85.5  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0738809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1379  phage tail sheath protein  29.71 
 
 		 394 aa  85.5  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.569041  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3030  phage tail sheath protein  25.85 
 
 		 396 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296103 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4383  phage tail sheath protein  34.38 
 
 		 395 aa  82.4  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.301789  hitchhiker  0.000355682 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2592  tail sheath protein  28.08 
 
 		 397 aa  80.5  0.00000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.290828  hitchhiker  0.0000000176032 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2626  tail sheath protein  28.08 
 
 		 397 aa  80.5  0.00000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129054  hitchhiker  0.000000715616 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4345  phage tail sheath protein  25.53 
 
 		 396 aa  80.1  0.00000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0327685 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3482  phage tail sheath protein  33.12 
 
 		 395 aa  77.8  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.345078  normal  0.101066 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2334  phage tail sheath protein  37.09 
 
 		 420 aa  69.3  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0762  tail sheath protein  30.54 
 
 		 585 aa  67.4  0.0000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00265038  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0227  major tail sheath protein  31.11 
 
 		 397 aa  65.9  0.000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1059  tail sheath protein  28.57 
 
 		 521 aa  58.9  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0975  phage tail sheath protein, putative  29.65 
 
 		 660 aa  58.9  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4130  hypothetical protein  34.09 
 
 		 428 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.277985 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3656  tail sheath protein  25.2 
 
 		 401 aa  57.4  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.175288  normal  0.0120421 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3036  tail sheath protein  27.24 
 
 		 596 aa  57  0.0000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00018204 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1212  hypothetical protein  27.48 
 
 		 485 aa  56.2  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.127356  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4383  tail sheath protein  27.32 
 
 		 544 aa  55.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.35186 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2938  tail sheath protein  26.37 
 
 		 509 aa  55.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316264  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2260  tail sheath protein  25.51 
 
 		 521 aa  55.1  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0965214  hitchhiker  0.000887123 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26520  phage tail sheath protein FI  26.49 
 
 		 522 aa  53.1  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.849261  normal  0.473283 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1882  tail sheath protein  25.49 
 
 		 724 aa  52.8  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.138498  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1424  tail sheath protein  26.09 
 
 		 522 aa  52.8  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4342  hypothetical protein  24.89 
 
 		 821 aa  52.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161782  normal  0.0681295 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0579  hypothetical protein  32.54 
 
 		 428 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.903684  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5257  tail sheath protein  29.1 
 
 		 465 aa  51.2  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2043  Phage tail sheath protein FI-like protein  29.7 
 
 		 248 aa  49.7  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.751057  normal  0.823629 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5391  tail sheath protein  25.51 
 
 		 514 aa  49.7  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1128  Phage tail sheath protein  26.52 
 
 		 638 aa  49.3  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1899  tail sheath protein  23.47 
 
 		 518 aa  48.5  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0131499  normal  0.0166431 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0788  RagB/SusD domain protein  44.44 
 
 		 603 aa  47.8  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0932  phage tail sheath protein  25 
 
 		 512 aa  47  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2823  tail sheath protein  31.19 
 
 		 521 aa  47  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.43909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1657  phage tail sheath protein  31.19 
 
 		 521 aa  47  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.713042  normal  0.0422731 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2752  hypothetical protein  28.74 
 
 		 288 aa  46.2  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0674  putative phage tail sheath protein FI  27.04 
 
 		 697 aa  46.2  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4344  hypothetical protein  23.75 
 
 		 734 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.500109  normal  0.105188 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3758  hypothetical protein  41.03 
 
 		 1074 aa  45.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.207079  normal  0.135364 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2137  hypothetical protein  43.82 
 
 		 308 aa  45.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.534217  normal  0.49056 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0832  phage tail sheath protein  26.92 
 
 		 644 aa  44.7  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1874  Phage tail sheath protein  28.35 
 
 		 599 aa  45.1  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1958  tail sheath protein  31.82 
 
 		 686 aa  45.1  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3816  tail sheath protein  27.12 
 
 		 522 aa  45.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.414451  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0923  hypothetical protein  30.71 
 
 		 476 aa  43.9  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.327125  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1758  phage tail sheath protein  29.1 
 
 		 524 aa  43.9  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53821 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1560  tail sheath protein  29.01 
 
 		 405 aa  43.1  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0705385 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0804  tail sheath protein  26.16 
 
 		 551 aa  43.1  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.518886 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>