117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2260 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1899  tail sheath protein  67.37 
 
 
518 aa  696    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0131499  normal  0.0166431 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2260  tail sheath protein  100 
 
 
521 aa  1058    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0965214  hitchhiker  0.000887123 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2938  tail sheath protein  60.31 
 
 
509 aa  640    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316264  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5391  tail sheath protein  67.75 
 
 
514 aa  722    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4383  tail sheath protein  58.73 
 
 
544 aa  629  1e-179  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.35186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0932  phage tail sheath protein  59.01 
 
 
512 aa  605  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3816  tail sheath protein  58.19 
 
 
522 aa  587  1e-166  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.414451  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1657  phage tail sheath protein  51.98 
 
 
521 aa  513  1e-144  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.713042  normal  0.0422731 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2823  tail sheath protein  53.18 
 
 
521 aa  508  1e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.43909  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1424  tail sheath protein  47.84 
 
 
522 aa  471  1.0000000000000001e-131  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26520  phage tail sheath protein FI  46.89 
 
 
522 aa  459  9.999999999999999e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.849261  normal  0.473283 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1059  tail sheath protein  45.09 
 
 
521 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0804  tail sheath protein  41.92 
 
 
551 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.518886 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1501  tail sheath protein  39.29 
 
 
514 aa  384  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1731  tail sheath protein  40.46 
 
 
569 aa  359  5e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000563063 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0975  phage tail sheath protein, putative  53.45 
 
 
660 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3656  tail sheath protein  53.15 
 
 
401 aa  302  1e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.175288  normal  0.0120421 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0762  tail sheath protein  50.71 
 
 
585 aa  297  3e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00265038  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2896  phage tail sheath protein FI  49.52 
 
 
405 aa  286  7e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.929294  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0931  hypothetical protein  34.59 
 
 
509 aa  281  2e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.229261  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1889  hypothetical protein  34.59 
 
 
509 aa  281  2e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0540146  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3815  phage tail sheath protein  34.97 
 
 
509 aa  280  4e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1960  tail sheath protein  48.68 
 
 
1117 aa  276  5e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.221062  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3036  tail sheath protein  52.88 
 
 
596 aa  275  1.0000000000000001e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00018204 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1758  phage tail sheath protein  35.14 
 
 
524 aa  274  3e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.53821 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1882  tail sheath protein  45.81 
 
 
724 aa  273  5.000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.138498  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3660  tail sheath protein  32.48 
 
 
585 aa  273  8.000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0242469  hitchhiker  0.00259723 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1874  Phage tail sheath protein  48.29 
 
 
599 aa  267  2.9999999999999995e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4249  phage tail sheath protein FI  47.45 
 
 
402 aa  261  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.408866  normal  0.264788 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0863  phage tail sheath protein  32.56 
 
 
542 aa  256  8e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00698739  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1505  tail sheath protein  34.75 
 
 
522 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4342  hypothetical protein  44.26 
 
 
821 aa  242  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161782  normal  0.0681295 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1560  tail sheath protein  47.75 
 
 
405 aa  239  5.999999999999999e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0705385 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1128  Phage tail sheath protein  40.21 
 
 
638 aa  199  7.999999999999999e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1824  tail sheath protein  39.8 
 
 
690 aa  199  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.414219  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1958  tail sheath protein  42.46 
 
 
686 aa  192  2e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0832  phage tail sheath protein  34.27 
 
 
644 aa  188  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3614  putative phage tail sheath protein FI  46.31 
 
 
649 aa  179  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000782439 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2564  hypothetical protein  38.49 
 
 
781 aa  177  6e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00387686  hitchhiker  0.000000000127886 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1827  phage tail sheath protein  41.15 
 
 
802 aa  176  7e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1038  hypothetical protein  35.17 
 
 
470 aa  174  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1687  hypothetical protein  34.62 
 
 
478 aa  171  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0655  Phage tail sheath protein FI-like protein  33.25 
 
 
740 aa  167  5e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4344  hypothetical protein  39.22 
 
 
734 aa  167  5.9999999999999996e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.500109  normal  0.105188 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0845  Phage tail sheath protein FI-like protein  33.89 
 
 
740 aa  166  6.9999999999999995e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3150  Phage tail sheath protein FI-like protein  47.85 
 
 
700 aa  164  4.0000000000000004e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.81782  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5257  tail sheath protein  48.39 
 
 
465 aa  163  8.000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0674  putative phage tail sheath protein FI  45.5 
 
 
697 aa  161  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3512  hypothetical protein  35.44 
 
 
394 aa  150  4e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.222517  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2545  hypothetical protein  33.33 
 
 
479 aa  146  8.000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1074  hypothetical protein  43.98 
 
 
498 aa  145  2e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3922  hypothetical protein  40.96 
 
 
500 aa  139  8.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000725372  hitchhiker  0.00401697 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0373  hypothetical protein  43.01 
 
 
522 aa  136  9e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2466  hypothetical protein  42.39 
 
 
497 aa  134  3e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.424352 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3007  hypothetical protein  39.2 
 
 
517 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0681  hypothetical protein  38.19 
 
 
517 aa  127  7e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.533709  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0897  hypothetical protein  33.51 
 
 
499 aa  111  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.776782 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1041  hypothetical protein  33.51 
 
 
499 aa  111  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2919  prophage MuMc02, tail sheath protein, putative  29.25 
 
 
485 aa  92.8  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2897  tail sheath protein  27.97 
 
 
475 aa  84  0.000000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08070  putative phage tail sheath protein  28.43 
 
 
386 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000271691  hitchhiker  0.000268611 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2515  hypothetical protein  25.24 
 
 
518 aa  82.8  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.874334  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1565  tail sheath protein  27.97 
 
 
475 aa  82.8  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1284  phage tail sheath protein  32.66 
 
 
405 aa  79.7  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.326393 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1860  phage tail sheath protein  28.37 
 
 
389 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0765  phage tail sheath protein  27.98 
 
 
386 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4554  phage tail sheath protein  27.2 
 
 
475 aa  75.1  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00163736  normal  0.433622 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4553  phage tail sheath protein  27.2 
 
 
475 aa  74.7  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.558981 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4469  phage tail sheath protein  26.71 
 
 
475 aa  74.7  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1630  phage tail sheath protein  28.85 
 
 
398 aa  73.2  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3396  major tail sheath protein  29.69 
 
 
387 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0747  hypothetical protein  32.04 
 
 
474 aa  71.6  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.346029  normal  0.109528 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1212  tail sheath protein  28.22 
 
 
388 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.562456  hitchhiker  0.00316448 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2213  major tail sheath protein  26.67 
 
 
501 aa  67.4  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4040  tail sheath protein  26.75 
 
 
388 aa  67  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000103463 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1158  tail sheath protein  29.28 
 
 
392 aa  67  0.0000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0397  contractile tail sheath protein  29.02 
 
 
392 aa  67  0.0000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.503837  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1136  contractile tail sheath protein  29.02 
 
 
392 aa  67  0.0000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3059  pyocin R2_PP, tail sheath protein  27.1 
 
 
388 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.181813 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3038  hypothetical protein  27.23 
 
 
534 aa  65.1  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000011603 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2664  tail sheath protein  24.93 
 
 
397 aa  64.7  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0887  tail sheath protein  28.33 
 
 
400 aa  63.2  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37400  Phage P2 tail sheath FI-like protein  27.18 
 
 
396 aa  63.2  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1918  phage tail sheath-like protein  26.67 
 
 
391 aa  61.6  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.947366 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2493  major tail sheath protein  25 
 
 
390 aa  60.8  0.00000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2756  tail sheath protein  24.52 
 
 
390 aa  60.5  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000512477 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0942  major tail sheath protein  24.52 
 
 
390 aa  60.1  0.00000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0695  Phage tail sheath protein  24.62 
 
 
391 aa  59.3  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2592  tail sheath protein  24.04 
 
 
397 aa  58.9  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.290828  hitchhiker  0.0000000176032 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2626  tail sheath protein  24.04 
 
 
397 aa  58.9  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129054  hitchhiker  0.000000715616 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2895  tail sheath protein  27.86 
 
 
389 aa  58.2  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.736844 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2848  major tail sheath protein  24.52 
 
 
390 aa  57  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3031  major tail sheath protein  24.52 
 
 
390 aa  57.4  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0023583 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01344  phage tail sheath protein  24.87 
 
 
388 aa  56.6  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.473608  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1815  tail sheath protein  23.67 
 
 
389 aa  56.6  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0447536  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4345  phage tail sheath protein  24.41 
 
 
396 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0327685 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4383  phage tail sheath protein  23.94 
 
 
395 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.301789  hitchhiker  0.000355682 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0863  tail sheath protein  24.51 
 
 
389 aa  55.5  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.360153  hitchhiker  0.00380861 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2378  phage tail sheath protein  25.51 
 
 
478 aa  54.3  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3192  tail sheath protein  23.19 
 
 
389 aa  53.1  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>