111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1860 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1860  phage tail sheath protein  100 
 
 		 389 aa  795    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0765  phage tail sheath protein  71.28 
 
 		 386 aa  571  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08070  putative phage tail sheath protein  70.76 
 
 		 386 aa  568  1e-161  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000271691  hitchhiker  0.000268611 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3059  pyocin R2_PP, tail sheath protein  69.79 
 
 		 388 aa  559  1e-158  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.181813 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1212  tail sheath protein  70.94 
 
 		 388 aa  551  1e-156  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.562456  hitchhiker  0.00316448 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4040  tail sheath protein  68.41 
 
 		 388 aa  549  1e-155  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000103463 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3396  major tail sheath protein  68.49 
 
 		 387 aa  544  1e-154  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0887  tail sheath protein  43.07 
 
 		 400 aa  300  4e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1158  tail sheath protein  42.56 
 
 		 392 aa  294  1e-78  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0397  contractile tail sheath protein  42.56 
 
 		 392 aa  293  4e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.503837  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1136  contractile tail sheath protein  42.56 
 
 		 392 aa  293  4e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1630  phage tail sheath protein  39.75 
 
 		 398 aa  281  1e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1284  phage tail sheath protein  40.94 
 
 		 405 aa  278  2e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.326393 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0695  Phage tail sheath protein  42.01 
 
 		 391 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2099  tail sheath protein  37.66 
 
 		 389 aa  228  1e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1815  tail sheath protein  36.88 
 
 		 389 aa  227  2e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0447536  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0747  hypothetical protein  41.01 
 
 		 474 aa  226  7e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.346029  normal  0.109528 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3192  tail sheath protein  36.2 
 
 		 389 aa  224  3e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2493  major tail sheath protein  36.39 
 
 		 390 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0942  major tail sheath protein  36.39 
 
 		 390 aa  223  6e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2756  tail sheath protein  36.39 
 
 		 390 aa  223  6e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000512477 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2347  tail sheath protein  34.54 
 
 		 391 aa  220  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2895  tail sheath protein  33.86 
 
 		 389 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.736844 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0185  tail sheath protein  35.42 
 
 		 390 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3482  phage tail sheath protein  35.11 
 
 		 395 aa  216  5e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.345078  normal  0.101066 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2848  major tail sheath protein  35.94 
 
 		 390 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4856  tail sheath protein  34.64 
 
 		 390 aa  216  8e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1918  phage tail sheath-like protein  34.46 
 
 		 391 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.947366 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2300  tail sheath protein  34.03 
 
 		 389 aa  215  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3031  major tail sheath protein  35.94 
 
 		 390 aa  215  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023583 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2187  tail sheath protein  34.03 
 
 		 389 aa  214  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4383  phage tail sheath protein  35.13 
 
 		 395 aa  209  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.301789  hitchhiker  0.000355682 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0863  tail sheath protein  33.77 
 
 		 389 aa  206  5e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.360153  hitchhiker  0.00380861 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4345  phage tail sheath protein  34.53 
 
 		 396 aa  205  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0327685 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3030  phage tail sheath protein  33.76 
 
 		 396 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296103 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37400  Phage P2 tail sheath FI-like protein  33.68 
 
 		 396 aa  201  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1331  Phage tail sheath protein  33.86 
 
 		 390 aa  189  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3308  phage tail sheath protein  32.04 
 
 		 391 aa  188  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0738809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1379  phage tail sheath protein  30.31 
 
 		 394 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.569041  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01344  phage tail sheath protein  32.2 
 
 		 388 aa  176  4e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.473608  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2592  tail sheath protein  32.39 
 
 		 397 aa  174  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.290828  hitchhiker  0.0000000176032 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2626  tail sheath protein  32.39 
 
 		 397 aa  174  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129054  hitchhiker  0.000000715616 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2213  major tail sheath protein  31.52 
 
 		 501 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2897  tail sheath protein  34.08 
 
 		 475 aa  158  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1565  tail sheath protein  33.44 
 
 		 475 aa  154  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2919  prophage MuMc02, tail sheath protein, putative  33.33 
 
 		 485 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4553  phage tail sheath protein  32.39 
 
 		 475 aa  152  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.558981 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4469  phage tail sheath protein  32.39 
 
 		 475 aa  152  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4554  phage tail sheath protein  32.08 
 
 		 475 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00163736  normal  0.433622 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2675  phage tail sheath protein  31.25 
 
 		 394 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.825453  normal  0.0163922 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2664  tail sheath protein  28.75 
 
 		 397 aa  146  8.000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1945  phage tail sheath protein  30.66 
 
 		 394 aa  133  6e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0227  major tail sheath protein  31.16 
 
 		 397 aa  125  1e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2378  phage tail sheath protein  33.06 
 
 		 478 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2295  phage tail sheath protein  32.37 
 
 		 476 aa  119  7e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0730038  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3326  phage tail sheath protein  32.37 
 
 		 478 aa  116  6e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.833077  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0691  Phage tail sheath protein FI-like protein  31.43 
 
 		 485 aa  106  7e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01996  hypothetical protein  27.97 
 
 		 387 aa  106  9e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1145  Phage tail sheath protein FI-like  26.57 
 
 		 388 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3656  tail sheath protein  24.02 
 
 		 401 aa  90.1  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.175288  normal  0.0120421 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2334  phage tail sheath protein  25 
 
 		 420 aa  86.3  8e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4130  hypothetical protein  25.07 
 
 		 428 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.277985 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4383  tail sheath protein  27.99 
 
 		 544 aa  79.7  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.35186 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2938  tail sheath protein  29.11 
 
 		 509 aa  79  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316264  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26520  phage tail sheath protein FI  27.69 
 
 		 522 aa  78.2  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.849261  normal  0.473283 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2260  tail sheath protein  28.37 
 
 		 521 aa  78.6  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0965214  hitchhiker  0.000887123 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1424  tail sheath protein  29.59 
 
 		 522 aa  77.4  0.0000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5391  tail sheath protein  28.37 
 
 		 514 aa  76.6  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2823  tail sheath protein  27.75 
 
 		 521 aa  73.6  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.43909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1657  phage tail sheath protein  27.75 
 
 		 521 aa  73.6  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.713042  normal  0.0422731 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1059  tail sheath protein  27.46 
 
 		 521 aa  73.2  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0762  tail sheath protein  26.26 
 
 		 585 aa  72.8  0.000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00265038  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1899  tail sheath protein  27.88 
 
 		 518 aa  72  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0131499  normal  0.0166431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4249  phage tail sheath protein FI  23.03 
 
 		 402 aa  71.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.408866  normal  0.264788 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0579  hypothetical protein  27.72 
 
 		 428 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.903684  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3036  tail sheath protein  25.81 
 
 		 596 aa  70.1  0.00000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00018204 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1128  Phage tail sheath protein  27.17 
 
 		 638 aa  69.7  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1882  tail sheath protein  26.89 
 
 		 724 aa  68.9  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.138498  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0932  phage tail sheath protein  29.02 
 
 		 512 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1212  hypothetical protein  26.25 
 
 		 485 aa  68.2  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.127356  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0804  tail sheath protein  25.42 
 
 		 551 aa  67  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.518886 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0975  phage tail sheath protein, putative  27.72 
 
 		 660 aa  65.5  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1960  tail sheath protein  27.37 
 
 		 1117 aa  65.1  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.221062  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1731  tail sheath protein  26.9 
 
 		 569 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000563063 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3816  tail sheath protein  26.07 
 
 		 522 aa  63.9  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.414451  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1824  tail sheath protein  28.47 
 
 		 690 aa  64.3  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.414219  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2896  phage tail sheath protein FI  28.11 
 
 		 405 aa  62.4  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.929294  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0863  phage tail sheath protein  24.5 
 
 		 542 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00698739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2564  hypothetical protein  25.93 
 
 		 781 aa  57.8  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00387686  hitchhiker  0.000000000127886 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1560  tail sheath protein  27.78 
 
 		 405 aa  57  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0705385 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4344  hypothetical protein  24.26 
 
 		 734 aa  55.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.500109  normal  0.105188 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3660  tail sheath protein  25.41 
 
 		 585 aa  55.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0242469  hitchhiker  0.00259723 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2043  Phage tail sheath protein FI-like protein  31.03 
 
 		 248 aa  55.1  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.751057  normal  0.823629 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1874  Phage tail sheath protein  26.46 
 
 		 599 aa  53.9  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4342  hypothetical protein  24.14 
 
 		 821 aa  53.9  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161782  normal  0.0681295 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3922  hypothetical protein  27.03 
 
 		 500 aa  53.1  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000725372  hitchhiker  0.00401697 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3512  hypothetical protein  24.01 
 
 		 394 aa  52.8  0.000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.222517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5257  tail sheath protein  24.21 
 
 		 465 aa  52.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1827  phage tail sheath protein  27.31 
 
 		 802 aa  52  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1958  tail sheath protein  25.23 
 
 		 686 aa  52  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>