60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2334 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2334  phage tail sheath protein  100 
 
 		 420 aa  856    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1491  hypothetical protein  49.01 
 
 		 501 aa  245  9.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4130  hypothetical protein  35.81 
 
 		 428 aa  227  3e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.277985 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0579  hypothetical protein  36.86 
 
 		 428 aa  226  6e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.903684  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1630  phage tail sheath protein  32.43 
 
 		 398 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1284  phage tail sheath protein  30.48 
 
 		 405 aa  127  5e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.326393 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0887  tail sheath protein  28.14 
 
 		 400 aa  117  5e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1158  tail sheath protein  27 
 
 		 392 aa  103  5e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3059  pyocin R2_PP, tail sheath protein  27.87 
 
 		 388 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.181813 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1136  contractile tail sheath protein  26.5 
 
 		 392 aa  99.4  1e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0397  contractile tail sheath protein  26.5 
 
 		 392 aa  99.4  1e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.503837  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08070  putative phage tail sheath protein  26.85 
 
 		 386 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000271691  hitchhiker  0.000268611 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1212  tail sheath protein  27.92 
 
 		 388 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.562456  hitchhiker  0.00316448 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1918  phage tail sheath-like protein  26.42 
 
 		 391 aa  93.2  7e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.947366 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2099  tail sheath protein  26.18 
 
 		 389 aa  92  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0765  phage tail sheath protein  26.45 
 
 		 386 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01344  phage tail sheath protein  26.42 
 
 		 388 aa  88.6  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.473608  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3396  major tail sheath protein  26.09 
 
 		 387 aa  87  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3192  tail sheath protein  25 
 
 		 389 aa  87  6e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2895  tail sheath protein  26.58 
 
 		 389 aa  87  6e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.736844 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1860  phage tail sheath protein  25.23 
 
 		 389 aa  86.3  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1815  tail sheath protein  26.32 
 
 		 389 aa  86.3  9e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0447536  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4856  tail sheath protein  25.23 
 
 		 390 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0691  Phage tail sheath protein FI-like protein  27.34 
 
 		 485 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0185  tail sheath protein  25.86 
 
 		 390 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4553  phage tail sheath protein  26.92 
 
 		 475 aa  80.1  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.558981 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3482  phage tail sheath protein  23.06 
 
 		 395 aa  80.1  0.00000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.345078  normal  0.101066 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1331  Phage tail sheath protein  26.05 
 
 		 390 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4040  tail sheath protein  26.62 
 
 		 388 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000103463 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4469  phage tail sheath protein  26.6 
 
 		 475 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4554  phage tail sheath protein  27.39 
 
 		 475 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00163736  normal  0.433622 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0695  Phage tail sheath protein  25.51 
 
 		 391 aa  77  0.0000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1379  phage tail sheath protein  23.75 
 
 		 394 aa  76.6  0.0000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.569041  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2213  major tail sheath protein  26.54 
 
 		 501 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37400  Phage P2 tail sheath FI-like protein  25.75 
 
 		 396 aa  74.3  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3308  phage tail sheath protein  25.07 
 
 		 391 aa  73.6  0.000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0738809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2300  tail sheath protein  25.21 
 
 		 389 aa  73.2  0.000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4345  phage tail sheath protein  23.91 
 
 		 396 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0327685 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2347  tail sheath protein  25.21 
 
 		 391 aa  72.8  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2187  tail sheath protein  25.21 
 
 		 389 aa  72.8  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2919  prophage MuMc02, tail sheath protein, putative  24.5 
 
 		 485 aa  72  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4383  phage tail sheath protein  24.45 
 
 		 395 aa  71.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.301789  hitchhiker  0.000355682 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3030  phage tail sheath protein  22.76 
 
 		 396 aa  70.1  0.00000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296103 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2378  phage tail sheath protein  37.09 
 
 		 478 aa  69.7  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0227  major tail sheath protein  22.37 
 
 		 397 aa  68.9  0.0000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2664  tail sheath protein  24.88 
 
 		 397 aa  68.9  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1565  tail sheath protein  24.71 
 
 		 475 aa  66.6  0.0000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2897  tail sheath protein  24.47 
 
 		 475 aa  65.9  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3326  phage tail sheath protein  36.42 
 
 		 478 aa  66.2  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.833077  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0863  tail sheath protein  23.7 
 
 		 389 aa  65.5  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.360153  hitchhiker  0.00380861 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2295  phage tail sheath protein  38.41 
 
 		 476 aa  63.2  0.000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0730038  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2756  tail sheath protein  24.38 
 
 		 390 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000512477 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2848  major tail sheath protein  24.69 
 
 		 390 aa  61.6  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3031  major tail sheath protein  24.69 
 
 		 390 aa  60.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023583 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0942  major tail sheath protein  23.89 
 
 		 390 aa  60.1  0.00000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0747  hypothetical protein  24.7 
 
 		 474 aa  59.7  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.346029  normal  0.109528 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2493  major tail sheath protein  23.65 
 
 		 390 aa  59.7  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2592  tail sheath protein  24.38 
 
 		 397 aa  55.5  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.290828  hitchhiker  0.0000000176032 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2626  tail sheath protein  24.38 
 
 		 397 aa  55.5  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129054  hitchhiker  0.000000715616 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01996  hypothetical protein  22.14 
 
 		 387 aa  43.9  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>