63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1212 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1212  hypothetical protein  100 
 
 		 485 aa  981    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.127356  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4914  hypothetical protein  49.59 
 
 		 486 aa  495  1e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.832556 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0923  hypothetical protein  35.64 
 
 		 476 aa  310  5.9999999999999995e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.327125  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4469  phage tail sheath protein  30.22 
 
 		 475 aa  161  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4553  phage tail sheath protein  30.02 
 
 		 475 aa  160  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.558981 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4554  phage tail sheath protein  30.02 
 
 		 475 aa  160  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00163736  normal  0.433622 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2919  prophage MuMc02, tail sheath protein, putative  29.98 
 
 		 485 aa  155  1e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2897  tail sheath protein  27.05 
 
 		 475 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1565  tail sheath protein  27.25 
 
 		 475 aa  146  8.000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1284  phage tail sheath protein  29.07 
 
 		 405 aa  94.4  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.326393 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0695  Phage tail sheath protein  29.03 
 
 		 391 aa  87.8  4e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0887  tail sheath protein  28.04 
 
 		 400 aa  85.5  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0747  hypothetical protein  29.43 
 
 		 474 aa  80.1  0.00000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.346029  normal  0.109528 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1630  phage tail sheath protein  26.92 
 
 		 398 aa  80.1  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1158  tail sheath protein  26.86 
 
 		 392 aa  77.4  0.0000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0397  contractile tail sheath protein  26.86 
 
 		 392 aa  74.3  0.000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.503837  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1136  contractile tail sheath protein  26.86 
 
 		 392 aa  74.3  0.000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08070  putative phage tail sheath protein  25.58 
 
 		 386 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000271691  hitchhiker  0.000268611 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1860  phage tail sheath protein  26.25 
 
 		 389 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3059  pyocin R2_PP, tail sheath protein  27.19 
 
 		 388 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.181813 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1212  tail sheath protein  26.45 
 
 		 388 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.562456  hitchhiker  0.00316448 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2664  tail sheath protein  26.5 
 
 		 397 aa  62.4  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0765  phage tail sheath protein  26.95 
 
 		 386 aa  62  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3396  major tail sheath protein  25.39 
 
 		 387 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2895  tail sheath protein  23.99 
 
 		 389 aa  61.2  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.736844 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1945  phage tail sheath protein  28.77 
 
 		 394 aa  57.8  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2675  phage tail sheath protein  27.27 
 
 		 394 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.825453  normal  0.0163922 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2213  major tail sheath protein  24.48 
 
 		 501 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1918  phage tail sheath-like protein  23.37 
 
 		 391 aa  57.8  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.947366 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2378  phage tail sheath protein  27.48 
 
 		 478 aa  56.2  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3326  phage tail sheath protein  27.48 
 
 		 478 aa  56.2  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.833077  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1899  tail sheath protein  26.14 
 
 		 518 aa  55.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0131499  normal  0.0166431 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0932  phage tail sheath protein  24.18 
 
 		 512 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2295  phage tail sheath protein  28.24 
 
 		 476 aa  54.7  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0730038  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01344  phage tail sheath protein  22.98 
 
 		 388 aa  54.3  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.473608  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4856  tail sheath protein  25.08 
 
 		 390 aa  54.3  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3308  phage tail sheath protein  23.51 
 
 		 391 aa  54.3  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0738809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1331  Phage tail sheath protein  26.26 
 
 		 390 aa  53.9  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0185  tail sheath protein  25.16 
 
 		 390 aa  53.9  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4040  tail sheath protein  24.53 
 
 		 388 aa  53.5  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000103463 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2938  tail sheath protein  25.87 
 
 		 509 aa  52.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316264  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4383  phage tail sheath protein  23.31 
 
 		 395 aa  52  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.301789  hitchhiker  0.000355682 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3816  tail sheath protein  25.98 
 
 		 522 aa  51.2  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.414451  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4345  phage tail sheath protein  25.16 
 
 		 396 aa  50.8  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0327685 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5391  tail sheath protein  25.24 
 
 		 514 aa  50.1  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1059  tail sheath protein  30.05 
 
 		 521 aa  50.1  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3030  phage tail sheath protein  24.76 
 
 		 396 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296103 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1379  phage tail sheath protein  26.24 
 
 		 394 aa  49.7  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.569041  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2099  tail sheath protein  23.62 
 
 		 389 aa  50.1  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26520  phage tail sheath protein FI  28.8 
 
 		 522 aa  49.3  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.849261  normal  0.473283 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2260  tail sheath protein  24.89 
 
 		 521 aa  48.5  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0965214  hitchhiker  0.000887123 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1815  tail sheath protein  23.95 
 
 		 389 aa  48.1  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0447536  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3656  tail sheath protein  31.65 
 
 		 401 aa  48.1  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.175288  normal  0.0120421 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1424  tail sheath protein  30.14 
 
 		 522 aa  47  0.0007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1657  phage tail sheath protein  25 
 
 		 521 aa  46.6  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.713042  normal  0.0422731 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2823  tail sheath protein  25.23 
 
 		 521 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.43909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2848  major tail sheath protein  23.05 
 
 		 390 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0863  tail sheath protein  24.03 
 
 		 389 aa  45.1  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.360153  hitchhiker  0.00380861 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3192  tail sheath protein  23.05 
 
 		 389 aa  44.7  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37400  Phage P2 tail sheath FI-like protein  26.81 
 
 		 396 aa  44.7  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2347  tail sheath protein  21.71 
 
 		 391 aa  44.7  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3031  major tail sheath protein  23.05 
 
 		 390 aa  43.9  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023583 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1958  tail sheath protein  29.66 
 
 		 686 aa  43.5  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>