80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1958 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1958  tail sheath protein  100 
 
 
686 aa  1340    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3660  tail sheath protein  29.87 
 
 
585 aa  223  7e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0242469  hitchhiker  0.00259723 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3816  tail sheath protein  41.9 
 
 
522 aa  203  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.414451  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4344  hypothetical protein  30.19 
 
 
734 aa  201  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.500109  normal  0.105188 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5391  tail sheath protein  39.09 
 
 
514 aa  192  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1059  tail sheath protein  41.9 
 
 
521 aa  192  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2260  tail sheath protein  42.46 
 
 
521 aa  192  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0965214  hitchhiker  0.000887123 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1424  tail sheath protein  42.29 
 
 
522 aa  190  1e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3656  tail sheath protein  41.96 
 
 
401 aa  188  3e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.175288  normal  0.0120421 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0975  phage tail sheath protein, putative  43.5 
 
 
660 aa  188  3e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2938  tail sheath protein  40.68 
 
 
509 aa  185  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316264  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26520  phage tail sheath protein FI  42.06 
 
 
522 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.849261  normal  0.473283 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2823  tail sheath protein  40.61 
 
 
521 aa  181  5.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.43909  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1657  phage tail sheath protein  40.23 
 
 
521 aa  180  8e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.713042  normal  0.0422731 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4383  tail sheath protein  37.59 
 
 
544 aa  179  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.35186 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1899  tail sheath protein  39.62 
 
 
518 aa  179  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0131499  normal  0.0166431 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4342  hypothetical protein  42.8 
 
 
821 aa  179  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161782  normal  0.0681295 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0762  tail sheath protein  39.59 
 
 
585 aa  177  6e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00265038  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0932  phage tail sheath protein  38.85 
 
 
512 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1501  tail sheath protein  39.92 
 
 
514 aa  173  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1960  tail sheath protein  39.62 
 
 
1117 aa  169  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.221062  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1882  tail sheath protein  38.55 
 
 
724 aa  163  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.138498  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1874  Phage tail sheath protein  38.24 
 
 
599 aa  163  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3036  tail sheath protein  38.17 
 
 
596 aa  160  1e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00018204 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0804  tail sheath protein  42.65 
 
 
551 aa  154  8e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.518886 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2896  phage tail sheath protein FI  34.7 
 
 
405 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.929294  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1731  tail sheath protein  33.95 
 
 
569 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000563063 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1560  tail sheath protein  35.44 
 
 
405 aa  133  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0705385 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4249  phage tail sheath protein FI  38.25 
 
 
402 aa  130  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.408866  normal  0.264788 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0863  phage tail sheath protein  35.16 
 
 
542 aa  130  7.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00698739  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1824  tail sheath protein  37.62 
 
 
690 aa  127  8.000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.414219  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1128  Phage tail sheath protein  31.61 
 
 
638 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1758  phage tail sheath protein  32.28 
 
 
524 aa  110  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.53821 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2564  hypothetical protein  30.57 
 
 
781 aa  108  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00387686  hitchhiker  0.000000000127886 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1505  tail sheath protein  33.73 
 
 
522 aa  107  7e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5257  tail sheath protein  30.1 
 
 
465 aa  103  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0674  putative phage tail sheath protein FI  35.29 
 
 
697 aa  102  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3150  Phage tail sheath protein FI-like protein  33.16 
 
 
700 aa  98.6  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.81782  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1827  phage tail sheath protein  31.54 
 
 
802 aa  97.8  6e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0681  hypothetical protein  35.52 
 
 
517 aa  97.1  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.533709  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3512  hypothetical protein  28.42 
 
 
394 aa  96.7  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.222517  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3614  putative phage tail sheath protein FI  30.54 
 
 
649 aa  95.5  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000782439 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3922  hypothetical protein  33.69 
 
 
500 aa  95.1  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000725372  hitchhiker  0.00401697 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1038  hypothetical protein  33.69 
 
 
470 aa  95.1  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3007  hypothetical protein  33.85 
 
 
517 aa  94  9e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0373  hypothetical protein  33.51 
 
 
522 aa  92  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0931  hypothetical protein  33.17 
 
 
509 aa  90.5  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.229261  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1889  hypothetical protein  33.17 
 
 
509 aa  90.5  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0540146  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1687  hypothetical protein  32.26 
 
 
478 aa  90.1  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3815  phage tail sheath protein  32.69 
 
 
509 aa  89.7  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0832  phage tail sheath protein  28.52 
 
 
644 aa  85.9  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2466  hypothetical protein  34.24 
 
 
497 aa  85.1  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.424352 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1074  hypothetical protein  32.8 
 
 
498 aa  81.3  0.00000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2545  hypothetical protein  32.26 
 
 
479 aa  77  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0845  Phage tail sheath protein FI-like protein  26.51 
 
 
740 aa  73.6  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0655  Phage tail sheath protein FI-like protein  25.37 
 
 
740 aa  70.9  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1284  phage tail sheath protein  29.65 
 
 
405 aa  65.1  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.326393 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08070  putative phage tail sheath protein  27.62 
 
 
386 aa  57.8  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000271691  hitchhiker  0.000268611 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1630  phage tail sheath protein  28.08 
 
 
398 aa  57.8  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0765  phage tail sheath protein  28 
 
 
386 aa  55.5  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4040  tail sheath protein  26.75 
 
 
388 aa  55.1  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000103463 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1041  hypothetical protein  23.71 
 
 
499 aa  53.9  0.000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0897  hypothetical protein  23.71 
 
 
499 aa  53.9  0.000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.776782 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1212  tail sheath protein  27.71 
 
 
388 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.562456  hitchhiker  0.00316448 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1860  phage tail sheath protein  25.23 
 
 
389 aa  52.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1136  contractile tail sheath protein  26.97 
 
 
392 aa  53.1  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0397  contractile tail sheath protein  26.97 
 
 
392 aa  53.1  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.503837  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2919  prophage MuMc02, tail sheath protein, putative  27.49 
 
 
485 aa  52.4  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3059  pyocin R2_PP, tail sheath protein  27.71 
 
 
388 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.181813 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3038  hypothetical protein  29.91 
 
 
534 aa  49.3  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000011603 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3396  major tail sheath protein  25.82 
 
 
387 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1158  tail sheath protein  25.9 
 
 
392 aa  48.9  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0747  hypothetical protein  28.89 
 
 
474 aa  48.1  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.346029  normal  0.109528 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0887  tail sheath protein  27.64 
 
 
400 aa  47  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2378  phage tail sheath protein  31.82 
 
 
478 aa  45.4  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2897  tail sheath protein  26.1 
 
 
475 aa  44.3  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2295  phage tail sheath protein  28 
 
 
476 aa  44.3  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0730038  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3482  phage tail sheath protein  23.78 
 
 
395 aa  44.3  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.345078  normal  0.101066 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1212  hypothetical protein  29.66 
 
 
485 aa  44.3  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.127356  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4856  tail sheath protein  25.39 
 
 
390 aa  43.9  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>