92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2099 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3192  tail sheath protein  88.43 
 
 		 389 aa  721    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0863  tail sheath protein  80.98 
 
 		 389 aa  660    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.360153  hitchhiker  0.00380861 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3482  phage tail sheath protein  76.2 
 
 		 395 aa  635    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.345078  normal  0.101066 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1815  tail sheath protein  95.12 
 
 		 389 aa  763    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0447536  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2099  tail sheath protein  100 
 
 		 389 aa  797    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4383  phage tail sheath protein  78.99 
 
 		 395 aa  639    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.301789  hitchhiker  0.000355682 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3030  phage tail sheath protein  77.72 
 
 		 396 aa  636    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296103 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4345  phage tail sheath protein  77.72 
 
 		 396 aa  634  1e-180  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0327685 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2300  tail sheath protein  74.29 
 
 		 389 aa  611  9.999999999999999e-175  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2187  tail sheath protein  73.52 
 
 		 389 aa  605  9.999999999999999e-173  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2347  tail sheath protein  72.94 
 
 		 391 aa  599  1e-170  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2756  tail sheath protein  72.61 
 
 		 390 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000512477 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0942  major tail sheath protein  72.61 
 
 		 390 aa  580  1e-164  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2493  major tail sheath protein  72.09 
 
 		 390 aa  579  1e-164  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2848  major tail sheath protein  71.69 
 
 		 390 aa  575  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3031  major tail sheath protein  71.5 
 
 		 390 aa  573  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023583 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2895  tail sheath protein  63.9 
 
 		 389 aa  536  1e-151  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.736844 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1918  phage tail sheath-like protein  64.95 
 
 		 391 aa  530  1e-149  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.947366 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4856  tail sheath protein  62.69 
 
 		 390 aa  519  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0185  tail sheath protein  62.44 
 
 		 390 aa  518  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37400  Phage P2 tail sheath FI-like protein  63.1 
 
 		 396 aa  506  9.999999999999999e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1379  phage tail sheath protein  59.79 
 
 		 394 aa  489  1e-137  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.569041  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3308  phage tail sheath protein  59.28 
 
 		 391 aa  478  1e-134  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0738809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1331  Phage tail sheath protein  60.52 
 
 		 390 aa  474  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01344  phage tail sheath protein  60.78 
 
 		 388 aa  471  1e-132  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.473608  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2626  tail sheath protein  58.57 
 
 		 397 aa  436  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129054  hitchhiker  0.000000715616 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2592  tail sheath protein  58.57 
 
 		 397 aa  436  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.290828  hitchhiker  0.0000000176032 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2664  tail sheath protein  53.06 
 
 		 397 aa  431  1e-119  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2675  phage tail sheath protein  47.49 
 
 		 394 aa  362  6e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.825453  normal  0.0163922 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1945  phage tail sheath protein  47.76 
 
 		 394 aa  358  8e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1136  contractile tail sheath protein  40.62 
 
 		 392 aa  292  5e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0397  contractile tail sheath protein  40.62 
 
 		 392 aa  292  5e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.503837  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1158  tail sheath protein  40.36 
 
 		 392 aa  290  4e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0887  tail sheath protein  38.25 
 
 		 400 aa  270  4e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1630  phage tail sheath protein  36.46 
 
 		 398 aa  261  2e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0695  Phage tail sheath protein  39.74 
 
 		 391 aa  247  2e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3059  pyocin R2_PP, tail sheath protein  36.72 
 
 		 388 aa  235  9e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.181813 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1284  phage tail sheath protein  35.57 
 
 		 405 aa  233  3e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.326393 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0765  phage tail sheath protein  36.65 
 
 		 386 aa  232  7.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08070  putative phage tail sheath protein  35.08 
 
 		 386 aa  231  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000271691  hitchhiker  0.000268611 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1212  tail sheath protein  36.88 
 
 		 388 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.562456  hitchhiker  0.00316448 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1860  phage tail sheath protein  37.66 
 
 		 389 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4040  tail sheath protein  35.06 
 
 		 388 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000103463 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3396  major tail sheath protein  34.03 
 
 		 387 aa  212  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2897  tail sheath protein  35.1 
 
 		 475 aa  171  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1565  tail sheath protein  34.77 
 
 		 475 aa  170  3e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2213  major tail sheath protein  32.47 
 
 		 501 aa  169  7e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4469  phage tail sheath protein  32.1 
 
 		 475 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4553  phage tail sheath protein  31.53 
 
 		 475 aa  159  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.558981 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4554  phage tail sheath protein  31.53 
 
 		 475 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00163736  normal  0.433622 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0747  hypothetical protein  31.87 
 
 		 474 aa  152  8.999999999999999e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.346029  normal  0.109528 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2919  prophage MuMc02, tail sheath protein, putative  31.02 
 
 		 485 aa  138  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2295  phage tail sheath protein  26.47 
 
 		 476 aa  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0730038  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2334  phage tail sheath protein  26.18 
 
 		 420 aa  92  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3326  phage tail sheath protein  36.36 
 
 		 478 aa  91.3  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.833077  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4130  hypothetical protein  30.32 
 
 		 428 aa  90.9  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.277985 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2378  phage tail sheath protein  27.73 
 
 		 478 aa  90.5  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0227  major tail sheath protein  24.03 
 
 		 397 aa  80.5  0.00000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1491  hypothetical protein  37.06 
 
 		 501 aa  77  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01996  hypothetical protein  23.94 
 
 		 387 aa  74.3  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3656  tail sheath protein  22.69 
 
 		 401 aa  73.6  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.175288  normal  0.0120421 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2065  hypothetical protein  76.74 
 
 		 46 aa  70.1  0.00000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000835722  decreased coverage  0.0000157116 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1145  Phage tail sheath protein FI-like  23.17 
 
 		 388 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3816  tail sheath protein  23.72 
 
 		 522 aa  63.9  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.414451  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0975  phage tail sheath protein, putative  23.68 
 
 		 660 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0579  hypothetical protein  28.08 
 
 		 428 aa  62  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.903684  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4383  tail sheath protein  25.5 
 
 		 544 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.35186 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0762  tail sheath protein  26.13 
 
 		 585 aa  60.8  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00265038  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4342  hypothetical protein  22.48 
 
 		 821 aa  60.5  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161782  normal  0.0681295 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1882  tail sheath protein  24.83 
 
 		 724 aa  60.5  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.138498  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2938  tail sheath protein  23.12 
 
 		 509 aa  58.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316264  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26520  phage tail sheath protein FI  27.01 
 
 		 522 aa  57.4  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.849261  normal  0.473283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0932  phage tail sheath protein  26.07 
 
 		 512 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1874  Phage tail sheath protein  23.46 
 
 		 599 aa  53.9  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0691  Phage tail sheath protein FI-like protein  28.28 
 
 		 485 aa  53.5  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4914  hypothetical protein  23.51 
 
 		 486 aa  53.1  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.832556 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1899  tail sheath protein  22.42 
 
 		 518 aa  53.1  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0131499  normal  0.0166431 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2043  Phage tail sheath protein FI-like protein  29.03 
 
 		 248 aa  52.8  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.751057  normal  0.823629 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1059  tail sheath protein  25.86 
 
 		 521 aa  52  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2260  tail sheath protein  23.27 
 
 		 521 aa  52  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0965214  hitchhiker  0.000887123 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2247  gp21  69.7 
 
 		 49 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0752264  normal  0.0219034 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1657  phage tail sheath protein  25.29 
 
 		 521 aa  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.713042  normal  0.0422731 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2823  tail sheath protein  25.29 
 
 		 521 aa  52  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.43909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5391  tail sheath protein  22.9 
 
 		 514 aa  51.2  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3660  tail sheath protein  23.24 
 
 		 585 aa  51.2  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0242469  hitchhiker  0.00259723 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1960  tail sheath protein  22.89 
 
 		 1117 aa  50.8  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.221062  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1560  tail sheath protein  26.7 
 
 		 405 aa  50.1  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0705385 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1212  hypothetical protein  23.62 
 
 		 485 aa  50.1  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.127356  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1501  tail sheath protein  25.41 
 
 		 514 aa  48.5  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1424  tail sheath protein  24.14 
 
 		 522 aa  46.6  0.0007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1731  tail sheath protein  22.12 
 
 		 569 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000563063 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0804  tail sheath protein  21.33 
 
 		 551 aa  42.7  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.518886 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>