100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1630 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1630  phage tail sheath protein  100 
 
 		 398 aa  800    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1284  phage tail sheath protein  54.07 
 
 		 405 aa  419  1e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.326393 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0887  tail sheath protein  54.59 
 
 		 400 aa  412  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1158  tail sheath protein  54.04 
 
 		 392 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0397  contractile tail sheath protein  54.29 
 
 		 392 aa  402  1e-111  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.503837  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1136  contractile tail sheath protein  54.29 
 
 		 392 aa  402  1e-111  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0695  Phage tail sheath protein  44.95 
 
 		 391 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0765  phage tail sheath protein  42.42 
 
 		 386 aa  311  1e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3059  pyocin R2_PP, tail sheath protein  42.46 
 
 		 388 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.181813 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08070  putative phage tail sheath protein  42.42 
 
 		 386 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000271691  hitchhiker  0.000268611 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3396  major tail sheath protein  43.29 
 
 		 387 aa  301  2e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1212  tail sheath protein  41.71 
 
 		 388 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.562456  hitchhiker  0.00316448 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4040  tail sheath protein  41.46 
 
 		 388 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000103463 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1860  phage tail sheath protein  39.75 
 
 		 389 aa  277  3e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0185  tail sheath protein  39.55 
 
 		 390 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2895  tail sheath protein  37.4 
 
 		 389 aa  268  8.999999999999999e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.736844 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4856  tail sheath protein  38.79 
 
 		 390 aa  268  1e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1918  phage tail sheath-like protein  38 
 
 		 391 aa  266  5e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.947366 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3192  tail sheath protein  37.97 
 
 		 389 aa  264  2e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2099  tail sheath protein  36.46 
 
 		 389 aa  261  2e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3482  phage tail sheath protein  36.16 
 
 		 395 aa  258  1e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.345078  normal  0.101066 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1815  tail sheath protein  35.95 
 
 		 389 aa  252  1e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0447536  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3308  phage tail sheath protein  38 
 
 		 391 aa  251  1e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0738809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0747  hypothetical protein  52.65 
 
 		 474 aa  249  4e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.346029  normal  0.109528 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4383  phage tail sheath protein  36.41 
 
 		 395 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.301789  hitchhiker  0.000355682 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2187  tail sheath protein  35.86 
 
 		 389 aa  246  4e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2347  tail sheath protein  35.79 
 
 		 391 aa  244  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2300  tail sheath protein  35.61 
 
 		 389 aa  243  5e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0863  tail sheath protein  35.7 
 
 		 389 aa  240  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.360153  hitchhiker  0.00380861 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3030  phage tail sheath protein  35.31 
 
 		 396 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296103 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4345  phage tail sheath protein  35.56 
 
 		 396 aa  240  4e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0327685 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1331  Phage tail sheath protein  37.34 
 
 		 390 aa  240  4e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2848  major tail sheath protein  35.53 
 
 		 390 aa  236  8e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3031  major tail sheath protein  35.28 
 
 		 390 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023583 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1379  phage tail sheath protein  35.25 
 
 		 394 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.569041  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2493  major tail sheath protein  33.84 
 
 		 390 aa  233  7.000000000000001e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2756  tail sheath protein  33.33 
 
 		 390 aa  232  8.000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000512477 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0942  major tail sheath protein  33.33 
 
 		 390 aa  231  2e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37400  Phage P2 tail sheath FI-like protein  35.15 
 
 		 396 aa  230  3e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01344  phage tail sheath protein  34.52 
 
 		 388 aa  224  2e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.473608  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2213  major tail sheath protein  36.01 
 
 		 501 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2592  tail sheath protein  33.25 
 
 		 397 aa  198  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.290828  hitchhiker  0.0000000176032 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2626  tail sheath protein  33.25 
 
 		 397 aa  198  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129054  hitchhiker  0.000000715616 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1945  phage tail sheath protein  31.39 
 
 		 394 aa  193  5e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2675  phage tail sheath protein  32.36 
 
 		 394 aa  192  7e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.825453  normal  0.0163922 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2664  tail sheath protein  31.02 
 
 		 397 aa  191  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4554  phage tail sheath protein  28.63 
 
 		 475 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00163736  normal  0.433622 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4553  phage tail sheath protein  28.42 
 
 		 475 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.558981 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2897  tail sheath protein  29.03 
 
 		 475 aa  142  8e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1565  tail sheath protein  29.5 
 
 		 475 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2919  prophage MuMc02, tail sheath protein, putative  32.49 
 
 		 485 aa  137  4e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2334  phage tail sheath protein  32.43 
 
 		 420 aa  132  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4469  phage tail sheath protein  30.91 
 
 		 475 aa  131  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2295  phage tail sheath protein  35.24 
 
 		 476 aa  122  7e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0730038  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1145  Phage tail sheath protein FI-like  28.35 
 
 		 388 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2378  phage tail sheath protein  32.89 
 
 		 478 aa  108  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3326  phage tail sheath protein  32.02 
 
 		 478 aa  104  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.833077  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4130  hypothetical protein  30.98 
 
 		 428 aa  104  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.277985 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01996  hypothetical protein  26.58 
 
 		 387 aa  102  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0691  Phage tail sheath protein FI-like protein  31.2 
 
 		 485 aa  99.8  9e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0227  major tail sheath protein  25.44 
 
 		 397 aa  98.6  2e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0579  hypothetical protein  29.32 
 
 		 428 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.903684  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1491  hypothetical protein  42.07 
 
 		 501 aa  95.1  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3656  tail sheath protein  25.18 
 
 		 401 aa  94.4  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.175288  normal  0.0120421 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0804  tail sheath protein  28.51 
 
 		 551 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.518886 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1212  hypothetical protein  26.92 
 
 		 485 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.127356  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2823  tail sheath protein  26.92 
 
 		 521 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.43909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4383  tail sheath protein  28.45 
 
 		 544 aa  78.2  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.35186 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1657  phage tail sheath protein  26.92 
 
 		 521 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.713042  normal  0.0422731 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0762  tail sheath protein  27.5 
 
 		 585 aa  75.5  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00265038  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4914  hypothetical protein  25.46 
 
 		 486 aa  75.9  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.832556 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3660  tail sheath protein  27.12 
 
 		 585 aa  75.5  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0242469  hitchhiker  0.00259723 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3816  tail sheath protein  28.7 
 
 		 522 aa  74.7  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.414451  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2260  tail sheath protein  28.85 
 
 		 521 aa  73.2  0.000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0965214  hitchhiker  0.000887123 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5391  tail sheath protein  28.57 
 
 		 514 aa  72  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26520  phage tail sheath protein FI  28.78 
 
 		 522 aa  71.2  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.849261  normal  0.473283 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1874  Phage tail sheath protein  29.05 
 
 		 599 aa  70.9  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1424  tail sheath protein  28.08 
 
 		 522 aa  70.9  0.00000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2938  tail sheath protein  26.57 
 
 		 509 aa  70.9  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316264  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1960  tail sheath protein  26.86 
 
 		 1117 aa  70.5  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.221062  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1731  tail sheath protein  27.6 
 
 		 569 aa  70.1  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000563063 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1882  tail sheath protein  26.79 
 
 		 724 aa  69.7  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.138498  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0975  phage tail sheath protein, putative  27.75 
 
 		 660 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2896  phage tail sheath protein FI  24.64 
 
 		 405 aa  65.9  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.929294  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1899  tail sheath protein  26.09 
 
 		 518 aa  65.5  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0131499  normal  0.0166431 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3036  tail sheath protein  27.56 
 
 		 596 aa  65.5  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00018204 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0932  phage tail sheath protein  26.29 
 
 		 512 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1059  tail sheath protein  26.11 
 
 		 521 aa  63.2  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1560  tail sheath protein  29.33 
 
 		 405 aa  61.2  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0705385 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2043  Phage tail sheath protein FI-like protein  32.09 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.751057  normal  0.823629 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4342  hypothetical protein  25 
 
 		 821 aa  58.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161782  normal  0.0681295 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1958  tail sheath protein  28.51 
 
 		 686 aa  54.7  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1501  tail sheath protein  25.35 
 
 		 514 aa  54.3  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4344  hypothetical protein  26.18 
 
 		 734 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.500109  normal  0.105188 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1824  tail sheath protein  26.67 
 
 		 690 aa  50.8  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.414219  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4249  phage tail sheath protein FI  23.15 
 
 		 402 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.408866  normal  0.264788 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0863  phage tail sheath protein  24.19 
 
 		 542 aa  46.6  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00698739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0923  hypothetical protein  22.58 
 
 		 476 aa  47  0.0007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.327125  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3614  putative phage tail sheath protein FI  25 
 
 		 649 aa  43.5  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000782439 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1758  phage tail sheath protein  24.32 
 
 		 524 aa  43.5  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53821 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>