108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2897 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2897  tail sheath protein  100 
 
 		 475 aa  977    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4554  phage tail sheath protein  74.42 
 
 		 475 aa  734    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00163736  normal  0.433622 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4553  phage tail sheath protein  74.42 
 
 		 475 aa  734    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.558981 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4469  phage tail sheath protein  74.63 
 
 		 475 aa  735    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1565  tail sheath protein  98.11 
 
 		 475 aa  962    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2919  prophage MuMc02, tail sheath protein, putative  52.17 
 
 		 485 aa  495  1e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0747  hypothetical protein  33.13 
 
 		 474 aa  206  6e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.346029  normal  0.109528 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0695  Phage tail sheath protein  39.07 
 
 		 391 aa  203  6e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1284  phage tail sheath protein  36.23 
 
 		 405 aa  180  4.999999999999999e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.326393 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08070  putative phage tail sheath protein  34.8 
 
 		 386 aa  178  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000271691  hitchhiker  0.000268611 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0765  phage tail sheath protein  35.86 
 
 		 386 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2213  major tail sheath protein  38.25 
 
 		 501 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1158  tail sheath protein  36.31 
 
 		 392 aa  174  3.9999999999999995e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0397  contractile tail sheath protein  33.42 
 
 		 392 aa  172  1e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.503837  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1136  contractile tail sheath protein  33.42 
 
 		 392 aa  172  1e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2099  tail sheath protein  35.1 
 
 		 389 aa  171  3e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3192  tail sheath protein  28.78 
 
 		 389 aa  169  7e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2493  major tail sheath protein  34.34 
 
 		 390 aa  167  4e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1815  tail sheath protein  34.11 
 
 		 389 aa  167  4e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0447536  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0942  major tail sheath protein  34.01 
 
 		 390 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2756  tail sheath protein  33.44 
 
 		 390 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000512477 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0185  tail sheath protein  30.39 
 
 		 390 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3059  pyocin R2_PP, tail sheath protein  33.14 
 
 		 388 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.181813 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1918  phage tail sheath-like protein  34 
 
 		 391 aa  162  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.947366 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1212  tail sheath protein  33.76 
 
 		 388 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.562456  hitchhiker  0.00316448 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4856  tail sheath protein  33.33 
 
 		 390 aa  159  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4040  tail sheath protein  35.08 
 
 		 388 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000103463 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1860  phage tail sheath protein  34.08 
 
 		 389 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2848  major tail sheath protein  32.67 
 
 		 390 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3482  phage tail sheath protein  30.1 
 
 		 395 aa  154  2.9999999999999998e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.345078  normal  0.101066 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2895  tail sheath protein  31.6 
 
 		 389 aa  154  4e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.736844 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3031  major tail sheath protein  32.67 
 
 		 390 aa  154  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023583 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37400  Phage P2 tail sheath FI-like protein  33.22 
 
 		 396 aa  154  4e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2187  tail sheath protein  33.11 
 
 		 389 aa  150  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2300  tail sheath protein  33.11 
 
 		 389 aa  150  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2347  tail sheath protein  32.89 
 
 		 391 aa  150  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3396  major tail sheath protein  33.11 
 
 		 387 aa  150  5e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4383  phage tail sheath protein  33.77 
 
 		 395 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.301789  hitchhiker  0.000355682 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1212  hypothetical protein  27.05 
 
 		 485 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.127356  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01344  phage tail sheath protein  32.89 
 
 		 388 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.473608  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4914  hypothetical protein  28.2 
 
 		 486 aa  146  9e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.832556 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0863  tail sheath protein  27.1 
 
 		 389 aa  145  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.360153  hitchhiker  0.00380861 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2295  phage tail sheath protein  37.31 
 
 		 476 aa  144  4e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0730038  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2664  tail sheath protein  31.56 
 
 		 397 aa  144  4e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3308  phage tail sheath protein  28.82 
 
 		 391 aa  143  5e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0738809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4345  phage tail sheath protein  32.12 
 
 		 396 aa  143  8e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0327685 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1630  phage tail sheath protein  29.03 
 
 		 398 aa  142  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3326  phage tail sheath protein  29.46 
 
 		 478 aa  141  3e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.833077  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0887  tail sheath protein  30.99 
 
 		 400 aa  140  3.9999999999999997e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3030  phage tail sheath protein  31.46 
 
 		 396 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296103 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2378  phage tail sheath protein  29.06 
 
 		 478 aa  139  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1945  phage tail sheath protein  31.99 
 
 		 394 aa  139  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2592  tail sheath protein  33 
 
 		 397 aa  138  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.290828  hitchhiker  0.0000000176032 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2626  tail sheath protein  33 
 
 		 397 aa  138  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129054  hitchhiker  0.000000715616 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1379  phage tail sheath protein  29.43 
 
 		 394 aa  137  5e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.569041  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1331  Phage tail sheath protein  31.69 
 
 		 390 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2675  phage tail sheath protein  31.31 
 
 		 394 aa  134  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.825453  normal  0.0163922 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0923  hypothetical protein  24.27 
 
 		 476 aa  101  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.327125  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2938  tail sheath protein  24.66 
 
 		 509 aa  100  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316264  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5391  tail sheath protein  24.95 
 
 		 514 aa  94.4  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1874  Phage tail sheath protein  32.23 
 
 		 599 aa  90.5  7e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2260  tail sheath protein  27.97 
 
 		 521 aa  84.3  0.000000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0965214  hitchhiker  0.000887123 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3656  tail sheath protein  26.76 
 
 		 401 aa  83.2  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.175288  normal  0.0120421 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1059  tail sheath protein  28.62 
 
 		 521 aa  80.9  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26520  phage tail sheath protein FI  28.57 
 
 		 522 aa  80.5  0.00000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.849261  normal  0.473283 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2043  Phage tail sheath protein FI-like protein  39.67 
 
 		 248 aa  79.7  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.751057  normal  0.823629 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1424  tail sheath protein  28.79 
 
 		 522 aa  79.3  0.0000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3816  tail sheath protein  27.42 
 
 		 522 aa  78.6  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.414451  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0762  tail sheath protein  25.85 
 
 		 585 aa  77.4  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00265038  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0932  phage tail sheath protein  22.61 
 
 		 512 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0975  phage tail sheath protein, putative  26.38 
 
 		 660 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4383  tail sheath protein  26.46 
 
 		 544 aa  74.3  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.35186 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1899  tail sheath protein  26.24 
 
 		 518 aa  68.2  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0131499  normal  0.0166431 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2896  phage tail sheath protein FI  26.55 
 
 		 405 aa  67  0.0000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.929294  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4249  phage tail sheath protein FI  29.69 
 
 		 402 aa  67  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.408866  normal  0.264788 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2334  phage tail sheath protein  24.47 
 
 		 420 aa  65.9  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0227  major tail sheath protein  24.28 
 
 		 397 aa  64.7  0.000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0804  tail sheath protein  26.64 
 
 		 551 aa  64.7  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.518886 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1657  phage tail sheath protein  25.8 
 
 		 521 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.713042  normal  0.0422731 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2823  tail sheath protein  26.85 
 
 		 521 aa  61.6  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.43909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01996  hypothetical protein  23.32 
 
 		 387 aa  61.6  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1501  tail sheath protein  22.44 
 
 		 514 aa  61.2  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1128  Phage tail sheath protein  23.79 
 
 		 638 aa  60.8  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1560  tail sheath protein  30 
 
 		 405 aa  59.7  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0705385 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1505  tail sheath protein  22.56 
 
 		 522 aa  56.2  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0863  phage tail sheath protein  25.65 
 
 		 542 aa  55.5  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00698739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1882  tail sheath protein  25.48 
 
 		 724 aa  52.8  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.138498  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2564  hypothetical protein  27.31 
 
 		 781 aa  52.4  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00387686  hitchhiker  0.000000000127886 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0832  phage tail sheath protein  25.73 
 
 		 644 aa  51.2  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4342  hypothetical protein  26.82 
 
 		 821 aa  51.2  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161782  normal  0.0681295 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1491  hypothetical protein  23.15 
 
 		 501 aa  51.2  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1824  tail sheath protein  26.57 
 
 		 690 aa  50.4  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.414219  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0931  hypothetical protein  21.96 
 
 		 509 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.229261  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1889  hypothetical protein  21.96 
 
 		 509 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0540146  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1758  phage tail sheath protein  27.44 
 
 		 524 aa  48.1  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53821 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0691  Phage tail sheath protein FI-like protein  24.6 
 
 		 485 aa  47.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3815  phage tail sheath protein  22.51 
 
 		 509 aa  47  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3036  tail sheath protein  25.68 
 
 		 596 aa  47  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00018204 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1827  phage tail sheath protein  24.6 
 
 		 802 aa  47  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0674  putative phage tail sheath protein FI  28.1 
 
 		 697 aa  46.6  0.0009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>