119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3656 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3656  tail sheath protein  100 
 
 		 401 aa  828    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.175288  normal  0.0120421 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2896  phage tail sheath protein FI  50.35 
 
 		 405 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.929294  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1560  tail sheath protein  49.89 
 
 		 405 aa  338  8e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0705385 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0975  phage tail sheath protein, putative  57.14 
 
 		 660 aa  327  3e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0762  tail sheath protein  55.56 
 
 		 585 aa  318  7.999999999999999e-86  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00265038  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4383  tail sheath protein  53.67 
 
 		 544 aa  313  2.9999999999999996e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.35186 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3816  tail sheath protein  54.04 
 
 		 522 aa  311  1e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.414451  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5391  tail sheath protein  53.87 
 
 		 514 aa  310  2.9999999999999997e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1657  phage tail sheath protein  52.25 
 
 		 521 aa  308  1.0000000000000001e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.713042  normal  0.0422731 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2823  tail sheath protein  51.56 
 
 		 521 aa  305  8.000000000000001e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.43909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2938  tail sheath protein  53.74 
 
 		 509 aa  304  2.0000000000000002e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316264  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2260  tail sheath protein  53.15 
 
 		 521 aa  302  5.000000000000001e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0965214  hitchhiker  0.000887123 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1899  tail sheath protein  52.28 
 
 		 518 aa  301  2e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0131499  normal  0.0166431 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0932  phage tail sheath protein  52.82 
 
 		 512 aa  299  5e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1424  tail sheath protein  50 
 
 		 522 aa  284  1.0000000000000001e-75  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1960  tail sheath protein  47.4 
 
 		 1117 aa  284  2.0000000000000002e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.221062  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26520  phage tail sheath protein FI  48.32 
 
 		 522 aa  280  3e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.849261  normal  0.473283 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1059  tail sheath protein  48.99 
 
 		 521 aa  279  5e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1501  tail sheath protein  48.75 
 
 		 514 aa  273  4.0000000000000004e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1874  Phage tail sheath protein  47.67 
 
 		 599 aa  271  2e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0804  tail sheath protein  47.47 
 
 		 551 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.518886 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3036  tail sheath protein  50.56 
 
 		 596 aa  256  4e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00018204 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1882  tail sheath protein  46.86 
 
 		 724 aa  251  2e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.138498  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3660  tail sheath protein  44.87 
 
 		 585 aa  247  2e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0242469  hitchhiker  0.00259723 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4342  hypothetical protein  45.79 
 
 		 821 aa  245  8e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161782  normal  0.0681295 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1731  tail sheath protein  45.21 
 
 		 569 aa  243  6e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000563063 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4249  phage tail sheath protein FI  37.06 
 
 		 402 aa  229  5e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.408866  normal  0.264788 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1128  Phage tail sheath protein  41.9 
 
 		 638 aa  211  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5257  tail sheath protein  31.9 
 
 		 465 aa  193  5e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3512  hypothetical protein  32.55 
 
 		 394 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.222517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1758  phage tail sheath protein  37.88 
 
 		 524 aa  187  3e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53821 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1687  hypothetical protein  30.75 
 
 		 478 aa  187  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1958  tail sheath protein  41.41 
 
 		 686 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0863  phage tail sheath protein  37.1 
 
 		 542 aa  183  5.0000000000000004e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00698739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1505  tail sheath protein  38.19 
 
 		 522 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1824  tail sheath protein  40.42 
 
 		 690 aa  178  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.414219  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3815  phage tail sheath protein  34.7 
 
 		 509 aa  177  3e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1038  hypothetical protein  30.18 
 
 		 470 aa  176  6e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0931  hypothetical protein  35.14 
 
 		 509 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.229261  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1889  hypothetical protein  35.14 
 
 		 509 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0540146  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2564  hypothetical protein  35.23 
 
 		 781 aa  172  7.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00387686  hitchhiker  0.000000000127886 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1827  phage tail sheath protein  37.14 
 
 		 802 aa  168  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3614  putative phage tail sheath protein FI  47.59 
 
 		 649 aa  168  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000782439 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0845  Phage tail sheath protein FI-like protein  35.98 
 
 		 740 aa  163  4.0000000000000004e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0655  Phage tail sheath protein FI-like protein  36.59 
 
 		 740 aa  163  5.0000000000000005e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3150  Phage tail sheath protein FI-like protein  46.52 
 
 		 700 aa  162  8.000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.81782  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4344  hypothetical protein  42.86 
 
 		 734 aa  162  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.500109  normal  0.105188 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2545  hypothetical protein  30.88 
 
 		 479 aa  162  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0674  putative phage tail sheath protein FI  46.88 
 
 		 697 aa  159  6e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0832  phage tail sheath protein  34.6 
 
 		 644 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3922  hypothetical protein  43.62 
 
 		 500 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000725372  hitchhiker  0.00401697 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1074  hypothetical protein  40.31 
 
 		 498 aa  136  6.0000000000000005e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0373  hypothetical protein  43.33 
 
 		 522 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0681  hypothetical protein  41.11 
 
 		 517 aa  133  6e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.533709  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3007  hypothetical protein  38.26 
 
 		 517 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2466  hypothetical protein  41.08 
 
 		 497 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.424352 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0897  hypothetical protein  24.17 
 
 		 499 aa  125  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.776782 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1041  hypothetical protein  24.17 
 
 		 499 aa  125  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1284  phage tail sheath protein  26.96 
 
 		 405 aa  108  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.326393 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3396  major tail sheath protein  25.44 
 
 		 387 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1158  tail sheath protein  25.12 
 
 		 392 aa  95.5  1e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0397  contractile tail sheath protein  25.36 
 
 		 392 aa  94  4e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.503837  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1136  contractile tail sheath protein  25.36 
 
 		 392 aa  94  4e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1630  phage tail sheath protein  25.18 
 
 		 398 aa  94.4  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1565  tail sheath protein  23.85 
 
 		 475 aa  93.6  6e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4040  tail sheath protein  24.56 
 
 		 388 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000103463 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0747  hypothetical protein  29.36 
 
 		 474 aa  90.5  5e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.346029  normal  0.109528 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08070  putative phage tail sheath protein  26.3 
 
 		 386 aa  90.1  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000271691  hitchhiker  0.000268611 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3059  pyocin R2_PP, tail sheath protein  23.81 
 
 		 388 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.181813 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3308  phage tail sheath protein  23.4 
 
 		 391 aa  88.6  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0738809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0765  phage tail sheath protein  25.5 
 
 		 386 aa  87  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0887  tail sheath protein  24.94 
 
 		 400 aa  84.7  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2897  tail sheath protein  26.76 
 
 		 475 aa  83.2  0.000000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4345  phage tail sheath protein  24.38 
 
 		 396 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0327685 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1860  phage tail sheath protein  23.04 
 
 		 389 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1212  tail sheath protein  24.06 
 
 		 388 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.562456  hitchhiker  0.00316448 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3482  phage tail sheath protein  24.38 
 
 		 395 aa  81.3  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.345078  normal  0.101066 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1918  phage tail sheath-like protein  24.76 
 
 		 391 aa  80.5  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.947366 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3192  tail sheath protein  22.31 
 
 		 389 aa  79  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3030  phage tail sheath protein  23.63 
 
 		 396 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296103 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0695  Phage tail sheath protein  24.02 
 
 		 391 aa  76.6  0.0000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1815  tail sheath protein  23.25 
 
 		 389 aa  76.6  0.0000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0447536  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4383  phage tail sheath protein  24.26 
 
 		 395 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.301789  hitchhiker  0.000355682 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2493  major tail sheath protein  23.36 
 
 		 390 aa  75.1  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0942  major tail sheath protein  23.11 
 
 		 390 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2756  tail sheath protein  23.11 
 
 		 390 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000512477 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2099  tail sheath protein  22.69 
 
 		 389 aa  73.6  0.000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2664  tail sheath protein  24.32 
 
 		 397 aa  73.6  0.000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2848  major tail sheath protein  23.77 
 
 		 390 aa  72.8  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2919  prophage MuMc02, tail sheath protein, putative  25.83 
 
 		 485 aa  71.6  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2213  major tail sheath protein  31.55 
 
 		 501 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3031  major tail sheath protein  23.77 
 
 		 390 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023583 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1331  Phage tail sheath protein  23.12 
 
 		 390 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2347  tail sheath protein  22.79 
 
 		 391 aa  71.2  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2895  tail sheath protein  23.19 
 
 		 389 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.736844 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2592  tail sheath protein  23.96 
 
 		 397 aa  69.3  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.290828  hitchhiker  0.0000000176032 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2626  tail sheath protein  23.96 
 
 		 397 aa  69.3  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129054  hitchhiker  0.000000715616 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2187  tail sheath protein  22.5 
 
 		 389 aa  67.4  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2300  tail sheath protein  26.86 
 
 		 389 aa  64.7  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37400  Phage P2 tail sheath FI-like protein  22 
 
 		 396 aa  64.7  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>