70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0373 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0373  hypothetical protein  100 
 
 		 522 aa  1078    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0681  hypothetical protein  65.33 
 
 		 517 aa  698    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.533709  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3007  hypothetical protein  65.33 
 
 		 517 aa  701    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3922  hypothetical protein  48.59 
 
 		 500 aa  466  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000725372  hitchhiker  0.00401697 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2466  hypothetical protein  45.78 
 
 		 497 aa  431  1e-119  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.424352 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1074  hypothetical protein  44.23 
 
 		 498 aa  417  9.999999999999999e-116  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1687  hypothetical protein  40.68 
 
 		 478 aa  354  2.9999999999999997e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2545  hypothetical protein  39.36 
 
 		 479 aa  332  8e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1038  hypothetical protein  39.26 
 
 		 470 aa  328  1.0000000000000001e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5257  tail sheath protein  34.16 
 
 		 465 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3614  putative phage tail sheath protein FI  52.47 
 
 		 649 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000782439 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3150  Phage tail sheath protein FI-like protein  50.2 
 
 		 700 aa  232  1e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.81782  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0674  putative phage tail sheath protein FI  50.72 
 
 		 697 aa  216  9.999999999999999e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3512  hypothetical protein  51.38 
 
 		 394 aa  194  3e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.222517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1041  hypothetical protein  28.98 
 
 		 499 aa  193  7e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0897  hypothetical protein  28.98 
 
 		 499 aa  193  7e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.776782 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0975  phage tail sheath protein, putative  45.16 
 
 		 660 aa  150  7e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0762  tail sheath protein  39.11 
 
 		 585 aa  147  5e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00265038  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1424  tail sheath protein  43.39 
 
 		 522 aa  146  9e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26520  phage tail sheath protein FI  42.86 
 
 		 522 aa  145  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.849261  normal  0.473283 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2564  hypothetical protein  38.16 
 
 		 781 aa  144  3e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00387686  hitchhiker  0.000000000127886 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1059  tail sheath protein  41.27 
 
 		 521 aa  143  7e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1560  tail sheath protein  43.55 
 
 		 405 aa  143  8e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0705385 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0804  tail sheath protein  41.18 
 
 		 551 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.518886 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1128  Phage tail sheath protein  38.86 
 
 		 638 aa  136  9e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2260  tail sheath protein  43.01 
 
 		 521 aa  135  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0965214  hitchhiker  0.000887123 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1824  tail sheath protein  38.02 
 
 		 690 aa  136  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.414219  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3656  tail sheath protein  43.33 
 
 		 401 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.175288  normal  0.0120421 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1657  phage tail sheath protein  40.86 
 
 		 521 aa  134  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.713042  normal  0.0422731 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2823  tail sheath protein  40.86 
 
 		 521 aa  134  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.43909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1874  Phage tail sheath protein  40.88 
 
 		 599 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2896  phage tail sheath protein FI  41.3 
 
 		 405 aa  134  5e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.929294  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1501  tail sheath protein  28.17 
 
 		 514 aa  134  6e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1899  tail sheath protein  42.7 
 
 		 518 aa  133  6e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0131499  normal  0.0166431 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1882  tail sheath protein  41.15 
 
 		 724 aa  133  7.999999999999999e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.138498  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1731  tail sheath protein  40.96 
 
 		 569 aa  133  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000563063 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5391  tail sheath protein  40.86 
 
 		 514 aa  131  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4383  tail sheath protein  26.11 
 
 		 544 aa  131  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.35186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0932  phage tail sheath protein  41.08 
 
 		 512 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3816  tail sheath protein  40.86 
 
 		 522 aa  130  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.414451  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2938  tail sheath protein  39.78 
 
 		 509 aa  124  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316264  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1758  phage tail sheath protein  35.27 
 
 		 524 aa  121  3e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53821 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1505  tail sheath protein  36.08 
 
 		 522 aa  121  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0863  phage tail sheath protein  35.26 
 
 		 542 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00698739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3036  tail sheath protein  35.75 
 
 		 596 aa  117  6e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00018204 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1960  tail sheath protein  37.02 
 
 		 1117 aa  113  7.000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.221062  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0832  phage tail sheath protein  37.77 
 
 		 644 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4342  hypothetical protein  34.02 
 
 		 821 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161782  normal  0.0681295 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3660  tail sheath protein  34.57 
 
 		 585 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0242469  hitchhiker  0.00259723 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1827  phage tail sheath protein  31.17 
 
 		 802 aa  107  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4249  phage tail sheath protein FI  38.1 
 
 		 402 aa  97.1  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.408866  normal  0.264788 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1958  tail sheath protein  33.51 
 
 		 686 aa  92  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1889  hypothetical protein  32.64 
 
 		 509 aa  89  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0540146  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3815  phage tail sheath protein  33.16 
 
 		 509 aa  89.4  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0931  hypothetical protein  32.64 
 
 		 509 aa  89  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.229261  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4344  hypothetical protein  33.53 
 
 		 734 aa  83.6  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.500109  normal  0.105188 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0845  Phage tail sheath protein FI-like protein  26.29 
 
 		 740 aa  61.6  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0655  Phage tail sheath protein FI-like protein  25.91 
 
 		 740 aa  61.2  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0747  hypothetical protein  27.15 
 
 		 474 aa  51.2  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.346029  normal  0.109528 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1284  phage tail sheath protein  23.2 
 
 		 405 aa  49.7  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.326393 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0887  tail sheath protein  27.46 
 
 		 400 aa  49.7  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0765  phage tail sheath protein  26.09 
 
 		 386 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08070  putative phage tail sheath protein  25.36 
 
 		 386 aa  47.8  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000271691  hitchhiker  0.000268611 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2897  tail sheath protein  28.57 
 
 		 475 aa  45.1  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1212  tail sheath protein  27.12 
 
 		 388 aa  45.4  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.562456  hitchhiker  0.00316448 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1565  tail sheath protein  28.57 
 
 		 475 aa  45.1  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4040  tail sheath protein  24.82 
 
 		 388 aa  44.7  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000103463 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0691  Phage tail sheath protein FI-like protein  27.27 
 
 		 485 aa  44.3  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2919  prophage MuMc02, tail sheath protein, putative  22.4 
 
 		 485 aa  43.9  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1860  phage tail sheath protein  22.3 
 
 		 389 aa  43.5  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>